Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11627
- Subject:
- XM_006499451.2
- Aligned Length:
- 1683
- Identities:
- 1421
- Gaps:
- 105
Alignment
Query 1 ATGATCATGTTAGCAGTTGGTGAAGTTGAGGATAGCATTTTTAAAAAGAGAAAGGATGATGAGGACAGTTTTAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AAGACGACAGAAAGAAAAAAGAAAGAGAATGAAGAGAGATCAACCAGCTTTCACTCCTAGTGGAATATTAACTC 148
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1 ----------------------------ATGAAGAGAGATCAACCAGCTTTTACTCCTAGTGGAATATTAACAC 46
Query 149 CTCATGCCTTGGGTTCAAGAAATTCACCAGGTTCTCAAGTAGCCAGTAATCCGAGACAAGCAGCCTATGAAATG 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 47 CTCATGCCTTGGGTTCAAGAAATTCACCAGGTTGTCAAGTAGCCAGTAATCCAAGACAAGCAGCCTATGAAATG 120
Query 223 AGGATGCAGAATAACTCTAGTCCTTCGATATCTCCTAATACGAGTTTCACATCTGATGGCTCCCCGTCTCCATT 296
||||||||||..||||||||||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct 121 AGGATGCAGAGAAACTCTAGTCCTTCAATATCTCCTAATACAAGTTTTGCATCTGATGGCTCCCCATCTCCACT 194
Query 297 AGGAGGAATTAAGCGAAAAGCAGAAGACAGTGACAGTGAACCTGAGCCAGAGGATAATGTCAGGTTATGGGAAG 370
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 195 AGGAGGAATTAAGAGAAAAGCAGAAGACAGTGACAGTGAGCCAGAGCCAGAGGATAACGTCAGGTTATGGGAAG 268
Query 371 CTGGCTGGAAGCAGCGGTACTACAAGAACAAATTTGATGTGGATGCAGCTGATGAGAAATTCCGTCGGAAAGTT 444
||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 269 CTGGTTGGAAGCAACGATACTACAAGAACAAATTTGATGTAGATGCAGCTGATGAGAAATTCCGACGTAAGGTT 342
Query 445 GTGCAGTCGTACGTTGAAGGACTTTGCTGGGTTCTTAGATATTATTACCAGGGCTGTGCTTCCTGGAAGTGGTA 518
||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 GTTCAGTCCTACGTTGAAGGACTGTGCTGGGTTCTTCGCTATTATTACCAGGGCTGTGCTTCCTGGAAGTGGTA 416
Query 519 TTATCCATTTCATTATGCACCATTTGCTTCAGACTTTGAAGGCATTGCAGACATGCCATCTGATTTTGAGAAGG 592
|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||.|||||.||||
Sbjct 417 TTATCCATTCCATTATGCACCATTTGCCTCAGACTTTGAAGGTATTGCAGACATGTCCTCTGAATTTGAAAAGG 490
Query 593 GTACGAAACCGTTTAAACCACTAGAACAACTTATGGGGGTATTTCCAGCTGCAAGTGGTAATTTTCTACCTCCA 666
|.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 491 GCACAAAACCGTTTAAGCCACTGGAACAACTAATGGGGGTTTTCCCAGCTGCAAGTGGTAACTTTCTACCTCCA 564
Query 667 TCATGGCGGAAGCTCATGAGTGATCCTGATTCTAGTATAATTGACTTCTATCCTGAAGATTTTGCTATTGATTT 740
.||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 565 ACATGGCGGAAGCTCATGAGTGACCCTGATTCCAGTATAATTGACTTCTATCCTGAAGATTTTGCTATTGATTT 638
Query 741 GAATGGGAAGAAATATGCATGGCAAGGTGTTGCTCTCTTGCCATTCGTGGATGAGCGAAGGCTACGAGCTGCCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 639 GAATGGGAAGAAATATGCATGGCAAGGTGTTGCTCTATTGCCATTTGTGGATGAGCGAAGGCTGCGAGCGGCTC 712
Query 815 TAGAAGAGGTATACCCAGACCTCACTCCAGAAGAGACCAGAAGAAACAGCCTTGGAGGTGATGTCTTATTTGTG 888
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 713 TAGAAGAGGTGTACCCAGACCTCACTCCAGAAGAGAACAGGAGAAATAGTCTTGGAGGTGATGTTTTGTTTGTG 786
Query 889 GGGAAACATCACCCACTCCATGACTTCATTTTAGAGCTGTACCAGACAGGTTCCACAGAGCCAGTGGAGGTACC 962
||.||||.|||.|||||.|..||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 787 GGAAAACTTCATCCACTACGCGACTTCATTTTAGAGCTGTATCAGACGGGTTCCACAGAGCCAGTTGATGTGCC 860
Query 963 CCCTGAACTATGTCATGGGATTCAAGGAAAGTTTTCTTTGGATGAAGAAGCCATTCTTCCAGATCAAATAGTAT 1036
.||||||.|.|||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 861 ACCTGAATTGTGTCACGGGATTCAAGGGACGTTTTCTTTGGATGAAGAAGCCATTCTTCCAGACCAAACAGTAT 934
Query 1037 GTTCTCCTGTTCCTATGTTAAGGGATCTGACACAGAACACTGTAGTCAGTATTAATTTTAAAGACCCACAGTTT 1110
||||.|||||.||.|||||..||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 935 GTTCCCCTGTGCCCATGTTGCGGGACCTGACACAGAACACTGCAGTCAGTATTAATTTTAAAGATCCACAGTTT 1008
Query 1111 GCTGAAGATTACATTTTTAAAGCTGTAATGCTTCCAGGAGCAAGAAAGCCAGCAGCAGTACTGAAACCTAGTGA 1184
|||||||||||..||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||.||||
Sbjct 1009 GCTGAAGATTATGTTTTTAAAGCTGCAATGCTTCCAGGAGCAAGAAAGCCAGCAACAGTTCTGAAACCTGGTGA 1082
Query 1185 CTGGGAAAAATCCAGCAATGGACGGCAGTGGAAGCCTCAGCTTGGCTTTAACCGTGACCGGAGGCCTGTGCACC 1258
|||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.||||
Sbjct 1083 CTGGGAAAAATCCAGCAATGGGCGGCAATGGAAACCTCAGCTTGGCTTTAACCGGGACCGGCGGCCTGTTCACC 1156
Query 1259 TGGATCAGGCAGCCTTCAGGACTTTGGGCCATGTGATGCCAAGAGGCTCAGGAACTGGCATTTACAGCAATGCT 1332
||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|..|||||||||||.||.||..|..||||.|..||..||
Sbjct 1157 TGGACCAGGCAGCCTTTAGAACTTTAGGCCATGTTACACCAAGAGGCTCGGGGACGAGTGTTTATACGAACACT 1230
Query 1333 GCACCACCACCTGTGACTTACCAGGGAAACTTATACAGGCCGCTTTTGAGAGGACAAGCCCAGATTCCAAAACT 1406
||||.||||||||..|.|||||||||.|||...||||||||.||..|||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1231 GCACTACCACCTGCCAATTACCAGGGGAACAATTACAGGCCACTGCTGAGAGGTCAAGCTCAGATCCCAAAACT 1304
Query 1407 TATGTCAAATATGAGGCCCCAGGATTCCTGGCGAGGTCCTCCTCCCCTTTTCCAGCAGCAAAGGTTTGACAGAG 1480
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||.
Sbjct 1305 TATGTCAAATATGAGGCCCCAAGATTCCTGGCGAGGCCCTCCTCCTCTTTTCCAGCAGCATAGATTTGAGAGAA 1378
Query 1481 GCGTTGGGGCTGAACCTCTGCTCCCATGGAACCGGATGCTGCAAACCCAGAATGCAGCCTTCCAGCCAAACCAG 1554
|.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||||.|||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1379 GTGTTGGAGCTGAACCTCTACTGCCATGGAACCGGATGATCCAAAACCAAAATGCAGCCTTTCAGCCAAATCAG 1452
Query 1555 TACCAGATGCTAGCTGGGCCTGGTGGGTATCCACCCAGACGAGATGAT---CGTGGAGGGAGACAGGGATATCC 1625
|||||||||||||..||.|||||.||.||||||||||||||.||.||| ||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1453 TACCAGATGCTAGGAGGACCTGGAGGCTATCCACCCAGACGTGACGATCACCGAGGAGGGAGACAGGGATATCC 1526
Query 1626 CAGAGAAGGAAGGAAATACCCTTTGCCACCACCCTCAGGAAGATACAATTGGAAT 1680
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||
Sbjct 1527 CAGAGAAGGACGGAAATACCCTTTGCCACCACCCTCGGGAAGATACAGTTGGAAT 1581