Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11649
• Subject: XM_006499015.2
• Aligned Length: 946
• Identities: 795
• Gaps: 35

Alignment

Query   1  ATGTCCTTGAAGCTTCAGGCAAGCAATGTAACCAACAAGAATGACCCCAAGTCCATCAACTCTCGAGTCTTCAT  74
           ||||||||||||.|||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct   1  ATGTCCTTGAAGATTCAGACCAGCAATGTAACCAACAAGAATGACCCTAAGTCCATCAACTCTCGGGTCTTCAT  74

Query  75  TGGAAACCTCAACACAGCTCTGGTGAAGAAATCAGATGTGGAGACCATCTTCTCTAAGTATGGCCGTGTGGCCG  148
           .|||||.||.|||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct  75  CGGAAATCTAAACACAGCTGTGGTGAAGAAGTCAGATGTGGAGACCATCTTTTCCAAGTACGGCCGAGTGGCTG  148

Query 149  GCTGTTCTGTGCACAAGGGCTATGCCTTTGTTCAGTACTCCAATGAGCGCCATGCCCGGGCAGCTGTGCTGGGA  222
           |.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GTTGCTCTGTGCACAAAGGCTATGCTTTTGTCCAGTATGCCAATGAGCGCCATGCCCGGGCAGCTGTGCTGGGA  222

Query 223  GAGAATGGGCGGGTGCTGGCCGGGCAGACCCTGGACATCAACATGGCTGGAGAGCCTAAGCCTGACAGACCCAA  296
           ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||
Sbjct 223  GAGAATGGGCGGGTGCTGGCTGGACAGACCCTGGACATCAACATGGCTGGAGAGCCCAAGCCTAATAGACCCAA  296

Query 297  GGGGCTAAAGAGAGCAGCATCTGCCATATACAGTGGCTACATCTTTGACTATGATTACTACCGGGACGACTTCT  370
           |||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||.||||||
Sbjct 297  GGGGCTAAAGAGAGCAGCAACTGCCATCTACAGTGGCTACAGCTTTGACTATGATTACTACCAAGACTACTTCT  370

Query 371  ACGACAGGCTCTTCGACTACCGGGGCCGTCTGTCGCCCGTGCCAGTGCCCAGGGCGGTCCCTGTGAAGCGACCC  444
           ..|.||||||.||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 371  GTGCCAGGCTGTTTGATTATCGAGGCCGCCTTTCTCCAGTGCCTGTGCCCAGGGCAGTTCCGGTGAAGCGACCC  444

Query 445  CGGGTCACAGTCCCTTTGGTCCGGCGTGTCAAAACTAACG-TACCTGTCAAGCTCTTTGCCCGCTCCACAGCTG  517
           ||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CGTGTTACAGTCCCTTTGGTTCGCCGTGTCAAAACT-ACGATACCTGTCAAGCTCTTTGCCCGCTCCACAGCTG  517

Query 518  TCACCACCAGCTCAGCCAAGATCAAGTTAAAGAGCAGTGAGCTGCAGGCCATCAAGACGGAGCTGACACAGATC  591
           ||||.||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 518  TCACTACTGGCTCAGCCAAAATCAAGTTAAAGAGCAGTGAGCTACAGACCATCAAAACAGAGCTGACACAGATC  591

Query 592  AAGTCCAATATCGATGCCCTGCTGAGCCGCTTGGAGCAGATCGCTGCGGAGCAAAAGGCCAATCCAGATGGCAA  665
           ||||||||.||||||||||||.||.|.||||||||.|||||.||||.|||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 592  AAGTCCAACATCGATGCCCTGTTGGGTCGCTTGGAACAGATTGCTGAGGAACAGAAGGCCAACCCAGATGGCAA  665

Query 666  GAAGAAGGGTGA------------TGGAGGTGGCGCCAGCGGCGGCGGCGGCGG------------TGGTGGTG  715
           ||||||||||||            ||||||.||.|.||||.|.||.||.|||||            ||||||||
Sbjct 666  GAAGAAGGGTGACAGCAGCAGTGGTGGAGGAGGAGGCAGCAGTGGTGGAGGCGGCAGTAGCAATGTTGGTGGTG  739

Query 716  GCAGCGGTGGCGGTGGCAGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGCAGCAGCCGGCCACCAGCCCCCCAAGAGAACACA  789
           |||||   .||||.|||||.|     ||.|.| ||.|..||||||||||||.||||||.||||||||..||||.
Sbjct 740  GCAGC---AGCGGCGGCAGCG-----GGAGCT-GCAGCAGCAGCAGCCGGCTACCAGCGCCCCAAGAAGACACG  804

Query 790  ACTTCTGAGGCAGGCCTGCCCCAGGGGGAAGCACGGACCCGAGACGACGGCGATGAGGAAGGGCTCCTGACACA  863
           .||||||||||||||...|||||.||.||||..|..||.|||||.||.||.||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 805  GCTTCTGAGGCAGGCACACCCCAAGGAGAAGTCCAAACTCGAGATGATGGTGATGAGGAGGGACTGCTAACACA  878

Query 864  CAGCGAGGAAGAGCTGGAACACAGCCAGGACACAGACGCGGATGATGGGGCCTTGCAG  921
           .||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 879  TAGCGAGGAGGAGCTGGAGCACAGCCAGGACACAGATGCAGAAGATGGAGCCTTGCAG  936