Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11623
• Subject: NM_001146057.1
• Aligned Length: 1160
• Identities: 900
• Gaps: 154

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCTGCAATGAAGCTGCTGGTCGGGACTCTGCGCCTCTGGGAGGTGGGGAGGCAGGTAGCCTTTTCGAGCCT  74

Query    1  ------------------------------------ATGTC-GGGC--CCA-GACGTCGAGACGCCGTCCG--C  32
                                                || || ||||  ||| ||.|       ||.|||.|  |
Sbjct   75  GACGCCTGGCCAGGAGTGTTCGGGGCTCAGGAAAACAT-TCTGGGCTGCCATGAGG-------GCTGTCAGAAC  140

Query   33  CA-TCCAGATC-----------------TGC------------CGGATCATGCGGCCAGATGATGCCAACGTGG  76
            || ..||||||                 |||            .||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  141  CAGAGCAGATCACCAAAAGCTTGGACATTGCGTCACCATGGGAAGGATCATGCGTCCAGATGATGCCAATGTGG  214

Query   77  CCGGCAATGTCCACGGGGGGACCATCCTGAAGATGATCGAGGAGGCAGGCGCCATCATCAGCACCCGGCATTGC  150
            |.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct  215  CTGGCAATGTTCATGGAGGGACCATTCTGAAGATGATTGAGGAGGCCGGGGCCATCATCAGCACGCGGCACTGT  288

Query  151  AACAGCCAGAACGGGGAGCGCTGTGTGGCCGCCCTGGCTCGTGTCGAGCGCACCGACTTCCTGTCTCCCATGTG  224
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  289  AACAGCCAGAATGGGGAGCGCTGTGTGGCTGCCCTGGCACGGGTGGAGCGCACTGACTTCCTGTCACCCATGTG  362

Query  225  CATCGGTGAGGTGGCGCATGTCAGCGCGGAGATCACCTACACCTCCAAGCACTCTGTGGAGGTGCAGGTCAACG  298
            ||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct  363  CATCGGCGAGGTGGCTCATGTCAGTGCAGAGATCACCTACACTTCCAAGCACTCTGTGGAGGTCCAGGTCCACG  436

Query  299  TGATGTCCGAAAACATCCTCACAGGTGCCAAAAAGCTGACCAATAAGGCCACCCTGTGGTATGTGCCCCTGTCG  372
            |||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct  437  TGATGTCGGAGAACATCCTCACAGGTACCAAAAAGCTGACCAATAAAGCCACCTTGTGGTATGTGCCCCTGTCA  510

Query  373  CTGAAGAATGTGGACAAGGTCCTCGAGGTGCCTCCTGTTGTGTATTCCCGGCAGGAGCAGGAGGAGGAGGGCCG  446
            .||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||||..|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  511  TTGAAGAATGTGGACAAGGTCCTTGAGGTGCCTCCCATTGTGTATTTACGGCAGGAGCAGGAGGAGGAGGGTCG  584

Query  447  GAAGCGGTATGAAGCCCAGAAGCTGGAGCGCATGGAGACCAAGTGGAGGAACGGGGACATCGTCCAGCCAGTCC  520
            |||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  585  GAAACGCTATGAAGCCCAGAAGCTGGAACGCATGGAGACCAAGTGGAGGAACGGAGACATTGTCCAGCCTGTCC  658

Query  521  TCAACCCAGAGCCGAACACTGTCAGCTACAGCCAGTCCAGCTTGATCCACCTGGTGGGGCCTTCAGACTGCACC  594
            |.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  659  TGAACCCAGAGCCGAACACGGTGAGCTACAGCCAGTCCAGCCTGATCCACCTGGTGGGGCCCTCGGACTGCACC  732

Query  595  CTGCACGGCTTTGTGCACGGAGGTGTGACCATGAAGCTCATGGATGAGGTCGCCGGGATCGTGGCTGCACGCCA  668
            ||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  733  CTTCATGGCTTCGTGCACGGAGGTGTCACCATGAAGCTCATGGATGAGGTGGCTGGGATTGTGGCTGCACGCCA  806

Query  669  CTGCAAGACCAACATCGTCACAGCTTCCGTGGACGCCATTAATTTTCATGACAAGATCAGAAAAGGCTGCGTCA  742
            |||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.||||||||.||||
Sbjct  807  CTGCAAGACCAACATAGTAACTGCCTCTGTGGATGCCATCAATTTCCACGACAAGATCCGGAAAGGCTGTGTCA  880

Query  743  TCACCATCTCGGGACGCATGACCTTCACGAGCAATAAGTCCATGGAGATCGAGGTGTTGGTGGACGCCGACCCT  816
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||.||||||
Sbjct  881  TCACCATCTCCGGACGCATGACCTTCACAAGCAATAAGTCCATGGAGATTGAGGTCCTGGTGGACGCTGACCCT  954

Query  817  GTTGTGGACAGCTCTCAGAAGCGCTACCGGGCCGCCAGTGCCTTCTTCACCTACGTGTCGCTGAGCCAGGAAGG  890
            ||.|||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||
Sbjct  955  GTGGTGGACAACTCACAAAAGCGCTACCGGGCCGCCAGTGCCTTCTTCACCTACGTGTCCCTGAACCAGGAGGG  1028

Query  891  CAGGTCGCTGCCTGTGCCCCAGCTGGTGCCCGAGACCGAGGACGAGAAGAAGCGCTTTGAGGAAGGCAAAGGGC  964
            ||.|.|..||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1029  CAAGCCAATGCCTGTGCCTCAGCTTGTGCCAGAGACGGAGGATGAGAAGAAGCGCTTCGAAGAAGGCAAAGGCC  1102

Query  965  GGTACCTGCAGATGAAGGCGAAGCGACAGGGCCACGCGGAGCCTCAGCCC  1014
            |.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1103  GTTATCTGCAGATGAAGGCGAAGCGACAGGGCCACACAGAGCCTCAGCCC  1152