Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11537
• Subject: XM_024448800.1
• Aligned Length: 2436
• Identities: 2387
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ATGTCTTCCACGGGGCACCCTGGCTCCTACAAAATATGGGGAGAGAAAATGGAGCTGGCGCTGGTGCCTGTGAG  74
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------ATGGAGCTGGCGCTGGTGCCTGTGAG  26

Query   75  CGCCCACGGCAACTTCTATGAGGGGGACTGCTACGTCATCCTCTCGACCCGGAGAGTGGCCAGTCTCCTATCCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   27  CGCCCACGGCAACTTCTATGAGGGGGACTGCTACGTCATCCTCTCGACCCGGAGAGTGGCCAGTCTCCTATCCC  100

Query  149  AGGACATCCACTTCTGGATCGGGAAGGACTCCTCCCAGGATGAGCAAAGCTGCGCAGCCATATATACCACACAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  101  AGGACATCCACTTCTGGATCGGGAAGGACTCCTCCCAGGATGAGCAAAGCTGCGCAGCCATATATACCACACAG  174

Query  223  CTGGACGACTACCTGGGAGGCAGCCCTGTGCAGCACCGAGAGGTCCAGTACCATGAGTCAGACACTTTCCGTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  175  CTGGACGACTACCTGGGAGGCAGCCCTGTGCAGCACCGAGAGGTCCAGTACCATGAGTCAGACACTTTCCGTGG  248

Query  297  CTACTTCAAGCAGGGCATCATCTACAAGCAGGGGGGTGTCGCCTCTGGGATGAAGCACGTGGAGACCAATACCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  249  CTACTTCAAGCAGGGCATCATCTACAAGCAGGGGGGTGTCGCCTCTGGGATGAAGCACGTGGAGACCAATACCT  322

Query  371  ACGACGTGAAGCGGCTGCTACATGTGAAAGGGAAAAGAAACATCAGGGCTACCGAGGTGGAAATGAGCTGGGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  323  ACGACGTGAAGCGGCTGCTACATGTGAAAGGGAAAAGAAACATCAGGGCTACCGAGGTGGAAATGAGCTGGGAC  396

Query  445  AGTTTCAACCGAGGTGATGTCTTCTTGCTGGACCTTGGGAAAGTCATCATCCAATGGAATGGCCCAGAGAGCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  397  AGTTTCAACCGAGGTGATGTCTTCTTGCTGGACCTTGGGAAAGTCATCATCCAATGGAATGGCCCAGAGAGCAA  470

Query  519  CAGTGGGGAGCGCCTGAAGGCTATGCTTCTGGCAAAGGATATTCGAGACAGGGAGCGAGGGGGCCGTGCTGAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  471  CAGTGGGGAGCGCCTGAAGGCTATGCTTCTGGCAAAGGATATTCGAGACAGGGAGCGAGGGGGCCGTGCTAAAA  544

Query  593  TAGGAGTGATCGAGGGAGACAAGGAGGCAGCCAGCCCAGAGCTGATGAAGGTCCTTCAGGACACCCTTGGCCGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  545  TAGGAGTGATCGAGGGAGACAAGGAGGCAGCCAGCCCAGAGCTGATGAAGGTCCTTCAGGACACCCTTGGCCGA  618

Query  667  CGCTCCATTATCAAGCCTACAGTCCCTGATGAGATCATAGATCAGAAGCAGAAATCAACTATCATGTTGTATCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  619  CGCTCCATTATCAAGCCTACAGTCCCTGATGAGATCATAGATCAGAAGCAGAAATCAACTATCATGTTGTATCA  692

Query  741  TATCTCAGATTCAGCTGGGCAGCTGGCAGTCACAGAGGTAGCAACAAGGCCTCTGGTCCAGGACTTACTGAACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  693  TATCTCAGATTCAGCTGGGCAGCTGGCAGTCACAGAGGTAGCAACAAGGCCTCTGGTCCAGGACTTACTGAACC  766

Query  815  ATGATGACTGCTACATCCTGGACCAAAGTGGAACCAAAATCTACGTGTGGAAAGGAAAAGGAGCCACAAAGGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  767  ATGATGACTGCTACATCCTGGACCAAAGTGGAACCAAAATCTACGTGTGGAAAGGAAAAGGAGCCACAAAGGCT  840

Query  889  GAAAAACAGGCAGCCATGTCTAAAGCGCTGGGCTTCATCAAGATGAAGAGCTACCCCAGCAGCACCAATGTGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  GAAAAACAGGCAGCCATGTCTAAAGCGCTGGGCTTCATCAAGATGAAGAGCTACCCCAGCAGCACCAATGTGGA  914

Query  963  GACCGTCAACGATGGTGCTGAGTCGGCCATGTTCAAGCAGCTGTTCCAGAAGTGGTCAGTAAAGGACCAGACCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  915  GACCGTCAACGATGGTGCTGAGTCGGCCATGTTCAAGCAGCTGTTCCAGAAGTGGTCAGTAAAGGACCAGACCA  988

Query 1037  TGGGCCTGGGGAAAACGTTCAGCATTGGTAAAATTGCTAAAGTTTTCCAGGATAAATTTGATGTGACTCTGCTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  989  TGGGCCTGGGGAAAACGTTCAGCATTGGTAAAATTGCTAAAGTTTTCCAGGATAAATTTGATGTGACTCTGCTA  1062

Query 1111  CACACCAAGCCAGAGGTAGCTGCCCAGGAAAGAATGGTCGATGATGGCAACGGAAAAGTTGAGGTCTGGAGAAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063  CACACCAAGCCAGAGGTAGCTGCCCAGGAAAGAATGGTCGATGATGGCAACGGAAAAGTTGAGGTCTGGAGAAT  1136

Query 1185  TGAGAACCTGGAGCTGGTCCCTGTGGAGTATCAATGGTATGGCTTCTTTTATGGGGGAGACTGTTATCTGGTCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137  TGAGAACCTGGAGCTGGTCCCTGTGGAGTATCAATGGTATGGCTTCTTTTATGGGGGAGACTGTTATCTGGTCC  1210

Query 1259  TCTACACATACGAGGTAAATGGGAAGCCACATCACATCTTGTACATCTGGCAGGGCCGCCACGCCTCACAGGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211  TCTACACATACGAGGTAAATGGGAAGCCACATCACATCTTGTACATCTGGCAGGGCCGCCACGCCTCACAGGAT  1284

Query 1333  GAGCTGGCAGCCTCAGCATACCAGGCAGTGGAGGTGGATCGGCAGTTTGATGGGGCTGCTGTGCAGGTTCGAGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285  GAGCTGGCAGCCTCAGCATACCAGGCAGTGGAGGTGGATCGGCAGTTTGATGGGGCTGCTGTGCAGGTTCGAGT  1358

Query 1407  CAGGATGGGAACGGAGCCACGCCACTTCATGGCCATCTTCAAAGGGAAGCTAGTTATCTTTGAGGGTGGGACTT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359  CAGGATGGGAACGGAGCCACGCCACTTCATGGCCATCTTCAAAGGGAAGCTAGTTATCTTTGAGGGTGGGACTT  1432

Query 1481  CCAGGAAGGGAAATGCCGAGCCTGACCCTCCAGTAAGACTCTTCCAAATTCATGGAAATGACAAATCTAACACC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433  CCAGGAAGGGAAATGCCGAGCCTGACCCTCCAGTAAGACTCTTCCAAATTCATGGAAATGACAAATCTAACACC  1506

Query 1555  AAAGCAGTGGAAGTTCCAGCCTTTGCCTCCTCCCTAAACTCCAATGATGTCTTTCTGCTGCGAACTCAGGCAGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1507  AAAGCAGTGGAAGTTCCAGCCTTTGCCTCCTCCCTAAACTCCAATGATGTCTTTCTGCTGCGAACTCAGGCAGA  1580

Query 1629  GCACTACCTGTGGTATGGCAAGGGGTCTAGTGGGGATGAGCGGGCAATGGCTAAGGAGCTGGCCAGCCTTCTCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581  GCACTACCTGTGGTATGGCAAGGGGTCTAGTGGGGATGAGCGGGCAATGGCTAAGGAGCTGGCCAGCCTTCTCT  1654

Query 1703  GTGATGGCAGCGAGAACACTGTGGCCGAGGGCCAGGAGCCAGCCGAGTTCTGGGACCTACTGGGAGGGAAAACT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655  GTGATGGCAGCGAGAACACTGTGGCCGAGGGCCAGGAGCCAGCCGAGTTCTGGGACCTACTGGGAGGGAAAACT  1728

Query 1777  CCCTATGCCAATGATAAAAGACTTCAGCAGGAAATCCTAGATGTCCAGTCTCGTCTCTTTGAATGTTCCAATAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729  CCCTATGCCAATGATAAAAGACTTCAGCAGGAAATCCTAGATGTCCAGTCTCGTCTCTTTGAATGTTCCAATAA  1802

Query 1851  GACCGGCCAATTCGTTGTCACTGAGATCACAGACTTCACCCAGGATGACCTGAACCCTACTGACGTGATGCTCC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1803  GACCGGCCAATTCGTTGTCACTGAGATCACAGACTTCACCCAGGATGACCTGAACCCTACTGACGTGATGCTCC  1876

Query 1925  TAGATACCTGGGACCAGGTGTTCTTGTGGATTGGGGCTGAGGCCAATGCCACGGAGAAGGAGAGTGCCCTTGCC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877  TAGATACCTGGGACCAGGTGTTCTTGTGGATTGGGGCTGAGGCCAATGCCACGGAGAAGGAGAGTGCCCTTGCC  1950

Query 1999  ACAGCACAGCAGTACCTGCACACTCACCCCAGCGGCCGAGATCCCGACACACCAATCCTGATCATTAAGCAGGG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951  ACAGCACAGCAGTACCTGCACACTCACCCCAGCGGCCGAGATCCCGACACACCAATCCTGATCATTAAGCAGGG  2024

Query 2073  GTTTGAGCCTCCCATCTTCACAGGCTGGTTCCTAGCCTGGGACCCTAACATTTGGAGTGCAGGAAAAACATATG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2025  GTTTGAGCCTCCCATCTTCACAGGCTGGTTCCTAGCCTGGGACCCTAACATTTGGAGTGCAGGAAAAACATATG  2098

Query 2147  AACAATTAAAAGAAGAGCTGGGAGATGCTGCTGCTATCATGCGAATCACTGCTGACATGAAGAATGCAACCCTC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099  AACAATTAAAAGAAGAGCTGGGAGATGCTGCTGCTATCATGCGAATCACTGCTGACATGAAGAATGCAACCCTC  2172

Query 2221  TCCCTGAATTCTAATGACAGTGAGCCAAAATATTACCCTATAGCAGTTCTGTTGAAAAACCAGAATCAGGAGCT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2173  TCCCTGAATTCTAATGACAGTGAGCCAAAATATTACCCTATAGCAGTTCTGTTGAAAAACCAGAATCAGGAGCT  2246

Query 2295  GCCTGAGGATGTAAACCCTGCCAAAAAGGAGAATTACCTCTCTGAACAGGACTTTGTGTCTGTGTTTGGCATCA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2247  GCCTGAGGATGTAAACCCTGCCAAAAAGGAGAATTACCTCTCTGAACAGGACTTTGTGTCTGTGTTTGGCATCA  2320

Query 2369  CAAGAGGGCAATTTGCAGCTCTGCCTGGCTGGAAACAGCTCCAAATGAAGAAAGAAAAGGGGCTTTTC  2436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2321  CAAGAGGGCAATTTGCAGCTCTGCCTGGCTGGAAACAGCTCCAAATGAAGAAAGAAAAGGGGCTTTTC  2388