Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_11567
Subject:
NM_001300961.2
Aligned Length:
941
Identities:
840
Gaps:
100

Alignment

Query   1  ---------------------MRSGDQNWVSVSRAIKPFAEPGRPPDWFSQKHCASQYSELLETTETPKRKRGE  53
                                .|      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MVHPREAMFSIFCHEKWRSKLVR------VSVSRAIKPFAEPGRPPDWFSQKHCASQYSELLETTETPKRKRGE  68

Query  54  KGEVVETVEDVIVRKLTAERVEELKKVIKETQERYRRLKRDAELIQAGHMDSRLDELCNDIATKKKLEEEEAEV  127
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  69  KGEVVETVEDVIVRKLTAERVEELKKVIKETQERYRRLKRDAELIQAGHMDSRLDELCNDIATKKKLEEEEAEV  142

Query 128  KRKATDAAYQARQAVKTPPRRLPTVMVRSPIDSASPGGDYPLGDLTPTTMEEATSGVTPGTLPSTPVTSFPGIP  201
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct 143  KRKATDAAYQARQAVKTPPRRLPTVMVRSPIDSASPGGDYPLGDLTPTTMEEATSG------------------  198

Query 202  DTLPPGSAPLEAPMTPVTDDSPQKKMLGQKATPPPSPLLSELLKKGSLLPTSPRLVNESEMAVASGHLNSTGVL  275
                                                                  |||||||||||||||||||
Sbjct 199  -------------------------------------------------------VNESEMAVASGHLNSTGVL  217

Query 276  LEVGGVLPMIHGGEIQQTPNTVAASPAASGAPTLSRLLEAGPTQFTTPLASFTTVASEPPVKLVPPPVESVSQA  349
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218  LEVGGVLPMIHGGEIQQTPNTVAASPAASGAPTLSRLLEAGPTQFTTPLASFTTVASEPPVKLVPPPVESVSQA  291

Query 350  TIVMMPALPAPSSAPAVSTTESVAPVSQPDNCVPMEAVGDPHTVTVSMDSSEISMIINSIKEECFRSGVAEAPV  423
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292  TIVMMPALPAPSSAPAVSTTESVAPVSQPDNCVPMEAVGDPHTVTVSMDSSEISMIINSIKEECFRSGVAEAPV  365

Query 424  GSKAPSIDGKEELDLAEKMDIAVSYTGEELDFETVGDIIAIIEDKVDDHPEVLDVAAVEAALSFCEENDDPQSL  497
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366  GSKAPSIDGKEELDLAEKMDIAVSYTGEELDFETVGDIIAIIEDKVDDHPEVLDVAAVEAALSFCEENDDPQSL  439

Query 498  PGPWEHPIQQERDKPVPLPAPEMTVKQERLDFEETENKGIHELVDIREPSAEIKVEPAEPEPVISGAEIVAGVV  571
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440  PGPWEHPIQQERDKPVPLPAPEMTVKQERLDFEETENKGIHELVDIREPSAEIKVEPAEPEPVISGAEIVAGVV  513

Query 572  PATSMEPPELRSQDLDEELGSTAAGEIVEADVAIGKGDETPLTNVKTEASPESMLSPSHGSNPIEDPLEAETQH  645
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514  PATSMEPPELRSQDLDEELGSTAAGEIVEADVAIGKGDETPLTNVKTEASPESMLSPSHGSNPIEDPLEAETQH  587

Query 646  KFEMSDSLKEESGTIFGSQIKDAPGEDEEEDGVSEAASLEEPKEEDQGEGYLSEMDNEPPVSESDDGFSIHNAT  719
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588  KFEMSDSLKEESGTIFGSQIKDAPGEDEEEDGVSEAASLEEPKEEDQGEGYLSEMDNEPPVSESDDGFSIHNAT  661

Query 720  LQSHTLADSIPSSPASSQFSVCSEDQEAIQAQKIWKKAIMLVWRAAANHRYANVFLQPVTDDIAPGYHSIVQRP  793
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662  LQSHTLADSIPSSPASSQFSVCSEDQEAIQAQKIWKKAIMLVWRAAANHRYANVFLQPVTDDIAPGYHSIVQRP  735

Query 794  MDLSTIKKNIENGLIRSTAEFQRDIMLMFQNAVMYNSSDHDVYHMAVEMQRDVLEQIQQFLATQLIMQTSESGI  867
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 736  MDLSTIKKNIENGLIRSTAEFQRDIMLMFQNAVMYNSSDHDVYHMAVEMQRDVLEQIQQFLATQLIMQTSESGI  809

Query 868  SAKSLRGRDSTRKQDASEKDSVPMGSPAFLLSLFDGGTRGRRCAIEADMKMKK  920
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 810  SAKSLRGRDSTRKQDASEKDSVPMGSPAFLLSLFDGGTRGRRCAIEADMKMKK  862