Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11567
• Subject: XM_011247042.1
• Aligned Length: 2805
• Identities: 2307
• Gaps: 264

Alignment

Query    1  ----------------------------------------ATGAGAAGTGGCGATCAAAA-----TTGGGTATC  29
                                                    |||||.|||||.|||||.||     |.|||||||
Sbjct    1  ATGGTCCATCCGAGAGAAGTTGTGTTTAGCATCTTCTGTCATGAGGAGTGGGGATCAGAACTGGTTAGGGTATC  74

Query   30  AGTTAGCAGAGCAATCAAGCCCTTTGCAGAACCTGGCCGCCCTCCAGACTGGTTCTCTCAAAAACATTGTGCTT  103
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTTAGCAGAGCAATCAAGCCCTTTGCAGAACCTGGCCGGCCTCCAGACTGGTTCTCTCAAAAACATTGTGCTT  148

Query  104  CCCAGTACTCGGAGCTTTTAGAGACCACTGAGACACCAAAACGGAAACGAGGTGAAAAGGGAGAAGTGGTGGAA  177
            |.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  149  CTCAGTATTCTGAGCTCTTAGAGACTACTGAGACTCCAAAACGGAAACGGGGTGAAAAAGGAGAAGTGGTAGAA  222

Query  178  ACTGTTGAAGATGTTATTGTTCGGAAATTGACTGCTGAGCGAGTTGAAGAACTAAAGAAAGTGATAAAGGAAAC  251
            |||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  223  ACTGTTGAAGATGTTATTGTTCGCAAACTGACTGCTGAGAGAGTTGAAGAACTGAAGAAAGTCATAAAGGAGAC  296

Query  252  CCAGGAGAGATATAGACGGCTAAAGAGAGATGCAGAACTAATTCAAGCTGGACACATGGACAGCAGACTGGATG  325
            .|||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACAGGAGAGATACAGGCGTCTGAAAAGAGATGCAGAACTAATCCAAGCCGGGCACATGGACAGCAGACTGGATG  370

Query  326  AGCTTTGCAATGACATTGCAACGAAAAAGAAATTGGAAGAAGAGGAGGCTGAAGTAAAGAGGAAGGCTACAGAT  399
            ||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct  371  AGCTCTGCAATGACATTGCAATGAAAAAGAAATTGGAAGAGGAAGAGGCTGAAGTAAAAAGGAAGGCCACCGAT  444

Query  400  GCTGCATACCAGGCTCGTCAAGCAGTAAAAACACCCCCCCGGAGGTTACCCACTGTGATGGTTCGCTCTCCTAT  473
            |||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.|
Sbjct  445  GCTGCGTACCAGGCGCGACAAGCAGTGAAAACGCCTCCTCGAAGGTTACCGACTGTGATGGTCCGCTCTCCTGT  518

Query  474  AGATTCTGCCTCCCCAGGAGGTGATTATCCACTTGGGGACTTGACTCCAACCACTATGGAAGAGGCTACCTCTG  547
            |||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGACTCTGCCTCCCCAGGAGGTGATTACCCACTTGGAGACTTGACTCCAACCACTATGGAAGAGGCTACCTCTG  592

Query  548  GGGTAACCCCCGGGACTTTGCCGAGTACCCCAGTCACCTCGTTTCCTGGGATTCCTGACACCCTTCCTCCAGGC  621
            |                                                                         
Sbjct  593  G-------------------------------------------------------------------------  593

Query  622  TCTGCACCCTTAGAAGCCCCCATGACCCCAGTAACAGATGATTCACCCCAGAAAAAGATGCTTGGACAGAAAGC  695
                                                                                      
Sbjct  594  --------------------------------------------------------------------------  593

Query  696  AACTCCACCCCCCTCCCCTCTGCTGTCAGAGCTCTTGAAGAAGGGCAGCCTCCTGCCTACTAGCCCCAGACTGG  769
                                                                                    ||
Sbjct  594  ------------------------------------------------------------------------GG  595

Query  770  TCAATGAGAGTGAAATGGCTGTGGCTTCTGGCCACCTGAACAGTACAGGTGTCCTCCTGGAGGTAGGCGGGGTC  843
            |.|||||||||||||||.||||..|..|||||||.||||||||.|||||.||.|||.||||||||||.|||||.
Sbjct  596  TGAATGAGAGTGAAATGCCTGTACCCCCTGGCCATCTGAACAGCACAGGGGTTCTCTTGGAGGTAGGAGGGGTT  669

Query  844  CTTCCCATGATACATGGTGGGGAGATACAGCAAACACCCAATACTGTTGCAGCCTCCCCTGCTGCATCAGGTGC  917
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.|.||||.||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  670  CTTCCCATGATACATGGTGGGGAGATACAGCCAACAACCAGTGCTGTGGCGGCCTCCCCGGCTGCCTCAGGTGC  743

Query  918  TCCCACTCTTTCCCGGCTTTTAGAAGCTGGTCCTACACAGTTCACCACACCTCTTGCTTCCTTCACTACTGTTG  991
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  744  TCCCACTCTTTCCCGGCTTTTAGAAGCTGGGCCCACACAGTTCACCACTCCTCTTCCTTCCTTCACTACTGTTG  817

Query  992  CCAGTGAGCCTCCAGTTAAACTTGTGCCACCCCCTGTAGAGTCTGTGTCCCAAGCTACCATTGTCATGATGCCT  1065
            ||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  818  CCAGTGAGCCGCCAGTTAAGCTTGTGCCACCCCCTGTAGAGTCTGTGTCCCAGGCTACCATTGTCATGATGCCC  891

Query 1066  GCGCTGCCAGCACCATCCTCTGCTCCGGCTGTCTCCACTACTGAAAGTGTAGCTCCAGTGAGTCAACCCGACAA  1139
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||.||.||.||...
Sbjct  892  GCGCTGCCAGCACCATCCTCTGCTGCGGCTGTCTCCACTTCTGAAAGTGGAGCTCCAGTGAGCCAGCCTGAGCC  965

Query 1140  CTGTGTTCCCATGGAGGCTGTGGGGGATCCACATACTGTGACTGTTTCCATGGACAGCAGTGAAATATCCATGA  1213
            ||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||
Sbjct  966  CTGTGTACCCCTGGAAGCTGTGGGGGATCCACATACTGTGACTGTTTCCATGGATAGCAATGAAATCTCCATGA  1039

Query 1214  TCATCAATTCTATCAAAGAAGAGTGTTTTCGATCAGGGGTAGCAGAGGCTCCTGTTGGATCAAAGGCTCCCAGC  1287
            ||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||
Sbjct 1040  TCATTAATTCCATCAAAGAAGAGTGTTTCCGCTCAGGGGTAGCAGAGGCTCCTGGTGGATCAAAGGCTCCAAGC  1113

Query 1288  ATAGATGGGAAGGAAGAATTAGATCTGGCTGAGAAGATGGATATTGCTGTGTCTTACACAGGTGAAGAGCTGGA  1361
            |||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1114  ATAGATGGGAAGGAAGACTTGGATCTAGCGGAGAAGATGGATATTGCTGTGTCTTACACAGGTGAAGAGTTGGA  1187

Query 1362  TTTTGAGACTGTTGGAGACATCATTGCCATCATTGAGGACAAGGTAGATGATCATCCTGAAGTGCTGGATGTGG  1435
            .|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1188  CTTTGAAACAGTTGGAGACATCATTGCCATCATTGAGGACAAGGTGGATGATCACCCTGAAGTGCTGGATGTGG  1261

Query 1436  CAGCAGTGGAAGCAGCACTGTCATTTTGTGAAGAAAATGATGATCCTCAGTCCCTGCCTGGCCCCTGGGAGCAT  1509
            ||||.||.|||||.||..|.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1262  CAGCGGTAGAAGCGGCGTTATCGTTCTGTGAAGAGAATGATGACCCTCAGTCCCTGCCTGGCCCCTGGGAGCAC  1335

Query 1510  CCTATCCAGCAGGAGCGGGACAAGCCAGTACCTCTCCCTGCACCAGAAATGACGGTCAAGCAAGAGAGACTGGA  1583
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||
Sbjct 1336  CCTATCCAGCAGGAGCGCGACAAGCCAGTACCTCTGCCAGCACCAGAGATGACAGTCAAACAAGAGAGGCTAGA  1409

Query 1584  CTTTGAGGAAACGGAAAACAAGGGAATACATGAACTGGTGGACATCAGGGAGCCCAGTGCAGAGATCAAGGTGG  1657
            |||.||||||.|.||||||||.||..|.|||||.|||||||||||||||||..||.|||..|||||.|||||||
Sbjct 1410  CTTCGAGGAATCAGAAAACAAAGGGCTCCATGACCTGGTGGACATCAGGGATTCCGGTGTTGAGATTAAGGTGG  1483

Query 1658  AACCTGCAGAACCAGAGCCAGTCATTTCAGGAGCCGAAATAGTAGCTGGAGTTGTTCCAGCCACAAGTATGGAG  1731
            ||||..||||.||||||||||.|||.||.||.||.||.||||||||||||||||.|||||...|||||||||||
Sbjct 1484  AACCCACAGAGCCAGAGCCAGGCATGTCTGGGGCTGAGATAGTAGCTGGAGTTGGTCCAGTTCCAAGTATGGAG  1557

Query 1732  CCACCAGAACTCAGGAGTCAGGACTTAGATGAGGAACTGGGAAGTACTGCAGCTGGAGAGATTGTTGAAGCAGA  1805
            ||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||...|||||.|||||||||||||.||||.|||.|||||
Sbjct 1558  CCACCAGAACTCAGGAGTCAAGACTCAGATGAAGAACCTAGAAGTTCTGCAGCTGGAGACATTGGTGAGGCAGA  1631

Query 1806  TGTTGCCATTGGGAAAGGCGATGAGACTCCACTTACAAATGTGAAGACAGAGGCATCCCCTGAAAGCATGTTGT  1879
            ||.|.|||.|||||||||||||||||..||||||.||..||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1632  TGGTTCCAGTGGGAAAGGCGATGAGAGGCCACTTTCAGCTGTGAAGACAGAGGCATCCCCTGAGAGCATGTTGT  1705

Query 1880  CTCCATCACATGGCTCAAATCCCATTGAAGATCCTTTAGAGGCAGAGACTCAGCACAAGTTTGAAATGTCAGAC  1953
            |||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1706  CTCCATCACATGGCTCAAATCTTATTGAAGATCCTTTAGAGGCAGAGACTCAACACAAGTTTGAAATGTCAGAC  1779

Query 1954  TCATTGAAAGAAGAATCAGGGACTATTTTTGGAAGCCAGATAAAGGATGCCCCAGGTGAGGATGAGGAGGAAGA  2027
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1780  TCATTGAAAGAAGAATCAGGGACTATTTTTGGAAGCCAGATAAAGGATGCCCCAGGTGACGATGAGGAAGAAGA  1853

Query 2028  TGGTGTCAGTGAAGCGGCCAGCCTAGAGGAGCCTAAGGAAGAGGATCAAGGAGAAGGCTACTTGTCAGAAATGG  2101
            |||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1854  TGGAGTCAGTGAAGCAGCTAGCCTAGAGGAGCCTAAGGAAGAGGATCAAGGAGAAGGCTATTTGTCTGAGATGG  1927

Query 2102  ATAATGAACCTCCTGTGAGCGAGAGTGATGATGGCTTCAGCATACACAATGCTACACTGCAGTCACACACACTG  2175
            |||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1928  ATAATGAGCCCCCTGTGAGTGAGAGTGATGATGGCTTTAGTATACATAACGCCACACTGCAGTCACACACTCTG  2001

Query 2176  GCAGACTCCATCCCCAGCAGCCCTGCTTCTTCACAGTTCTCTGTCTGTAGTGAGGATCAGGAAGCTATTCAGGC  2249
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 2002  GCAGACTCCATCCCAAGCAGCCCTGCCTCCTCCCAGTTTTCCGTGTGCAGTGAAGATCAAGAAGCAATTCAGGC  2075

Query 2250  ACAGAAAATTTGGAAGAAAGCCATCATGCTTGTATGGAGAGCTGCAGCTAATCATAGGTATGCCAATGTCTTCC  2323
            .||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2076  TCAGAAAATATGGAAGAAAGCCATCATGCTTGTATGGAGGGCTGCAGCAAATCATAGGTATGCCAATGTGTTCC  2149

Query 2324  TGCAGCCTGTTACAGATGACATAGCACCTGGCTACCACAGCATTGTGCAGAGGCCTATGGATTTGTCAACTATT  2397
            ||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2150  TGCAACCTGTTACAGATGACATAGCTCCTGGTTACCATAGCATTGTACAGAGGCCTATGGATTTGTCAACTATA  2223

Query 2398  AAGAAAAACATAGAAAATGGACTGATCCGAAGCACAGCTGAATTTCAGCGTGACATTATGCTGATGTTTCAGAA  2471
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2224  AAGAAAAACATTGAAAATGGACTGATCCGAAGCACAGCTGAGTTTCAGCGTGACATCATGCTGATGTTTCAGAA  2297

Query 2472  TGCTGTAATGTACAATAGCTCAGACCATGATGTCTATCACATGGCAGTGGAGATGCAGCGAGATGTCTTGGAAC  2545
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2298  TGCTGTTATGTACAATAGCTCAGACCATGATGTCTATCACATGGCAGTAGAGATGCAGAGAGATGTCTTGGAAC  2371

Query 2546  AGATCCAGCAATTCTTGGCCACGCAGTTGATTATGCAAACATCCGAGTCTGGGATCAGTGCTAAAAGTCTTCGA  2619
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 2372  AGATCCAGCAATTCTTGGCCACACAGTTGATTATGCAAACATCTGAGTCTGGAATCAGTGCTAAAAGTCTCCGG  2445

Query 2620  GGGAGAGATTCTACCCGCAAACAGGATGCTTCAGAGAAGGACAGTGTCCCAATGGGCTCTCCTGCCTTCCTTCT  2693
            ||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2446  GGGAGAGACTCTACCCGAAAACAAGATGCTTCAGAGAAGGACAGTGTCCCCATGGGCTCTCCTGCCTTCCTTCT  2519

Query 2694  CTCTCTCTTTGATGGAGGAACCAGGGGACGCCGCTGTGCCATTGAAGCAGATATGAAGATGAAAAAG  2760
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2520  CTCTCTCTTTGATGGGGGAACCAGGGGACGCCGCTGTGCCATTGAAGCAGATATGAAGATGAAGAAG  2586