Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11582
• Subject: NR_135494.2
• Aligned Length: 2742
• Identities: 1734
• Gaps: 988

Alignment

Query    1  -------------------------------ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTC  43
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  GCAGAGCGCGGGGTCACCGGGAGGAGACGCCATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTC  74

Query   44  TGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATC  117
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGGCCCCAGGACCCGCATGCAGGCAGGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATC  148

Query  118  AGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGG  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  AGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCAACTGGATAAAGAGGG  222

Query  192  AAGCCCAGAGCCCTTGGACAGAAATAACCCACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGA  265
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGCCCAGAGCCCTGGGACAGAAATAACCCACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGA  296

Query  266  CAGAGCACCATGCGGGGAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTG  339
            ||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACAGCACCATGCAGGGAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTG  370

Query  340  GAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGG  413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGG  444

Query  414  GAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGC  487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGC  518

Query  488  TCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAAC  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACC  592

Query  562  CCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATTACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGA  635
            ||||||||                                                                  
Sbjct  593  CCCAGCCA------------------------------------------------------------------  600

Query  636  CCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCC  709
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  --------------------CAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCC  654

Query  710  CTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAA  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  655  CTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAA  728

Query  784  CGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGT  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  729  CGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGT  802

Query  858  GAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCG  931
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  803  GAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTG  876

Query  932  ACCCCCTGAACATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTG  1005
            ||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  877  ACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACAGATCTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTG  950

Query 1006  GCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGG  1079
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  951  GCCTCAGGAGAGAACATGACCCTGCTGTGTCAGTCACGGGGGTATTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGG  1024

Query 1080  GGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTC  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025  GGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTC  1098

Query 1154  CTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTC  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099  CTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTC  1172

Query 1228  CCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTC  1301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173  CCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTC  1246

Query 1302  CACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCC  1375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247  CACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCC  1320

Query 1376  TCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAG  1449
            ||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321  TCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAG  1394

Query 1450  CGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGT  1523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395  CGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGT  1468

Query 1524  CCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCC  1597
            |||||||||||||||||                                                     ||||
Sbjct 1469  CCAGGAAGAAAACCTCT-----------------------------------------------------AGCC  1489

Query 1598  CACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCT  1671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490  CACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCT  1563

Query 1672  CCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACAC  1745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1564  CCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACAC  1637

Query 1746  TGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGG  1819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1638  TGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGG  1711

Query 1820  CAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1893
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1712  CAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1785

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 1786  TAGCCCGGGGGGTACGCAGACCCCACACTCAGCAGAAGGAGACTCAGGACTGCTGAAGGCACGGGAGCTGCCCC  1859

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 1860  CAGTGGACACCAGTGAACCCCAGTCAGCCTGGACCCCTAACACAGACCATGAGGAGACGCTGGGAACTTGTGGG  1933

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 1934  ACTCACCTGACTCAAAGATGACTAATATCGTCCCATTTTGGAAATAAAGCAACAGACTTCTCAACAATCAATGA  2007

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2008  GTTAATAACAAAAAAACAAAAAACAAAAACAGACGTAAAGGCCGGGTGTGGTACTCAGGAGGCTGAGTGGGGAG  2081

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2082  GATTCCTTGAACACAAGAAGTTAAGGCTGCTGAGGCTGCAGTGAGCTATGACTGTGCCACTGCACTCCAGCCTG  2155

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2156  TGTGACAGAGCGAGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAACAGTGAATGTTTTAAACTGAATGATAATGTAAATATTA  2229

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2230  TACATCGAACTTATGACATGGGAAAATTAAGAAGCATAAATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTATAATCTC  2303

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2304  AGCACTTTGGGAGGCTGATGCGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAAC  2377

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2378  CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGAGTGCCTATAGTCCCAGCTACTCAGGAG  2451

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2452  GCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAGCCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAG  2525

Query 1894  --------------------------------------------------------------------------  1893
                                                                                      
Sbjct 2526  CCTGGGCGACAGAGTGAGATTCCGTCTCGAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAAATAAAAAAGAAGCATAAC  2599

Query 1894  ----  1893
                
Sbjct 2600  CAGG  2603