Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11580
• Subject: XM_024450552.1
• Aligned Length: 2337
• Identities: 2313
• Gaps: 24

Alignment

Query    1  ------------------------ATGGAAGAATTGCATAGCCTGGACCCACGACGGCAGGAATTATTGGAGGC  50
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACAGCCTGTGGAGCAGAAATGATGGAAGAATTGCATAGCCTGGACCCACGACGGCAGGAATTATTGGAGGC  74

Query   51  CAGGTTTACTGGAGTAGGTGTTAGTAAGGGACCACTTAATAGTGAGTCTTCCAACCAGAGCTTGTGCAGCGTCG  124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGGTTTACTGGAGTAGGTGTTAGTAAGGGACCACTTAATAGTGAGTCTTCCAACCAGAGCTTGTGCAGCGTCG  148

Query  125  GATCCTTGAGTGATAAAGAAGTAGAGACTCCCGAGAAAAAGCAGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGAAAAGCT  198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GATCCTTGAGTGATAAAGAAGTAGAGACTCCCGAGAAAAAGCAGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGAAAAGCT  222

Query  199  GAACCATATGAAACTAGCCAAGGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAAATTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGG  272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAACCATATGAAACTAGCCAAGGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAAATTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGG  296

Query  273  GGGAAGCGCGCCAGGAACCAGCCCTGGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATCCTCACCGCAACATTCCTTAT  346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGAAGCGCGCCAGGAACCAGCCCTGGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATCCTCACCGCAACATTCCTTAT  370

Query  347  CCAATCCCTTACCGCGACGAGTAGAACAGCCCCTCTATGGTTTAGATGGCAGTGCTGCAAAGGAGGCAACGGAG  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAATCCCTTACCGCGACGAGTAGAACAGCCCCTCTATGGTTTAGATGGCAGTGCTGCAAAGGAGGCAACGGAG  444

Query  421  GAGCAGTCTGCTCTGCCAACCCTCATGTCAGTGATGCTAGCAAAACCTCGGCTTGACACAGAGCAGCTGGCGCA  494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGCAGTCTGCTCTGCCAACCCTCATGTCAGTGATGCTAGCAAAACCTCGGCTTGACACAGAGCAGCTGGCGCA  518

Query  495  AAGGGGAGCTGGCCTCTGCTTCACTTTTGTTTCAGCTCAGCAAAACAGTCCCTCATCTACGGGATCTGGCAACA  568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGGGGAGCTGGCCTCTGCTTCACTTTTGTTTCAGCTCAGCAAAACAGTCCCTCATCTACGGGATCTGGCAACA  592

Query  569  CAGAGCATTCCTGCAGCTCCCAAAAACAGATCTCCATCCAGCACAGACAGACCCAGTCCGACCTCACAATAGAA  642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGAGCATTCCTGCAGCTCCCAAAAACAGATCTCCATCCAGCACAGACAGACCCAGTCCGACCTCACAATAGAA  666

Query  643  AAAATATCTGCACTAGAAAACAGTAAGAATTCTGACTTAGAGAAGAAGGAGGGAAGAATAGATGATTTATTAAG  716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAATATCTGCACTAGAAAACAGTAAGAATTCTGACTTAGAGAAGAAGGAGGGAAGAATAGATGATTTATTAAG  740

Query  717  AGCCAACTGTGATTTGAGACGGCAGATTGATGAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACGATTAAATA  790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCCAACTGTGATTTGAGACGGCAGATTGATGAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACGATTAAATA  814

Query  791  GATGTGTGACAATGAGCAAGAAACTCCTTATAGAAAAGTCAAAACAAGAGAAGATGGCGTGTAGAGATAAGAGC  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GATGTGTGACAATGAGCAAGAAACTCCTTATAGAAAAGTCAAAACAAGAGAAGATGGCGTGTAGAGATAAGAGC  888

Query  865  ATGCAAGACCGCTTGAGACTGGGCCACTTTACTACTGTCCGACACGGAGCCTCATTTACTGAACAGTGGACAGA  938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGCAAGACCGCTTGAGACTGGGCCACTTTACTACTGTCCGACACGGAGCCTCATTTACTGAACAGTGGACAGA  962

Query  939  TGGTTATGCTTTTCAGAATCTTATCAAGCAACAGGAAAGGATAAATTCACAGAGGGAAGAGATAGAAAGACAAC  1012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGTTATGCTTTTCAGAATCTTATCAAGCAACAGGAAAGGATAAATTCACAGAGGGAAGAGATAGAAAGACAAC  1036

Query 1013  GGAAAATGTTAGCAAAGCGGAAACCTCCTGCCATGGGTCAGGCCCCTCCTGCAACCAATGAGCAGAAACAGCGG  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGAAAATGTTAGCAAAGCGGAAACCTCCTGCCATGGGTCAGGCCCCTCCTGCAACCAATGAGCAGAAACAGCGG  1110

Query 1087  AAAAGCAAGACCAATGGAGCTGAAAATGAAACGCCCTCTTCTGGGAATACAGAGCTAAAGGATACAGCCCCAGC  1160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAAGCAAGACCAATGGAGCTGAAAATGAAACGCCCTCTTCTGGGAATACAGAGCTAAAGGATACAGCCCCAGC  1184

Query 1161  CTTAGGAGCCCACAGTTTACTTAGGTTAACGTTAGCAGAATACCATGAACAAGAAGAAATCTTCAAACTCAGAT  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTAGGAGCCCACAGTTTACTTAGGTTAACGTTAGCAGAATACCATGAACAAGAAGAAATCTTCAAACTCAGAT  1258

Query 1235  TAGGTCATCTTAAAAAGGAGGAAGCAGAGATCCAGGCAGAGCTGGAGAGACTAGAAAGGGTTAGAAATCTACAT  1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TAGGTCATCTTAAAAAGGAGGAAGCAGAGATCCAGGCAGAGCTGGAGAGACTAGAAAGGGTTAGAAATCTACAT  1332

Query 1309  ATCAGGGAACTAAAAAGGATACATAATGAAGATAATTCACAATTTAAAGATCATCCAACGCTAAATGACAGATA  1382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCAGGGAACTAAAAAGGATACATAATGAAGATAATTCACAATTTAAAGATCATCCAACGCTAAATGACAGATA  1406

Query 1383  TTTGTTGTTACATCTTTTGGGTAGAGGAGGTTTCAGTGAAGTTTACAAGGCATTTGATCTAACAGAGCAAAGAT  1456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTTGTTGTTACATCTTTTGGGTAGAGGAGGTTTCAGTGAAGTTTACAAGGCATTTGATCTAACAGAGCAAAGAT  1480

Query 1457  ACGTAGCTGTGAAAATTCACCAGTTAAATAAAAACTGGAGAGATGAGAAAAAGGAGAATTACCACAAGCATGCA  1530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACGTAGCTGTGAAAATTCACCAGTTAAATAAAAACTGGAGAGATGAGAAAAAGGAGAATTACCACAAGCATGCA  1554

Query 1531  TGTAGGGAATACCGGATTCATAAAGAGCTGGATCATCCCAGAATAGTTAAGCTGTATGATTACTTTTCACTGGA  1604
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGTAGGGAATACCGGATTCATAAAGAGCTGGATCATCCCAGAATAGTTAAGCTGTATGATTACTTTTCACTGGA  1628

Query 1605  TACTGACTCGTTTTGTACAGTATTAGAATACTGTGAGGGAAATGATCTGGACTTCTACCTGAAACAGCACAAAT  1678
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TACTGACTCGTTTTGTACAGTATTAGAATACTGTGAGGGAAATGATCTGGACTTCTACCTGAAACAGCACAAAT  1702

Query 1679  TAATGTCGGAGAAAGAGGCCCGGTCCATTATCATGCAGATTGTGAATGCTTTAAAGTACTTAAATGAAATAAAA  1752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TAATGTCGGAGAAAGAGGCCCGGTCCATTATCATGCAGATTGTGAATGCTTTAAAGTACTTAAATGAAATAAAA  1776

Query 1753  CCTCCCATCATACACTATGACCTCAAACCAGGTAATATTCTTTTAGTAAATGGTACAGCGTGTGGAGAGATAAA  1826
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCTCCCATCATACACTATGACCTCAAACCAGGTAATATTCTTTTAGTAAATGGTACAGCGTGTGGAGAGATAAA  1850

Query 1827  AATTACAGATTTTGGTCTTTCGAAGATCATGGATGATGATAGCTACAATTCAGTGGATGGCATGGAGCTAACAT  1900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AATTACAGATTTTGGTCTTTCGAAGATCATGGATGATGATAGCTACAATTCAGTGGATGGCATGGAGCTAACAT  1924

Query 1901  CACAAGGTGCTGGTACTTATTGGTATTTACCACCAGAGTGTTTTGTGGTTGGGAAAGAACCACCAAAGATCTCA  1974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CACAAGGTGCTGGTACTTATTGGTATTTACCACCAGAGTGTTTTGTGGTTGGGAAAGAACCACCAAAGATCTCA  1998

Query 1975  AATAAAGTTGATGTGTGGTCGGTGGGTGTGATCTTCTATCAGTGTCTTTATGGAAGGAAGCCTTTTGGCCATAA  2048
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AATAAAGTTGATGTGTGGTCGGTGGGTGTGATCTTCTATCAGTGTCTTTATGGAAGGAAGCCTTTTGGCCATAA  2072

Query 2049  CCAGTCTCAGCAAGACATCCTACAAGAGAATACGATTCTTAAAGCTACTGAAGTGCAGTTCCCGCCAAAGCCAG  2122
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCAGTCTCAGCAAGACATCCTACAAGAGAATACGATTCTTAAAGCTACTGAAGTGCAGTTCCCGCCAAAGCCAG  2146

Query 2123  TAGTAACACCTGAAGCAAAGGCGTTTATTCGACGATGCTTGGCCTACCGAAAGGAGGACCGCATTGATGTCCAG  2196
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TAGTAACACCTGAAGCAAAGGCGTTTATTCGACGATGCTTGGCCTACCGAAAGGAGGACCGCATTGATGTCCAG  2220

Query 2197  CAGCTGGCCTGTGATCCCTACTTGTTGCCTCACATCCGAAAGTCAGTCTCTACAAGTAGCCCTGCTGGAGCTGC  2270
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CAGCTGGCCTGTGATCCCTACTTGTTGCCTCACATCCGAAAGTCAGTCTCTACAAGTAGCCCTGCTGGAGCTGC  2294

Query 2271  TATTGCATCAACCTCTGGGGCGTCCAATAACAGTTCTTCTAAT  2313
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TATTGCATCAACCTCTGGGGCGTCCAATAACAGTTCTTCTAAT  2337