Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11706
- Subject:
- NM_001311139.1
- Aligned Length:
- 1263
- Identities:
- 853
- Gaps:
- 391
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 MSGGGGGGGSAPSRFADYFVICGLDTETGLEPDELSGENFEQTPLRRTFKSKVLARYPENVDWNPFDQDAVGML 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CMPKGLAFKTQADPREPQFHAFIITREDGSRTFGFALTFYEEVTSKQICSAMQTLYHMHNAEYDVLHAPLADGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 DQSGMEDGEGIPGTKLQRFNSYDISRDTLYVSKCICLITPMSFMKACRSVLQQLHQAVTSPQPPPLPLESYIYN 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 VLYEVPLPPPGRSLKFSGVYGPIICQRPSTNELPLFDFPVKEVFELLGVENVFQLFTCALLEFQILLYSQHYQR 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 LMTVAETITALMFPFQWQHVYVPILPASLLHFLDAPVPYLMGLHSNGLDDRSKLELPQEANLCFVDVDNHFIEL 370
Query 1 ---------------------MAFGIPPEGNLHCSESASKLKRLRASELVSDKRNGNIAGSPLHSYELLKENET 53
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Sbjct 371 PEDLPQFPNKLEFVQEVSEILMAFGVPPEGNLHCSESASKLKRIRASELVSDKRNGNIAGSPLHSYELLKENET 444
Query 54 IARLQALVKRTGVSLEKLEVREDPSSNKDLKVQCDEEELRIYQLNIQIREVFANRFTQMFADYEVFVIQPSQDK 127
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Sbjct 445 IARLQALVKRTGVSLEKLEVREDPSSNKDFKVQCDEEELRIYQLNIQIREVFANRFTQMFADYEVFVIQPSQDK 518
Query 128 ESWFTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRFLETQMFASFIDNKIMCHDDDDKDPVLRVFDSRVDKIRLLNV 201
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Sbjct 519 ESWFTNREQMQNFDKASFLSDQPEPYLPFLSRFLETQMFASFIDNKIMCHDDDDKDPVLRVFDSRVDKIRLLNV 592
Query 202 RTPTLRTSMYQKCTTVDEAEKAIELRLAKIDHTAIHPHLLDMKIGQGKYEPGFFPKLQSDVLSTGPASNKWTKR 275
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Sbjct 593 RTPTLRTSMYQKCTTVDEAEKAIELRLAKIDHTAVHPHLLDMKIGQGKYEPGFFPKLQSDVLCTGPASNKWTKR 666
Query 276 NAPAQWRRKDRQKQHTEHLRLDNDQREKYIQEARTMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKR 349
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Sbjct 667 NAPAQWRRKDRQKQHTEHLRLDNDQREKYIQEARNMGSTIRQPKLSNLSPSVIAQTNWKFVEGLLKECRNKTKR 740
Query 350 MLVEKMGREAVELGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQDNRQRKLTSGSLS 423
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Sbjct 741 MLVEKMGREAVELGHGEVNITGVEENTLIASLCDLLERIWSHGLQVKQGKSALWSHLLHYQENRQRKLTSGSLS 814
Query 424 TSGILLDSERRKSDASSLMPPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTK 497
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Sbjct 815 TSGILLDSERRKSDASAVMSPLRISLIQDMRHIQNIGEIKTDVGKARAWVRLSMEKKLLSRHLKQLLSDHELTK 888
Query 498 KLYKRYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGET 571
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Sbjct 889 KLYKRYAFLRCDDEKEQFLYHLLSFNAVDYFCFTNVFTTILIPYHILIVPSKKLGGSMFTANPWICISGELGET 962
Query 572 QIMQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVEYVMVRNEITGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERI 645
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Sbjct 963 QILQIPRNVLEMTFECQNLGKLTTVQIGHDNSGLYAKWLVECVMVRNEVTGHTYKFPCGRWLGKGMDDGSLERV 1036
Query 646 LVGELLTSQPEVDERPCRTPPLQQSPSVIRRLVTISPNNKPKLNTGQIQESIGEAVNGIVKHFHKPEKERGSLT 719
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Sbjct 1037 LVGELLTSLPEVDERPCRTPPLQQSPSVIRRLVTISPNNKPKLNTGQIQESIGEAVNGIVKHFHKPEKERGSLT 1110
Query 720 LLLCGECGLVSALEQAFQHGFKSPRLFKNVFIWDFLEKAQTYYETLEKNEVVPEENWHTRARNFCRFVTAINNT 793
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Sbjct 1111 LLLCGECGLVSALEQAFQHGFKSPRLFKNVFIWDFLEKAQTYYETLEQNDVVPEENWHTRARNFCRFVTAVNNT 1184
Query 794 PRNIGKDGKFQMLVCLGARDHLLHHWIALLADCPITAHMYEDVALIKDHTLVNSLIRVLQTLQEFNITLETSLV 867
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Sbjct 1185 PRNIGKDGKFQMLVCLGARDHLLHHWIALLADCPITAHMYEDVALIKDHTLVNSLIRVLQTLQEFNITLDTSLV 1258
Query 868 KGIDI 872
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Sbjct 1259 KGIDI 1263