Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11537
• Subject: XM_006513102.2
• Aligned Length: 2552
• Identities: 2116
• Gaps: 124

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCATGTATGTTTTAAAGGAAATGTGTCATCCCTATGGCCCAGAGCTCTTGACCAAGGTGACAGCAGTTCCAG  74

Query    1  -------------ATGTCT------------TCCACGGG------GCA-----CCCTGGCTCCT-ACAAAATAT  37
                         ||||||            |.|| |||      |||     |||.||.||.| ||     ||
Sbjct   75  GAAGACAGCCACTATGTCTCTGAGCAGTGCCTTCA-GGGCTGTGAGCAACGACCCCCGGATCATCAC-----AT  142

Query   38  GGGGA---GAGAAAATGGAGCTGGCGCTGGTGCCTGTGAGCGCCCACGGCAACTTCTATGAGGGGGACTGCTAC  108
            ||.||   ||||||||||||||||||||||||||..||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  143  GGAGAATTGAGAAAATGGAGCTGGCGCTGGTGCCCCTGAGTGCTCACGGCAACTTCTACGAGGGAGACTGCTAC  216

Query  109  GTCATCCTCTCGACCCGGAGAGTGGCCAGTCTCCTATCCCAGGACATCCACTTCTGGATCGGGAAGGACTCCTC  182
            .||.|||||||||||||||||||||.|||.||.||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  217  ATCGTCCTCTCGACCCGGAGAGTGGGCAGCCTTCTCTCCCAGAACATCCACTTTTGGATCGGGAAGGACTCCTC  290

Query  183  CCAGGATGAGCAAAGCTGCGCAGCCATATATACCACACAGCTGGACGACTACCTGGGAGGCAGCCCTGTGCAGC  256
            ||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  291  CCAGGACGAGCAGAGCTGCGCGGCCATCTATACCACACAGCTGGATGACTACCTGGGAGGCAGCCCGGTGCAGC  364

Query  257  ACCGAGAGGTCCAGTACCATGAGTCAGACACTTTCCGTGGCTACTTCAAGCAGGGCATCATCTACAAGCAGGGG  330
            ||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||
Sbjct  365  ACCGTGAGGTCCAGTACCACGAGTCCGACACCTTCCGTGGCTACTTCAAGCAGGGCATCATCTATAAAAAGGGG  438

Query  331  GGTGTCGCCTCTGGGATGAAGCACGTGGAGACCAATACCTACGACGTGAAGCGGCTGCTACATGTGAAAGGGAA  404
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||.||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  439  GGTGTGGCCTCTGGGATGAAGCACGTGGAGACCAACACCTATGATGTGAAGAGGCTGCTACACGTAAAGGGGAA  512

Query  405  AAGAAACATCAGGGCTACCGAGGTGGAAATGAGCTGGGACAGTTTCAACCGAGGTGATGTCTTCTTGCTGGACC  478
            ||||||||||...||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct  513  AAGAAACATCCAAGCCACGGAGGTGGAAATGAGCTGGGACAGCTTTAACCGAGGCGATGTCTTCCTGCTGGACC  586

Query  479  TTGGGAAAGTCATCATCCAATGGAATGGCCCAGAGAGCAACAGTGGGGAGCGCCTGAAGGCTATGCTTCTGGCA  552
            ||||||..|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  587  TTGGGATGGTCATCATCCAGTGGAATGGCCCGGAGAGCAACAGTGGGGAACGTCTCAAGGCTATGCTTCTGGCA  660

Query  553  AAGGATATTCGAGACAGGGAGCGAGGGGGCCGTGCTGAAATAGGAGTGATCGAGGGAGACAAGGAGGCAGCCAG  626
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  661  AAGGACATTCGGGACAGGGAGCGAGGGGGCCGTGCTGAAATTGGGGTGATTGAGGGAGACAAGGAGGCGGCCAG  734

Query  627  CCCAGAGCTGATGAAGGTCCTTCAGGACACCCTTGGCCGACGCTCCATTATCAAGCCTACAGTCCCTGATGAGA  700
            |||||.||||||||..|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||.||||..|||||||||
Sbjct  735  CCCAGGGCTGATGACAGTCCTCCAGGATACCCTTGGTCGACGCTCCATGATAAAGCCTGCAGTTTCTGATGAGA  808

Query  701  TCATAGATCAGAAGCAGAAATCAACTATCATGTTGTATCATATCTCAGATTCAGCTGGGCAGCTGGCAGTCACA  774
            ||||.||.||..|.||||||||||.|||||||||.||||||.||||.||..||||||||||||||.||||||||
Sbjct  809  TCATGGACCAACAACAGAAATCAAGTATCATGTTATATCATGTCTCCGACACAGCTGGGCAGCTGTCAGTCACA  882

Query  775  GAGGTAGCAACAAGGCCTCTGGTCCAGGACTTACTGAACCATGATGACTGCTACATCCTGGACCAAAGTGGAAC  848
            |||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  883  GAGGTGGCAACAAGGCCCCTGGTCCAGGACCTACTGAACCACGATGACTGCTACATCCTGGACCAAAGTGGCAC  956

Query  849  CAAAATCTACGTGTGGAAAGGAAAAGGAGCCACAAAGGCTGAAAAACAGGCAGCCATGTCTAAAGCGCTGGGCT  922
            |||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||.|||.||||||||.||||||||.|||||.||||..|
Sbjct  957  CAAGATCTACGTGTGGAAAGGCAAAGGAGCCACCAAGGTTGAGAAACAGGCGGCCATGTCCAAAGCCCTGGATT  1030

Query  923  TCATCAAGATGAAGAGCTACCCCAGCAGCACCAATGTGGAGACCGTCAACGATGGTGCTGAGTCGGCCATGTTC  996
            ||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1031  TCATCAAGATGAAGGGATACCCCAGCAGCACCAACGTGGAGACCGTCAACGATGGCGCAGAGTCGGCCATGTTC  1104

Query  997  AAGCAGCTGTTCCAGAAGTGGTCAGTAAAGGACCAGACCATGGGCCTGGGGAAAACGTTCAGCATTGGTAAAAT  1070
            ||.|||.||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.||||.|||||||||..|||||||.|||||||||
Sbjct 1105  AAACAGTTGTTCCAGAAATGGTCGGTGAAGGACCAGACCACGGGCTTGGGGAAAATATTCAGCACTGGTAAAAT  1178

Query 1071  TGCTAAAGTTTTCCAGGATAAATTTGATGTGACTCTGCTACACACCAAGCCAGAGGTAGCTGCCCAGGAAAGAA  1144
            .||||||.|.||||||||.||.||.||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1179  CGCTAAAATCTTCCAGGACAAGTTCGATGTGTCTCTGCTACACACCAAGCCAGAAGTGGCTGCACAGGAGAGAA  1252

Query 1145  TGGTCGATGATGGCAACGGAAAAGTTGAGGTCTGGAGAATTGAGAACCTGGAGCTGGTCCCTGTGGAGTATCAA  1218
            ||||.||.||.|||||.||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.
Sbjct 1253  TGGTGGACGACGGCAAAGGCCAGGTTGAGGTCTGGAGAATTGAGAACCTGGAGCTGGTCCCCGTGGAATACCAG  1326

Query 1219  TGGTATGGCTTCTTTTATGGGGGAGACTGTTATCTGGTCCTCTACACATACGAGGTAAATGGGAAGCCACATCA  1292
            |||.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||.|
Sbjct 1327  TGGCATGGCTTCTTCTACGGGGGAGACTGCTATCTGGTTCTCTACACGTACGATGTGAACGGGAAACCCCATTA  1400

Query 1293  CATCTTGTACATCTGGCAGGGCCGCCACGCCTCACAGGATGAGCTGGCAGCCTCAGCATACCAGGCAGTGGAGG  1366
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.|||||||||||||||||||||.||.|.|||||||||||
Sbjct 1401  CATCTTGTACATCTGGCAGGGCCGCCACGCATCCCGGGATGAGCTGGCAGCCTCAGCCTATCGGGCAGTGGAGG  1474

Query 1367  TGGATCGGCAGTTTGATGGGGCTGCTGTGCAGGTTCGAGTCAGGATGGGAACGGAGCCACGCCACTTCATGGCC  1440
            ||||||.||||||||||||.||..||||||||||.||.||.||.|||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1475  TGGATCAGCAGTTTGATGGAGCCCCTGTGCAGGTCCGGGTTAGCATGGGGAAGGAGCCACGCCACTTCATGGCC  1548

Query 1441  ATCTTCAAAGGGAAGCTAGTTATCTTTGAGGGTGGGACTTCCAGGAAGGGAAATGCCGAGCCTGACCCTCCAGT  1514
            |||||||||||.|||||.|||||||..|||||.||||||||||||||||||||.|..|||||.|||||||||||
Sbjct 1549  ATCTTCAAAGGAAAGCTGGTTATCTACGAGGGCGGGACTTCCAGGAAGGGAAACGAGGAGCCGGACCCTCCAGT  1622

Query 1515  AAGACTCTTCCAAATTCATGGAAATGACAAATCTAACACCAAAGCAGTGGAAGTTCCAGCCTTTGCCTCCTCCC  1588
            |||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||..|.||||.|||.|||||.|
Sbjct 1623  AAGGCTCTTCCAGATCCACGGGAACGACAAATCCAACACCAAAGCAGTGGAGGTCTCGGCCTCTGCTTCCTCGC  1696

Query 1589  TAAACTCCAATGATGTCTTTCTGCTGCGAACTCAGGCAGAGCACTACCTGTGGTATGGCAAGGGGTCTAGTGGG  1662
            |.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1697  TCAACTCCAACGACGTCTTTCTGCTGCGGACTCAGGCAGAGCACTACCTGTGGTACGGCAAGGGGTCTAGTGGG  1770

Query 1663  GATGAGCGGGCAATGGCTAAGGAGCTGGCCAGCCTTCTCTGTGATGGCAGCGAGAACACTGTGGCCGAGGGCCA  1736
            ||.||||||||.||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||..|.|.||||||||||.||||||||
Sbjct 1771  GACGAGCGGGCGATGGCTAAGGAGCTGGTCGACCTTCTCTGTGATGGCAATGCGGACACTGTGGCTGAGGGCCA  1844

Query 1737  GGAGCCAGCCGAGTTCTGGGACCTACTGGGAGGGAAAACTCCCTATGCCAATGATAAAAGACTTCAGCAGGAAA  1810
            |||||||.|.||||||||||||||.||||||||.|||||..||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct 1845  GGAGCCACCTGAGTTCTGGGACCTTCTGGGAGGAAAAACAGCCTACGCTAATGACAAAAGGCTGCAGCAAGAAA  1918

Query 1811  TCCTAGATGTCCA-GTCTCGTCTCTTTGAATGTTCCAATAAGACCGGCCAATTCGTTGTCACTGAGATCACAGA  1883
            .|||.||.||||| ||| ||.||||||||.||||||||||||||.||||..|||.||||.||.|||.||||.||
Sbjct 1919  CCCTGGACGTCCAGGTC-CGGCTCTTTGAGTGTTCCAATAAGACTGGCCGCTTCCTTGTTACGGAGGTCACGGA  1991

Query 1884  CTTCACCCAGGATGACCTGAACCCTACTGACGTGATGCTCCTAGATACCTGGGACCAGGTGTTCTTGTGGATTG  1957
            ||||||||||||.|||||||.|||...|||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1992  CTTCACCCAGGAGGACCTGAGCCCAGGTGATGTGATGCTTCTGGACACCTGGGACCAGGTGTTCTTGTGGATAG  2065

Query 1958  GGGCTGAGGCCAATGCCACGGAGAAGGAGAGTGCCCTTGCCACAGCACAGCAGTACCTGCACACTCACCCCAGC  2031
            |.||.|||||||||||||||||||||.||.|.|||||..|.||.||.|||.||||||||..|||.||.||.||.
Sbjct 2066  GAGCGGAGGCCAATGCCACGGAGAAGAAGGGGGCCCTCTCGACGGCTCAGGAGTACCTGGTCACACATCCTAGT  2139

Query 2032  GGCCGAGATCCCGACACACCAATCCTGATCATTAAGCAGGGGTTTGAGCCTCCCATCTTCACAGGCTGGTTCCT  2105
            ||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2140  GGCCGAGACCCCGACACACCGATTCTGATCATCAAACAGGGCTTTGAGCCCCCCACCTTCACAGGCTGGTTCCT  2213

Query 2106  AGCCTGGGACCCTAACATTTGGAGTGCAGGAAAAACATATGAACAATTAAAAGAA-GAGCTGGGAGATGCTGCT  2178
            .||.|||||||||.||||||||||.|.|||||||.|||||||.||..| |||||| ||||||||||||||..||
Sbjct 2214  GGCATGGGACCCTCACATTTGGAGCGAAGGAAAATCATATGAGCAGCT-AAAGAACGAGCTGGGAGATGCAACT  2286

Query 2179  GCTATCATGCGAATCACTGCTGACATGAAGAATGCAACCCTCTCCCTGAATTCTAATGACAGTGAGCCAAAATA  2252
            ||.||..||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|.|||||||.|||.||||.||||||||||.||
Sbjct 2287  GCCATTGTGCGAATCACCGCTGACATGAAGAACGCAACACTTTACCTGAATCCTAGTGACGGTGAGCCAAAGTA  2360

Query 2253  TTACCCTATAGCAGTTCTGTTGAAAAACCAGAATCAGGAGCTGCCTGAGGATGTAAACCCTGCCAAAAAGGAGA  2326
            .|||||..|.|.|||||||.|||||...|||||.||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||
Sbjct 2361  CTACCCGGTGGAAGTTCTGCTGAAAGGTCAGAACCAGGAGCTGCCTGAGGATGTGGACCCCGCCAAAAAGGAGA  2434

Query 2327  ATTACCTCTCTGAACAGGACTTTGTGTCTGTGTTTGGCATCACAAGAGGGCAATTTGCAGCTCTGCCTGGCTGG  2400
            |.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||..|.|||||||||||||||
Sbjct 2435  ACTACCTCTCGGAACAAGACTTTGTATCTGTGTTTGGCATCACGAGAGGGCAGTTCACTGCTCTGCCTGGCTGG  2508

Query 2401  AAACAGCTCCAAATGAAGAAAGAAAAGGGGCTTTTC  2436
            |||||||||||..||||||||||||.|||.||||||
Sbjct 2509  AAACAGCTCCAGCTGAAGAAAGAAAGGGGCCTTTTC  2544