Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11582
- Subject:
- XM_011526359.2
- Aligned Length:
- 2052
- Identities:
- 1628
- Gaps:
- 201
Alignment
Query 1 ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC 74
|||||.|.|.|||||.|||.||||.|.|||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||..|
Sbjct 1 ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC 74
Query 75 CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCT-GGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGT 147
|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| |||| ||||||..|||||||||.||||||||
Sbjct 75 CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGAT-AGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGT 147
Query 148 CAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGGAAGCCCA-GAGCCCTTGG-ACAGAAATAAC 219
||||||..|||||||.|..||||||||||.||||||||.||||||..|||| |.|||| || |.|||.|.|||
Sbjct 148 CAGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCC--GGAAGAGACAGAAC 219
Query 220 CCACTGGAACCCAAGAA--CAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCC-------ATGACAGAGCACCATGCGGGGAG 284
||||||||.|| .|.| ||||||||..|||..|||.|||||| ||||||| |||.|||.|
Sbjct 220 CCACTGGAGCC--TGGAGCCAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAG-------TGCAGGGCG 284
Query 285 ATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGAT 358
||||||||||.|||||.|.|.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..||||||||
Sbjct 285 ATACCGCTGCTACTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAGGAT 358
Query 359 TCTA--CAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGAT 430
|||| || .|||||||.||.|.|||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||..|
Sbjct 359 TCTATGCA--GAACCCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCCAGT 430
Query 431 GTGGCTCACAGAAGGGA--TATCACCATTTTGTTC-TGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTG 501
|||...|||.|.|.||| |.|||| .||||||| ||.|| |||| ||||||..||||||||.||||||||
Sbjct 431 GTGATACACTGGACGGACTTCTCAC--GTTTGTTCTTGTTG-AGGA---AGAACAGAAGCTCCCCAGGACCCTG 498
Query 502 GACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAACCCCAGCCACAGGTG 575
.||||||||.||||||.||..|||...|.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||..||||||
Sbjct 499 TACTCACAGAAGCTCCCCAAAGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAGGTG 572
Query 576 GAGGTTCACATGCTATTACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTC 649
||||||||.|||||||||||||||.|.|||.|.|||.|||||||||||..||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 573 GAGGTTCAGATGCTATTACTATTACAGGAAAAACCCTCAGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAGATTC 646
Query 650 TGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAG--AGCC 721
||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||.|||||| |.|.|| ||||
Sbjct 647 TGGTCCCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCC--GCGGAGGCAGCC 718
Query 722 TGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTC 795
|||||||.||||||.||||||||||||||||.||||.|||.||||||||.|||||||||||||.||||.||.||
Sbjct 719 TGACCCTGCAGTGTCGCTCTGATGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTCGTC 792
Query 796 CAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCA 869
|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 CAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCA 866
Query 870 CGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGA-GTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAAC 942
|||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||| ||.| |||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 867 CGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCC-CCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGAC 939
Query 943 ATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACA---CCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGG 1013
||||||||.|||||||.||||..||||| ||| ||||.||.|..|||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 940 ATCCTGATCGCAGGACTGATCCCTGACATACCCG---CCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTCAGG 1010
Query 1014 AGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCC 1087
|||||||||||||||||||||||||||||||...|||.|.|||||||||.||.|||||||.||.||||||||||
Sbjct 1011 AGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCCC 1084
Query 1088 ATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAG-CTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGAC 1160
|||||||.|||.||||.|..||||.|||| .|| ||.|||...||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1085 ATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAGTAC-CAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGTGAC 1157
Query 1161 CTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTG 1234
|||||||||.|..||.||||||.|.||||||.||.||..|||.|||.|||||.||||||||||...|||.|||.
Sbjct 1158 CTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATGCTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTAGTT 1231
Query 1235 AGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCT-CCAGCCTCCCACCCACAGG-GCCGCCCTCCACAC 1306
|.||||.|||.|||.||||||||||||.|||||| ||.| ||||||||.||||.||||| .||.||| ||||||
Sbjct 1232 ACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCCTCTGG-GGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCC-CCACAC 1303
Query 1307 C---------------------------------------------------TGGTCTGGGAAGATACCTGGAG 1329
| ||||||||||||..||||||.|
Sbjct 1304 CTGCAGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGG 1377
Query 1330 GTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCG 1403
|||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 1378 GTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGGCA 1451
Query 1404 TCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGC 1477
|||.|||||||||||||||||.|.|| |||||.|.|||||||||||||||||||.|.||||||
Sbjct 1452 TCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCC------------ATTTCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGC 1513
Query 1478 CCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTG 1551
||||||||..||||||||.||.||||.|||||||||.|||||||.|||||||.||||..|||.|||||||||||
Sbjct 1514 CCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCTGACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCGTG 1587
Query 1552 AAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGA----CAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAG 1621
||||||||||||.|..|||||.||||||||.|||| |.| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1588 AAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGGAGATGGATGCTCCG-CAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAG 1660
Query 1622 TGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAA 1695
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||
Sbjct 1661 TGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAA 1734
Query 1696 TTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTG---------------------- 1747
|||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1735 TTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCAGAAGAGGACAGACAGATGGACACTGAGAGAGTCCTTTCCTCTCCAGG 1808
Query 1748 --------------------------------------------------------AGGCTGCTGCATCTGAAG 1765
||||||||||||||||||
Sbjct 1809 CCCCCAGGCCTCCCCCACCCCCACCACGTTCCTTCCCTCTCACTCTCCCCCGCTGCAGGCTGCTGCATCTGAAG 1882
Query 1766 CCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCC 1839
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1883 CCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCC 1956
Query 1840 CAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1893
||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1957 CAGGAAAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTGGCCATCCAC 2010