Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11677
• Subject: XM_011543284.2
• Aligned Length: 2526
• Identities: 1785
• Gaps: 738

Alignment

Query    1  ATGAAACCAGGAGGCTTTTGGCTGCATCTCACACTGCTCGGAGCCTCCCTGCCGGCTGCGCTGGGATGGATGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAACCAGGAGGCTTTTGGCTGCATCTCACACTGCTCGGAGCCTCCCTGCCGGCTGCGCTGGGATGGATGGA  74

Query   75  CCCAGGAACCAGCAGAGGCCCGGATGTGGGTGTGGGGGAGTCACAGGCAGAGGAGCCCAGAAGCTTTGAAGTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCAGGAACCAGCAGAGGCCCGGATGTGGGTGTGGGGGAGTCACAGGCAGAGGAGCCCAGAAGCTTTGAAGTCA  148

Query  149  CAAGAAGAGAAGGGCTTTCCAGCCACAACGAGCTGCTGGCCTCCTGCGGGAAGAAGTTCTGCAGCCGAGGGAGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAGAAGAGAAGGGCTTTCCAGCCACAACGAGCTGCTGGCCTCCTGCGGGAAGAAGTTCTGCAGCCGAGGGAGC  222

Query  223  CGGTGCGTGCTCAGCAGGAAGACAGGGGAGCCCGAATGCCAGTGCCTGGAGGCATGCAGGCCCAGCTACGTGCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGTGCGTGCTCAGCAGGAAGACAGGGGAGCCCGAATGCCAGTGCCTGGAGGCATGCAGGCCCAGCTACGTGCC  296

Query  297  TGTGTGCGGCTCTGATGGGAGGTTTTATGAAAACCACTGTAAGCTCCACCGTGCTGCTTGCCTCCTGGGAAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTGTGCGGCTCTGATGGGAGGTTTTATGAAAACCACTGTAAGCTCCACCGTGCTGCTTGCCTCCTGGGAAAGA  370

Query  371  GGATCACCGTCATCCACAGCAAGGACTGTTTCCTCAAAGGTGACACGTGCACCATGGCCGGCTACGCCCGCTTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGATCACCGTCATCCACAGCAAGGACTGTTTCCTCAAAGGTGACACGTGCACCATGGCCGGCTACGCCCGCTTG  444

Query  445  AAGAATGTCCTTCTGGCACTCCAGACCCGTCTGCAGCCACTCCAAGAAGGAGACAGCAGACAAGACCCTGCCTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAATGTCCTTCTGGCACTCCAGACCCGTCTGCAGCCACTCCAAGAAGGAGACAGCAGACAAGACCCTGCCTC  518

Query  519  CCAGAAGCGCCTCCTGGTGGAATCTCTGTTCAGGGACTTAGATGCAGATGGCAATGGCCACCTCAGCAGCTCCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCAGAAGCGCCTCCTGGTGGAATCTCTGTTCAGGGACTTAGATGCAGATGGCAATGGCCACCTCAGCAGCTCCG  592

Query  593  AACTGGCTCAGCATGTGCTGAAGAAGCAGGACCTGGATGAAGACTTACTTGGTTGCTCACCAGGTGACCTCCTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AACTGGCTCAGCATGTGCTGAAGAAGCAGGACCTGGATGAAGACTTACTTGGTTGCTCACCAGGTGACCTCCTC  666

Query  667  CGATTTGACGATTACAACAGTGACAGCTCCCTGACCCTCCGCGAGTTCTACATTGCCTTCCAAGTGGTTCAGCT  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGATTTGACGATTACAACAGTGACAGCTCCCTGACCCTCCGCGAGTTCTACATGGCCTTCCAAGTGGTTCAGCT  740

Query  741  CAGCCTCGCCCCCGAGGACAGGGTCAGTGTGACCACAGTGACCGTGGGGCTGAGCACAGTGCTGACCTGCGCCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGCCTCGCCCCCGAGGACAGGGTCAGTGTGACCACAGTGACCGTGGGGCTGAGCACAGTGCTGACCTGCGCCG  814

Query  815  TCCATGGAGACCTGAGGCCACCAATCATCTGGAAGCGCAACGGGCTCACCCTGAACTTCCTGGACTTGGAAGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCATGGAGACCTGAGGCCACCAATCATCTGGAAGCGCAACGGGCTCACCCTGAACTTCCTGGACTTGGAAGAC  888

Query  889  ATCAATGACTTTGGAGAGGATGATTCCCTGTACATCACCAAGGTGACCACCATCCACATGGGCAATTACACCTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATCAATGACTTTGGAGAGGATGATTCCCTGTACATCACCAAGGTGACCACCATCCACATGGGCAATTACACCTG  962

Query  963  CCATGCTTCCGGCCACGAGCAGCTGTTCCAGACCCACGTCCTGCAGGTGAATGTGCCGCCAGTCATCCGTGTCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCATGCTTCCGGCCACGAGCAGCTGTTCCAGACCCACGTCCTGCAGGTGAATGTGCCGCCAGTCATCCGTGTCT  1036

Query 1037  ATCCAGAGAGCCAGGCACAGGAGCCTGGAGTGGCAGCCAGCCTAAGATGCCATGCTGAGGGCATTCCCATGCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATCCAGAGAGCCAGGCACAGGAGCCTGGAGTGGCAGCCAGCCTAAGATGCCATGCTGAGGGCATTCCCATGCCC  1110

Query 1111  AGAATCACTTGGCTGAAAAACGGCGTGGATGTCTCAACTCAGATGTCCAAACAGCTCTCCCTTTTAGCCAATGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGAATCACTTGGCTGAAAAACGGCGTGGATGTCTCAACTCAGATGTCCAAACAGCTCTCCCTTTTAGCCAATGG  1184

Query 1185  GAGCGAACTCCACATCAGCAGTGTTCGGTATGAAGACACAGGGGCATACACCTGCATTGCCAAAAATGAAGTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGCGAACTCCACATCAGCAGTGTTCGGTATGAAGACACAGGGGCATACACCTGCATTGCCAAAAATGAAGTGG  1258

Query 1259  GTGTGGATGAAGATATCTCCTCGCTCTTCATTGAAGACTCAGCTAGAAAGACCCTTGCAAACATCCTGTGGCGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct 1259  GTGTGGATGAAGATATCTCCTCGCTCTTCATTGAAGACTCAGCTAGAAAGACCC--------------------  1312

Query 1333  GAGGAAGGCCTCAGCGTGGGAAACATGTTCTATGTCTTCTCCGACGACGGTATCATCGTCATCCATCCTGTGGA  1406
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313  -------GCCTCAGCGTGGGAAACATGTTCTATGTCTTCTCCGACGACGGTATCATCGTCATCCATCCTGTGGA  1379

Query 1407  CTGTGAGATCCAGAGGCACCTCAAACCCACGGAAAAGATTTTCATGAGCTATGAAGAAATCTGTCCTCAAAGAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380  CTGTGAGATCCAGAGGCACCTCAAACCCACGGAAAAGATTTTCATGAGCTATGAAGAAATCTGTCCTCAAAGAG  1453

Query 1481  AAAAAAATGCAACCCAGCCCTGCCAGTGGGTATCTGCAGTCAATGTCCGGAACCGGTACATCTATGTGGCCCAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454  AAAAAAATGCAACCCAGCCCTGCCAGTGGGTATCTGCAGTCAATGTCCGGAACCGGTACATCTATGTGGCCCAG  1527

Query 1555  CCAGCACTGAGCAGAGTCCTTGTGGTCGACATCCAAGCCCAGAAAGTCCTACAGTCCATAGGTGTGGACCCTCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1528  CCAGCACTGAGCAGAGTCCTTGTGGTCGACATCCAAGCCCAGAAAGTCCTACAGTCCATAGGTGTGGACCCTCT  1601

Query 1629  GCCGGCTAAGCTGTCCTATGACAAGTCACATGACCAAGTGTGGGTCCTGAGCTGGGGGGACGTGCACAAGTCCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602  GCCGGCTAAGCTGTCCTATGACAAGTCACATGACCAAGTGTGGGTCCTGAGCTGGGGGGACGTGCACAAGTCCC  1675

Query 1703  GACCAAGTCTCCAGGTGATCACAGAAGCCAGCACCGGCCAGAGCCAGCACCTCATCCGCACACCCTTTGCAGGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676  GACCAAGTCTCCAGGTGATCACAGAAGCCAGCACCGGCCAGAGCCAGCACCTCATCCGCACACCCTTTGCAGGA  1749

Query 1777  GTGGATGATTTCTTCATTCCCCCAATAAACCT-----TGAA------CAG------------------------  1815
            |||||||||||||||||||||||||.||||||     |.||      |||                        
Sbjct 1750  GTGGATGATTTCTTCATTCCCCCAACAAACCTCATCATCAACCACATCAGGTTTGGCTTCATCTTCAACAAGTC  1823

Query 1816  --------------------------------------------------------------------------  1815
                                                                                      
Sbjct 1824  TGATCCTGCAGTCCACAAGGTGGACCTGGAAACAATGATGCCCCTCAAGACCATCGGCCTGCACCACCATGGCT  1897

Query 1816  --------------------------------------------------------------------------  1815
                                                                                      
Sbjct 1898  GCGTGCCCCAGGCCATGGCACACACCCACCTGGGCGGCTACTTCTTCATCCAGTGCCGACAGGACAGCCCCGCC  1971

Query 1816  --------------------------------------------------------------------------  1815
                                                                                      
Sbjct 1972  TCTGCTGCCCGACAGCTGCTCGTTGACAGTGTCACAGACTCTGTGCTTGGCCCCAATGGTGATGTAACAGGCAC  2045

Query 1816  --------------------------------------------------------------------------  1815
                                                                                      
Sbjct 2046  CCCACACACATCCCCCGACGGGCGCTTCATAGTCAGTGCTGCAGCTGACAGCCCCTGGCTGCACGTGCAGGAGA  2119

Query 1816  --------------------------------------------------------------------------  1815
                                                                                      
Sbjct 2120  TCACAGTGCGGGGCGAGATCCAGACCCTGTATGACCTGCAAATAAACTCGGGCATCTCAGACTTGGCCTTCCAG  2193

Query 1816  --------------------------------------------------------------------------  1815
                                                                                      
Sbjct 2194  CGCTCCTTCACTGAAAGCAATCAATACAACATCTACGCGGCTCTGCACACGGAGCCGGACCTGCTGTTCCTGGA  2267

Query 1816  --------------------------------------------------------------------------  1815
                                                                                      
Sbjct 2268  GCTGTCCACGGGGAAGGTGGGCATGCTGAAGAACTTAAAGGAGCCACCCGCAGGGCCAGCTCAGCCCTGGGGGG  2341

Query 1816  --------------------------------------------------------------------------  1815
                                                                                      
Sbjct 2342  GTACCCACAGAATCATGAGGGACAGTGGGCTGTTTGGACAGTACCTCCTCACACCAGCCCGAGAGTCACTGTTC  2415

Query 1816  --------------------------------------------------------------------------  1815
                                                                                      
Sbjct 2416  CTCATCAATGGGAGACAAAACACGCTGCGGTGTGAGGTGTCAGGTATAAAGGGGGGGACCACAGTGGTGTGGGT  2489

Query 1816  ----------  1815
                      
Sbjct 2490  GGGTGAGGTA  2499