Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11723
- Subject:
- XM_017022037.1
- Aligned Length:
- 2628
- Identities:
- 2096
- Gaps:
- 525
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCACGACGCTTTCGAGCCAGTGCCGATCCTAGAAAAGCTGCCTCTGCAAATCGACTGTCTGGCTGCCTGGGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGAATGGCTTCTTGTGGGAACCAAACAAGGACATCTTCTTCTCTATAGGATTCGGAAGGACGTTGGTTGCAACA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GATTTGAAGTGACACTAGAGAAATCCAATAAGAACTTCTCCAAAAAGATTCAGCAGATCCATGTGGTTTCCCAG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TTTAAGATTCTGGTCAGCTTGTTAGAAAATAACATTTATGTCCATGACCTATTGACATTTCAACAAATCACTAC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GGTTTCAAAGGCAAAGGGAGCATCACTGTTTACTTGTGACCTCCAGCACACAGAGACCGGTGAGGAGGTGTTAC 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 GGATGTGTGTGGCAGTAAAAAAGAAGCTGCAGCTCTATTTCTGGAAGGACAGGGAATTTCATGAATTGCAGGGG 444
Query 1 ------------------------------ATGGCGTGGTGTGAAAATTCTATCTGTGTGGGTTTCAAGAGAGA 44
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GACTTTAGTGTGCCAGATGTGCCCAAGTCCATGGCGTGGTGTGAAAATTCTATCTGTGTGGGTTTCAAGAGAGA 518
Query 45 CTACTACCTAATAAGGGTGGATGGAAAGGGGTCCATCAAAGAGCTCTTTCCAACAGGAAAACAGCTGGAGCCCT 118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTACTACCTAATAAGGGTGGATGGAAAGGGGTCCATCAAAGAGCTCTTTCCAACAGGAAAACAGCTGGAGCCCT 592
Query 119 TAGTTGCACCTCTGGCAGATGGAAAAGTGGCTGTGGGCCAGGATGATCTCACCGTGGTACTCAATGAGGAAGGG 192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TAGTTGCACCTCTGGCAGATGGAAAAGTGGCTGTGGGCCAGGATGATCTCACCGTGGTACTCAATGAGGAAGGG 666
Query 193 ATCTGCACACAGAAATGTGCCCTGAACTGGACGGACATACCAGTGGCCATGGAGCACCAGCCTCCCTACATCAT 266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATCTGCACACAGAAATGTGCCCTGAACTGGACGGACATACCAGTGGCCATGGAGCACCAGCCTCCCTACATCAT 740
Query 267 TGCAGTGTTGCCTCGATATGTTGAGATCCGAACATTTGAACCGAGGCTTCTGGTCCAAAGCATTGAATTGCAAA 340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCAGTGTTGCCTCGATATGTTGAGATCCGAACATTTGAACCGAGGCTTCTGGTCCAAAGCATTGAATTGCAAA 814
Query 341 GGCCCCGTTTCATTACCTCAGGAGGATCAAACATTATCTATGTGGCCAGCAATCATTTTGTTTGGAGACTCATC 414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGCCCCGTTTCATTACCTCAGGAGGATCAAACATTATCTATGTGGCCAGCAATCATTTTGTTTGGAGACTCATC 888
Query 415 CCTGTCCCCATGGCAACCCAAATCCAACAACTTCTCCAGGACAAGCAGTTTGAATTGGCTCTGCAGCTCGCAGA 488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCTGTCCCCATGGCAACCCAAATCCAACAACTTCTCCAGGACAAGCAGTTTGAATTGGCTCTGCAGCTCGCAGA 962
Query 489 AATGAAAGATGATTCTGACAGTGAAAAGCAGCAACAAATTCATCACATCAAGAACTTGTATGCCTTCAACCTCT 562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AATGAAAGATGATTCTGACAGTGAAAAGCAGCAACAAATTCATCACATCAAGAACTTGTATGCCTTCAACCTCT 1036
Query 563 TCTGCCAGAAGCGTTTTGATGAGTCCATGCAGGTCTTTGCTAAACTTGGCACAGATCCCACCCATGTGATGGGC 636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCTGCCAGAAGCGTTTTGATGAGTCCATGCAGGTCTTTGCTAAACTTGGCACAGATCCCACCCATGTGATGGGC 1110
Query 637 CTGTACCCTGACCTGCTGCCCACAGACTACAGAAAGCAGTTGCAGTATCCCAACCCATTGCCTGTGCTCTCCGG 710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGTACCCTGACCTGCTGCCCACAGACTACAGAAAGCAGTTGCAGTATCCCAACCCATTGCCTGTGCTCTCCGG 1184
Query 711 GGCTGAATTGGAGAAGGCTCACTTAGCTCTGATTGACTACCTGACACAGAAACGAAGTCAATTGGTAAAGAAGC 784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGCTGAATTGGAGAAGGCTCACTTAGCTCTGATTGACTACCTGACACAGAAACGAAGTCAATTGGTAAAGAAGC 1258
Query 785 TGAATGACTCTGATCACCAGTCAAGCACCTCACCGCTCATGGAAGGCACTCCCACCATCAAATCCAAGAAGAAG 858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGAATGACTCTGATCACCAGTCAAGCACCTCACCGCTCATGGAAGGCACTCCCACCATCAAATCCAAGAAGAAG 1332
Query 859 CTGCTACAAATCATCGACACCACCCTGCTCAAGTGCTATCTCCATACAAATGTGGCCCTGGTGGCCCCCTTGCT 932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTGCTACAAATCATCGACACCACCCTGCTCAAGTGCTATCTCCATACAAATGTGGCCCTGGTGGCCCCCTTGCT 1406
Query 933 ACGCCTGGAGAACAATCACTGCCACATCGAGGAGAGCGAGCACGTGCTAAAGAAGGCTCACAAGTACAGTGAGC 1006
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ACGCCTGGAGAACAATCACTGCCACATCGAGGAGAGCGAGCACGTGCTAAAGAAGGCTCACAAGTACAGTGAGC 1480
Query 1007 TTATCATCCTGTATGAGAAGAAGGGGCTCCACGAGAAAGCTCTGCAGGTGCTCGTGGACCAGTCCAAGAAAGCC 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TTATCATCCTGTATGAGAAGAAGGGGCTCCACGAGAAAGCTCTGCAGGTGCTCGTGGACCAGTCCAAGAAAGCC 1554
Query 1081 AACTCCCCTCTGAAAGGCCACGAGAGGACAGTGCAGTATCTGCAGCATCTGGGCACAGAAAACCTGCATTTGAT 1154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AACTCCCCTCTGAAAGGCCACGAGAGGACAGTGCAGTATCTGCAGCATCTGGGCACAGAAAACCTGCATTTGAT 1628
Query 1155 TTTCTCCTACTCAGTGTGGGTGCTGAGAGACTTCCCAGAAGATGGCCTGAAGATATTTACTGAAGATCTCCCGG 1228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTTCTCCTACTCAGTGTGGGTGCTGAGAGACTTCCCAGAAGATGGCCTGAAGATATTTACTGAAGATCTCCCGG 1702
Query 1229 AAGTGGAGTCTCTGCCACGTGATCGAGTCCTCGGCTTCTTAATAGAGAATTTTAAGGGTCTGGCTATTCCTTAT 1302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AAGTGGAGTCTCTGCCACGTGATCGAGTCCTCGGCTTCTTAATAGAGAATTTTAAGGGTCTGGCTATTCCTTAT 1776
Query 1303 CTGGAACACATCATCCATGTTTGGGAGGAGACAGGCTCTCGGTTCCACAACTGCCTGATCCAGCTATACTGTGA 1376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CTGGAACACATCATCCATGTTTGGGAGGAGACAGGCTCTCGGTTCCACAACTGCCTGATCCAGCTATACTGTGA 1850
Query 1377 GAAGGTGCAAGGTCTGATGAAGGAGTATCTCCTGTCCTTCCCTGCAGGCAAAACCCCAGTCCCAGCTGGAGAGG 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GAAGGTGCAAGGTCTGATGAAGGAGTATCTCCTGTCCTTCCCTGCAGGCAAAACCCCAGTCCCAGCTGGAGAGG 1924
Query 1451 AAGAGGGTGAGCTGGGAGAATACCGGCAAAAGCTCCTCATGTTCTTGGAGATTTCCAGCTACTATGATCCAGGC 1524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AAGAGGGTGAGCTGGGAGAATACCGGCAAAAGCTCCTCATGTTCTTGGAGATTTCCAGCTACTATGATCCAGGC 1998
Query 1525 CGGCTCATCTGTGATTTTCCCTTTGATGGCCTCTTAGAAGAACGAGCTCTCCTGTTGGGGCGCATGGGGAAACA 1598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CGGCTCATCTGTGATTTTCCCTTTGATGGCCTCTTAGAAGAACGAGCTCTCCTGTTGGGGCGCATGGGGAAACA 2072
Query 1599 TGAACAAGCTCTTTTCATTTATGTCCACATCTTGAAGGATACAAGGATGGCTGAGGAGTACTGCCACAAACACT 1672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGAACAAGCTCTTTTCATTTATGTCCACATCTTGAAGGATACAAGGATGGCTGAGGAGTACTGCCACAAACACT 2146
Query 1673 ATGACCGAAACAAAGATGGCAACAAAGATGTGTATCTGTCCCTGCTTCGGATGTACCTGTCGCCCCCCAGCATT 1746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ATGACCGAAACAAAGATGGCAACAAAGATGTGTATCTGTCCCTGCTTCGGATGTACCTGTCGCCCCCCAGCATT 2220
Query 1747 CACTGCCTGGGGCCAATCAAGCTGGAACTACTGGAGCCAAAAGCCAACCTCCAGGCCGCTCTGCAGGTCCTCGA 1820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CACTGCCTGGGGCCAATCAAGCTGGAACTACTGGAGCCAAAAGCCAACCTCCAGGCCGCTCTGCAGGTCCTCGA 2294
Query 1821 GCTACACCACAGCAAACTGGACACCACCAAGGCCCTCAACCTTCTGCCAGCAAACACTCAGATCAATGACATAC 1894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GCTACACCACAGCAAACTGGACACCACCAAGGCCCTCAACCTTCTGCCAGCAAACACTCAGATCAATGACATAC 2368
Query 1895 GCATCTTCCTGGAAAAGGTCTTGGAAGAAAATGCACAAAAGAAACGGTTCAATCAAGTGCTCAAGAACCTTCTC 1968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GCATCTTCCTGGAAAAGGTCTTGGAAGAAAATGCACAAAAGAAACGGTTCAATCAAGTGCTCAAGAACCTTCTC 2442
Query 1969 CATGCAGAATTCCTGAGGGTCCAGGAAGAGCGGATTTTACACCAGCAGGTGAAGTGCATCATCACAGAGGAGAA 2042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CATGCAGAATTCCTGAGGGTCCAGGAAGAGCGGATTTTACACCAGCAGGTGAAGTGCATCATCACAGAGGAGAA 2516
Query 2043 GGTGTGCATGGTGTGTAAGAAGAAGATTGGGAACAGTGCATTTGCAA-GATACCCCAATGG--AGTGGTCGTCC 2113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.| || ||.|.| |||| ..|||..||||
Sbjct 2517 GGTGTGCATGGTGTGTAAGAAGAAGATTGGGAACAGAG-------AAGGAGAAC---ATGGCTGCTGGCTGTCC 2580
Query 2114 ATTACTTCTGTTCCAAAGAGGTAAACCCAGCTGACACT 2151
Sbjct 2581 -------------------------------------- 2580