Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11614
• Subject: XM_017003238.2
• Aligned Length: 1503
• Identities: 1453
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ATGAACAGGATCCGAAAGTTTTTCCGAGGAAGTGGGCGAGTCTTGGCATTTATCTTTGTAGCTTCTGTCATCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACAGGATCCGAAAGTTTTTCCGAGGAAGTGGGCGAGTCTTGGCATTTATCTTTGTAGCTTCTGTCATCTG  74

Query   75  GCTCCTCTTTGACATGGCAGCTCTCCGCCTCTCATTCAGTGAGATCAACACTCGGGTCATCAAGGAAGACATTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTCCTCTTTGACATGGCAGCTCTCCGCCTCTCATTCAGTGAGATCAACACTCGGGTCATCAAGGAAGACATTG  148

Query  149  TGAGGAGGGAGCGGATAGGATTCAGAGTTCAGCCAGACCAAGGAAAAATTTTTTACAGCAGCATAAAAGAGATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAGGAGGGAGCGGATAGGATTCAGAGTTCAGCCAGACCAAGGAAAAATTTTTTACAGCAGCATAAAAGAGATG  222

Query  223  AAACCTCTCCTAAGGGGACATGGGAAAGGGGCATGGGGCAAAGAGAATGTTAGAAAAACTGAGGAGAGTGTGCT  296
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAACCTCCCCTAAGGGGACATGGGAAAGGGGCATGGGGCAAAGAGAATGTTAGAAAAACTGAGGAGAGTGTGCT  296

Query  297  CAAGGTTGAGGTGGACTTGGACCAAACCCAGAGGGAAAGAAAAATGCAGAATGCCCTGGGAAGGGGCAAGGTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAGGTTGAGGTGGACTTGGACCAAACCCAGAGGGAAAGAAAAATGCAGAATGCCCTGGGAAGGGGCAAGGTTG  370

Query  371  TGCCGTTGTGGCATCCTGCACATCTGCAGACCCTCCCTGTGACTCCTAACAAGCAGAAGACAGACGGGAGAGGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCCGTTGTGGCATCCTGCACATCTGCAGACCCTCCCTGTGACTCCTAACAAGCAGAAGACAGACGGGAGAGGC  444

Query  445  ACCAAACCTGAAGCCTCCTCTCACCAGGGGACACCAAAGCAAACGACAGCTCAGGGGGCTCCAAAGACCTCATT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACCAAACCTGAAGCCTCCTCTCACCAGGGGACACCAAAGCAAACGACAGCTCAGGGGGCTCCAAAGACCTCATT  518

Query  519  CATAGCAGCAAAAGGAACTCAGGTAGTCAAAATATCAGTACACATGGGACGTGTCAGTTTAAAACAGGAGCCCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATAGCAGCAAAAGGAACTCAGGTAGTCAAAATATCAGTACACATGGGACGTGTCAGTTTAAAACAGGAGCCCC  592

Query  593  GGAAGAGTCATAGTCCCAGCAGTGACACATCAAAACTAGCAGCTGAAAGGGACTTGAATGTGACCATCAGTCTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGAAGAGTCATAGTCCCAGCAGTGACACATCAAAACTAGCAGCTGAAAGGGACTTGAATGTGACCATCAGTCTT  666

Query  667  AGTACTGATAGACCAAAGCAGCGATCACAGGCAGTAGCAAACGAGAGGGCACACCCTGCCAGCACAGCAGTGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGTACTGATAGACCAAAGCAGCGATCACAGGCAGTAGCAAACGAGAGGGCACACCCTGCCAGCACAGCAGTGCC  740

Query  741  GAAGTCTGGGGAAGCCATGGCCTTAAACAAAACTAAGACTCAGAGCAAAGAAGTCAATGCAAATAAACACAAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGTCTGGGGAAGCCATGGCCTTAAACAAAACTAAGACTCAGAGCAAAGAAGTCAATGCAAATAAACACAAAG  814

Query  815  CCAATACGAGTCTTCCTTTTCCTAAGTTCACTGTCAATTCAAATCGCTTAAGGAAGCAATCTATTAATGAGACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAATACGAGTCTTCCTTTTCCTAAGTTCACTGTCAATTCAAATCGCTTAAGGAAGCAATCTATTAATGAGACA  888

Query  889  CCTTTGGGAAGTTTGTCAAAGGATGATGGAGCTAGAGGGGCTCATGGGAAGAAACTCAATTTCTCTGAAAGCCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTTTGGGAAGTTTGTCAAAGGATGATGGAGCTAGAGGGGCTCATGGGAAGAAACTCAATTTCTCTGAAAGCCA  962

Query  963  TCTTGTGATTATAACCAAAGAGGAAGAGCAAAAGGCAGACCCCAAAGAGGTCTCTAATTCTAAAACCAAAACAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCTTGTGATTATAACCAAAGAGGAAGAGCAAAAGGCAGACCCCAAAGAGGTCTCTAATTCTAAAACCAAAACAA  1036

Query 1037  TATTTCCTAAAGTATTGGGTAAAAGCCAAAGTAAACACATTTCCAGGAATAGAAGTGAGATGTCTTCCTCTTCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TATTTCCTAAAGTATTGGGTAAAAGCCAAAGTAAACACATTTCCAGGAATAGAAGTGAGATGTCTTCCTCTTCA  1110

Query 1111  CTTGCTCCACATAGAGTGCCACTGTCCCAAACTAACCATGCTTTAACTGGAGGGCTAGAGCCAGCAAAAATCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTTGCTCCACATAGAGTGCCACTGTCCCAAACTAACCATGCTTTAACTGGAGGGCTAGAGCCAGCAAAAATCAA  1184

Query 1185  CATAACTGCCAAAGCCCCCTCTACAGAATACAACCAGAGTCATATAAAAGCCCTTTTACCTGAAGACAGTGGAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATAACTGCCAAAGCCCCCTCTACAGAATACAACCAGAGTCATATAAAAGCCCTTTTACCTGAAGACAGTGGAA  1258

Query 1259  CGCACCAGGTGTTAAGAATTGATGTGACACTTTCTCCAAGGGACCCCAAAGCTCCAGGGCAGTTTGGGCGTCCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGCACCAGGTGTTAAGAATTGATGTGACACTTTCTCCAAGGGACCCCAAAGCTCCAGGGCAGTTTGGGCGTCCT  1332

Query 1333  GTAGTTGTCCCCCATGGAAAGGAGAAGGAGGCAGAAAGAAGATGGAAAGAAGGAAACTTCAATGTCTACCTTAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTAGTTGTCCCCCATGGAAAGGAGAAGGAGGCAGAAAGAAGATGGAAAGAAGGAAACTTCAATGTCTACCTTAG  1406

Query 1407  CGATTTGATCCCAGTGGATAGAGCCATTGAAGACACCAGACCTGCTGGG-------------------------  1455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.                         
Sbjct 1407  CGATTTGATCCCAGTGGATAGAGCCATTGAAGACACCAGACCTGCTGGCACATCTCTTGTGCTCTGCTTATATT  1480

Query 1456  -----------------------  1455
                                   
Sbjct 1481  CTGGCCCAGATGTGCAGAGCAGC  1503