Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11537
- Subject:
- XM_017018712.2
- Aligned Length:
- 2436
- Identities:
- 2387
- Gaps:
- 48
Alignment
Query 1 ATGTCTTCCACGGGGCACCCTGGCTCCTACAAAATATGGGGAGAGAAAATGGAGCTGGCGCTGGTGCCTGTGAG 74
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------ATGGAGCTGGCGCTGGTGCCTGTGAG 26
Query 75 CGCCCACGGCAACTTCTATGAGGGGGACTGCTACGTCATCCTCTCGACCCGGAGAGTGGCCAGTCTCCTATCCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27 CGCCCACGGCAACTTCTATGAGGGGGACTGCTACGTCATCCTCTCGACCCGGAGAGTGGCCAGTCTCCTATCCC 100
Query 149 AGGACATCCACTTCTGGATCGGGAAGGACTCCTCCCAGGATGAGCAAAGCTGCGCAGCCATATATACCACACAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 101 AGGACATCCACTTCTGGATCGGGAAGGACTCCTCCCAGGATGAGCAAAGCTGCGCAGCCATATATACCACACAG 174
Query 223 CTGGACGACTACCTGGGAGGCAGCCCTGTGCAGCACCGAGAGGTCCAGTACCATGAGTCAGACACTTTCCGTGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 CTGGACGACTACCTGGGAGGCAGCCCTGTGCAGCACCGAGAGGTCCAGTACCATGAGTCAGACACTTTCCGTGG 248
Query 297 CTACTTCAAGCAGGGCATCATCTACAAGCAGGGGGGTGTCGCCTCTGGGATGAAGCACGTGGAGACCAATACCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 249 CTACTTCAAGCAGGGCATCATCTACAAGCAGGGGGGTGTCGCCTCTGGGATGAAGCACGTGGAGACCAATACCT 322
Query 371 ACGACGTGAAGCGGCTGCTACATGTGAAAGGGAAAAGAAACATCAGGGCTACCGAGGTGGAAATGAGCTGGGAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 ACGACGTGAAGCGGCTGCTACATGTGAAAGGGAAAAGAAACATCAGGGCTACCGAGGTGGAAATGAGCTGGGAC 396
Query 445 AGTTTCAACCGAGGTGATGTCTTCTTGCTGGACCTTGGGAAAGTCATCATCCAATGGAATGGCCCAGAGAGCAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397 AGTTTCAACCGAGGTGATGTCTTCTTGCTGGACCTTGGGAAAGTCATCATCCAATGGAATGGCCCAGAGAGCAA 470
Query 519 CAGTGGGGAGCGCCTGAAGGCTATGCTTCTGGCAAAGGATATTCGAGACAGGGAGCGAGGGGGCCGTGCTGAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 471 CAGTGGGGAGCGCCTGAAGGCTATGCTTCTGGCAAAGGATATTCGAGACAGGGAGCGAGGGGGCCGTGCTAAAA 544
Query 593 TAGGAGTGATCGAGGGAGACAAGGAGGCAGCCAGCCCAGAGCTGATGAAGGTCCTTCAGGACACCCTTGGCCGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 545 TAGGAGTGATCGAGGGAGACAAGGAGGCAGCCAGCCCAGAGCTGATGAAGGTCCTTCAGGACACCCTTGGCCGA 618
Query 667 CGCTCCATTATCAAGCCTACAGTCCCTGATGAGATCATAGATCAGAAGCAGAAATCAACTATCATGTTGTATCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 619 CGCTCCATTATCAAGCCTACAGTCCCTGATGAGATCATAGATCAGAAGCAGAAATCAACTATCATGTTGTATCA 692
Query 741 TATCTCAGATTCAGCTGGGCAGCTGGCAGTCACAGAGGTAGCAACAAGGCCTCTGGTCCAGGACTTACTGAACC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 693 TATCTCAGATTCAGCTGGGCAGCTGGCAGTCACAGAGGTAGCAACAAGGCCTCTGGTCCAGGACTTACTGAACC 766
Query 815 ATGATGACTGCTACATCCTGGACCAAAGTGGAACCAAAATCTACGTGTGGAAAGGAAAAGGAGCCACAAAGGCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 767 ATGATGACTGCTACATCCTGGACCAAAGTGGAACCAAAATCTACGTGTGGAAAGGAAAAGGAGCCACAAAGGCT 840
Query 889 GAAAAACAGGCAGCCATGTCTAAAGCGCTGGGCTTCATCAAGATGAAGAGCTACCCCAGCAGCACCAATGTGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GAAAAACAGGCAGCCATGTCTAAAGCGCTGGGCTTCATCAAGATGAAGAGCTACCCCAGCAGCACCAATGTGGA 914
Query 963 GACCGTCAACGATGGTGCTGAGTCGGCCATGTTCAAGCAGCTGTTCCAGAAGTGGTCAGTAAAGGACCAGACCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 GACCGTCAACGATGGTGCTGAGTCGGCCATGTTCAAGCAGCTGTTCCAGAAGTGGTCAGTAAAGGACCAGACCA 988
Query 1037 TGGGCCTGGGGAAAACGTTCAGCATTGGTAAAATTGCTAAAGTTTTCCAGGATAAATTTGATGTGACTCTGCTA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 989 TGGGCCTGGGGAAAACGTTCAGCATTGGTAAAATTGCTAAAGTTTTCCAGGATAAATTTGATGTGACTCTGCTA 1062
Query 1111 CACACCAAGCCAGAGGTAGCTGCCCAGGAAAGAATGGTCGATGATGGCAACGGAAAAGTTGAGGTCTGGAGAAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063 CACACCAAGCCAGAGGTAGCTGCCCAGGAAAGAATGGTCGATGATGGCAACGGAAAAGTTGAGGTCTGGAGAAT 1136
Query 1185 TGAGAACCTGGAGCTGGTCCCTGTGGAGTATCAATGGTATGGCTTCTTTTATGGGGGAGACTGTTATCTGGTCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 TGAGAACCTGGAGCTGGTCCCTGTGGAGTATCAATGGTATGGCTTCTTTTATGGGGGAGACTGTTATCTGGTCC 1210
Query 1259 TCTACACATACGAGGTAAATGGGAAGCCACATCACATCTTGTACATCTGGCAGGGCCGCCACGCCTCACAGGAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211 TCTACACATACGAGGTAAATGGGAAGCCACATCACATCTTGTACATCTGGCAGGGCCGCCACGCCTCACAGGAT 1284
Query 1333 GAGCTGGCAGCCTCAGCATACCAGGCAGTGGAGGTGGATCGGCAGTTTGATGGGGCTGCTGTGCAGGTTCGAGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285 GAGCTGGCAGCCTCAGCATACCAGGCAGTGGAGGTGGATCGGCAGTTTGATGGGGCTGCTGTGCAGGTTCGAGT 1358
Query 1407 CAGGATGGGAACGGAGCCACGCCACTTCATGGCCATCTTCAAAGGGAAGCTAGTTATCTTTGAGGGTGGGACTT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359 CAGGATGGGAACGGAGCCACGCCACTTCATGGCCATCTTCAAAGGGAAGCTAGTTATCTTTGAGGGTGGGACTT 1432
Query 1481 CCAGGAAGGGAAATGCCGAGCCTGACCCTCCAGTAAGACTCTTCCAAATTCATGGAAATGACAAATCTAACACC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 CCAGGAAGGGAAATGCCGAGCCTGACCCTCCAGTAAGACTCTTCCAAATTCATGGAAATGACAAATCTAACACC 1506
Query 1555 AAAGCAGTGGAAGTTCCAGCCTTTGCCTCCTCCCTAAACTCCAATGATGTCTTTCTGCTGCGAACTCAGGCAGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1507 AAAGCAGTGGAAGTTCCAGCCTTTGCCTCCTCCCTAAACTCCAATGATGTCTTTCTGCTGCGAACTCAGGCAGA 1580
Query 1629 GCACTACCTGTGGTATGGCAAGGGGTCTAGTGGGGATGAGCGGGCAATGGCTAAGGAGCTGGCCAGCCTTCTCT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581 GCACTACCTGTGGTATGGCAAGGGGTCTAGTGGGGATGAGCGGGCAATGGCTAAGGAGCTGGCCAGCCTTCTCT 1654
Query 1703 GTGATGGCAGCGAGAACACTGTGGCCGAGGGCCAGGAGCCAGCCGAGTTCTGGGACCTACTGGGAGGGAAAACT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655 GTGATGGCAGCGAGAACACTGTGGCCGAGGGCCAGGAGCCAGCCGAGTTCTGGGACCTACTGGGAGGGAAAACT 1728
Query 1777 CCCTATGCCAATGATAAAAGACTTCAGCAGGAAATCCTAGATGTCCAGTCTCGTCTCTTTGAATGTTCCAATAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729 CCCTATGCCAATGATAAAAGACTTCAGCAGGAAATCCTAGATGTCCAGTCTCGTCTCTTTGAATGTTCCAATAA 1802
Query 1851 GACCGGCCAATTCGTTGTCACTGAGATCACAGACTTCACCCAGGATGACCTGAACCCTACTGACGTGATGCTCC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1803 GACCGGCCAATTCGTTGTCACTGAGATCACAGACTTCACCCAGGATGACCTGAACCCTACTGACGTGATGCTCC 1876
Query 1925 TAGATACCTGGGACCAGGTGTTCTTGTGGATTGGGGCTGAGGCCAATGCCACGGAGAAGGAGAGTGCCCTTGCC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877 TAGATACCTGGGACCAGGTGTTCTTGTGGATTGGGGCTGAGGCCAATGCCACGGAGAAGGAGAGTGCCCTTGCC 1950
Query 1999 ACAGCACAGCAGTACCTGCACACTCACCCCAGCGGCCGAGATCCCGACACACCAATCCTGATCATTAAGCAGGG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951 ACAGCACAGCAGTACCTGCACACTCACCCCAGCGGCCGAGATCCCGACACACCAATCCTGATCATTAAGCAGGG 2024
Query 2073 GTTTGAGCCTCCCATCTTCACAGGCTGGTTCCTAGCCTGGGACCCTAACATTTGGAGTGCAGGAAAAACATATG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2025 GTTTGAGCCTCCCATCTTCACAGGCTGGTTCCTAGCCTGGGACCCTAACATTTGGAGTGCAGGAAAAACATATG 2098
Query 2147 AACAATTAAAAGAAGAGCTGGGAGATGCTGCTGCTATCATGCGAATCACTGCTGACATGAAGAATGCAACCCTC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099 AACAATTAAAAGAAGAGCTGGGAGATGCTGCTGCTATCATGCGAATCACTGCTGACATGAAGAATGCAACCCTC 2172
Query 2221 TCCCTGAATTCTAATGACAGTGAGCCAAAATATTACCCTATAGCAGTTCTGTTGAAAAACCAGAATCAGGAGCT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2173 TCCCTGAATTCTAATGACAGTGAGCCAAAATATTACCCTATAGCAGTTCTGTTGAAAAACCAGAATCAGGAGCT 2246
Query 2295 GCCTGAGGATGTAAACCCTGCCAAAAAGGAGAATTACCTCTCTGAACAGGACTTTGTGTCTGTGTTTGGCATCA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2247 GCCTGAGGATGTAAACCCTGCCAAAAAGGAGAATTACCTCTCTGAACAGGACTTTGTGTCTGTGTTTGGCATCA 2320
Query 2369 CAAGAGGGCAATTTGCAGCTCTGCCTGGCTGGAAACAGCTCCAAATGAAGAAAGAAAAGGGGCTTTTC 2436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2321 CAAGAGGGCAATTTGCAGCTCTGCCTGGCTGGAAACAGCTCCAAATGAAGAAAGAAAAGGGGCTTTTC 2388