Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11537
- Subject:
- XM_017018714.2
- Aligned Length:
- 2440
- Identities:
- 1548
- Gaps:
- 884
Alignment
Query 1 ATGTCTTCCACGGGGCACCCTGGCTCCTACAAAATATGGGGAGAGAAAATGGAGCTGGCGCTGGTGCCTGTGAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGCCCACGGCAACTTCTATGAGGGGGACTGCTACGTCATCCTCTCGACCCGGAGAGTGGCCAGTCTCCTATCCC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGGACATCCACTTCTGGATCGGGAAGGACTCCTCCCAGGATGAGCAAAGCTGCGCAGCCATATATACCACACAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTGGACGACTACCTGGGAGGCAGCCCTGTGCAGCACCGAGAGGTCCAGTACCATGAGTCAGACACTTTCCGTGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CTACTTCAAGCAGGGCATCATCTACAAGCAGGGGGGTGTCGCCTCTGGGATGAAGCACGTGGAGACCAATACCT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ACGACGTGAAGCGGCTGCTACATGTGAAAGGGAAAAGAAACATCAGGGCTACCGAGGTGGAAATGAGCTGGGAC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 AGTTTCAACCGAGGTGATGTCTTCTTGCTGGACCTTGGGAAAGTCATCATCCAATGGAATGGCCCAGAGAGCAA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CAGTGGGGAGCGCCTGAAGGCTATGCTTCTGGCAAAGGATATTCGAGACAGGGAGCGAGGGGGCCGTGCTGAAA 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TAGGAGTGATCGAGGGAGACAAGGAGGCAGCCAGCCCAGAGCTGATGAAGGTCCTTCAGGACACCCTTGGCCGA 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 CGCTCCATTATCAAGCCTACAGTCCCTGATGAGATCATAGATCAGAAGCAGAAATCAACTATCATGTTGTATCA 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 TATCTCAGATTCAGCTGGGCAGCTGGCAGTCACAGAGGTAGCAACAAGGCCTCTGGTCCAGGACTTACTGAACC 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 ATGATGACTGCTACATCCTGGACCAAAGTGGAACCAAAATCTACGTGTGGAAAGGAAAAGGAGCCACAAAGGCT 888
|.|||.|| ||| |||..||| .||..||
Sbjct 1 -------------------------ATGTGCAA--------TAC-TGTTCAAA--------------TAATTCT 26
Query 889 GAAAAACAGGCAGCCATGTCTAA-AGCGCT---GGGCTTCATCAAGATGAAGAGCTACCCCAGCAGCACCAATG 958
| |||| |||.|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 27 G------------------CTAAGAGCACTTCAGGGCTTCATCAAGATGAAGAGCTACCCCAGCAGCACCAATG 82
Query 959 TGGAGACCGTCAACGATGGTGCTGAGTCGGCCATGTTCAAGCAGCTGTTCCAGAAGTGGTCAGTAAAGGACCAG 1032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 83 TGGAGACCGTCAACGATGGTGCTGAGTCGGCCATGTTCAAGCAGCTGTTCCAGAAGTGGTCAGTAAAGGACCAG 156
Query 1033 ACCATGGGCCTGGGGAAAACGTTCAGCATTGGTAAAATTGCTAAAGTTTTCCAGGATAAATTTGATGTGACTCT 1106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 ACCATGGGCCTGGGGAAAACGTTCAGCATTGGTAAAATTGCTAAAGTTTTCCAGGATAAATTTGATGTGACTCT 230
Query 1107 GCTACACACCAAGCCAGAGGTAGCTGCCCAGGAAAGAATGGTCGATGATGGCAACGGAAAAGTTGAGGTCTGGA 1180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231 GCTACACACCAAGCCAGAGGTAGCTGCCCAGGAAAGAATGGTCGATGATGGCAACGGAAAAGTTGAGGTCTGGA 304
Query 1181 GAATTGAGAACCTGGAGCTGGTCCCTGTGGAGTATCAATGGTATGGCTTCTTTTATGGGGGAGACTGTTATCTG 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 GAATTGAGAACCTGGAGCTGGTCCCTGTGGAGTATCAATGGTATGGCTTCTTTTATGGGGGAGACTGTTATCTG 378
Query 1255 GTCCTCTACACATACGAGGTAAATGGGAAGCCACATCACATCTTGTACATCTGGCAGGGCCGCCACGCCTCACA 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379 GTCCTCTACACATACGAGGTAAATGGGAAGCCACATCACATCTTGTACATCTGGCAGGGCCGCCACGCCTCACA 452
Query 1329 GGATGAGCTGGCAGCCTCAGCATACCAGGCAGTGGAGGTGGATCGGCAGTTTGATGGGGCTGCTGTGCAGGTTC 1402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 453 GGATGAGCTGGCAGCCTCAGCATACCAGGCAGTGGAGGTGGATCGGCAGTTTGATGGGGCTGCTGTGCAGGTTC 526
Query 1403 GAGTCAGGATGGGAACGGAGCCACGCCACTTCATGGCCATCTTCAAAGGGAAGCTAGTTATCTTTGAGGGTGGG 1476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 GAGTCAGGATGGGAACGGAGCCACGCCACTTCATGGCCATCTTCAAAGGGAAGCTAGTTATCTTTGAGGGTGGG 600
Query 1477 ACTTCCAGGAAGGGAAATGCCGAGCCTGACCCTCCAGTAAGACTCTTCCAAATTCATGGAAATGACAAATCTAA 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 ACTTCCAGGAAGGGAAATGCCGAGCCTGACCCTCCAGTAAGACTCTTCCAAATTCATGGAAATGACAAATCTAA 674
Query 1551 CACCAAAGCAGTGGAAGTTCCAGCCTTTGCCTCCTCCCTAAACTCCAATGATGTCTTTCTGCTGCGAACTCAGG 1624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 CACCAAAGCAGTGGAAGTTCCAGCCTTTGCCTCCTCCCTAAACTCCAATGATGTCTTTCTGCTGCGAACTCAGG 748
Query 1625 CAGAGCACTACCTGTGGTATGGCAAGGGGTCTAGTGGGGATGAGCGGGCAATGGCTAAGGAGCTGGCCAGCCTT 1698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749 CAGAGCACTACCTGTGGTATGGCAAGGGGTCTAGTGGGGATGAGCGGGCAATGGCTAAGGAGCTGGCCAGCCTT 822
Query 1699 CTCTGTGATGGCAGCGAGAACACTGTGGCCGAGGGCCAGGAGCCAGCCGAGTTCTGGGACCTACTGGGAGGGAA 1772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 CTCTGTGATGGCAGCGAGAACACTGTGGCCGAGGGCCAGGAGCCAGCCGAGTTCTGGGACCTACTGGGAGGGAA 896
Query 1773 AACTCCCTATGCCAATGATAAAAGACTTCAGCAGGAAATCCTAGATGTCCAGTCTCGTCTCTTTGAATGTTCCA 1846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 AACTCCCTATGCCAATGATAAAAGACTTCAGCAGGAAATCCTAGATGTCCAGTCTCGTCTCTTTGAATGTTCCA 970
Query 1847 ATAAGACCGGCCAATTCGTTGTCACTGAGATCACAGACTTCACCCAGGATGACCTGAACCCTACTGACGTGATG 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 971 ATAAGACCGGCCAATTCGTTGTCACTGAGATCACAGACTTCACCCAGGATGACCTGAACCCTACTGACGTGATG 1044
Query 1921 CTCCTAGATACCTGGGACCAGGTGTTCTTGTGGATTGGGGCTGAGGCCAATGCCACGGAGAAGGAGAGTGCCCT 1994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045 CTCCTAGATACCTGGGACCAGGTGTTCTTGTGGATTGGGGCTGAGGCCAATGCCACGGAGAAGGAGAGTGCCCT 1118
Query 1995 TGCCACAGCACAGCAGTACCTGCACACTCACCCCAGCGGCCGAGATCCCGACACACCAATCCTGATCATTAAGC 2068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119 TGCCACAGCACAGCAGTACCTGCACACTCACCCCAGCGGCCGAGATCCCGACACACCAATCCTGATCATTAAGC 1192
Query 2069 AGGGGTTTGAGCCTCCCATCTTCACAGGCTGGTTCCTAGCCTGGGACCCTAACATTTGGAGTGCAGGAAAAACA 2142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193 AGGGGTTTGAGCCTCCCATCTTCACAGGCTGGTTCCTAGCCTGGGACCCTAACATTTGGAGTGCAGGAAAAACA 1266
Query 2143 TATGAACAATTAAAAGAAGAGCTGGGAGATGCTGCTGCTATCATGCGAATCACTGCTGACATGAAGAATGCAAC 2216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267 TATGAACAATTAAAAGAAGAGCTGGGAGATGCTGCTGCTATCATGCGAATCACTGCTGACATGAAGAATGCAAC 1340
Query 2217 CCTCTCCCTGAATTCTAATGACAGTGAGCCAAAATATTACCCTATAGCAGTTCTGTTGAAAAACCAGAATCAGG 2290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341 CCTCTCCCTGAATTCTAATGACAGTGAGCCAAAATATTACCCTATAGCAGTTCTGTTGAAAAACCAGAATCAGG 1414
Query 2291 AGCTGCCTGAGGATGTAAACCCTGCCAAAAAGGAGAATTACCTCTCTGAACAGGACTTTGTGTCTGTGTTTGGC 2364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415 AGCTGCCTGAGGATGTAAACCCTGCCAAAAAGGAGAATTACCTCTCTGAACAGGACTTTGTGTCTGTGTTTGGC 1488
Query 2365 ATCACAAGAGGGCAATTTGCAGCTCTGCCTGGCTGGAAACAGCTCCAAATGAAGAAAGAAAAGGGGCTTTTC 2436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489 ATCACAAGAGGGCAATTTGCAGCTCTGCCTGGCTGGAAACAGCTCCAAATGAAGAAAGAAAAGGGGCTTTTC 1560
