Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11738
- Subject:
- XM_006524695.3
- Aligned Length:
- 2388
- Identities:
- 1945
- Gaps:
- 222
Alignment
Query 1 ATGTCTGCGGAGAGCGGCCCTGGGACGAGATTGAGAAATCTGCCAGTAATGGGGGATGGACTAGAAACTTCCCA 74
||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGTCTACGGAGAGCGGCCCTGGGACAAGATTGAGAAATCTGCCAGTAATGGGGGATGGACTAGAAACCTCCCA 74
Query 75 AATGTCTACAACACAGGCCCAGGCCCAACCCCAGCCAGCCAACGCAGCCAGCACCAACCCCCCGCCCCCAGAGA 148
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 75 AATGTCTACAACGCAGGCCCAGGCCCAACCCCAGCCAGCAAATGCAGCCAGCACCAATCCTCCACCCCCAGAGA 148
Query 149 CCTCCAACCCTAACAAGCCCAAGAGGCAGACCAACCAACTGCAATACCTGCTCAGAGTGGTGCTCAAGACACTA 222
|||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCTCCAACCCTAACAAGCCCAAGAGACAGACAAACCAACTGCAATATCTGCTCAGAGTGGTGCTCAAGACACTA 222
Query 223 TGGAAACACCAGTTTGCATGGCCTTTCCAGCAGCCTGTGGATGCCGTCAAGCTGAACCTCCCTGATTACTATAA 296
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGGAAACACCAGTTTGCGTGGCCTTTCCAGCAGCCCGTGGATGCCGTCAAGCTGAACCTCCCTGATTACTATAA 296
Query 297 GATCATTAAAACGCCTATGGATATGGGAACAATAAAGAAGCGCTTGGAAAACAACTATTACTGGAATGCTCAGG 370
|||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATTATTAAAACACCCATGGATATGGGAACAATAAAGAAGCGCTTGGAAAACAACTATTACTGGAATGCTCAGG 370
Query 371 AATGTATCCAGGACTTCAACACTATGTTTACAAATTGTTACATCTACAACAAGCCTGGAGATGACATAGTCTTA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 371 AATGTATCCAGGACTTCAACACTATGTTTACAAATTGTTACATCTATAACAAGCCTGGAGATGACATCGTCTTA 444
Query 445 ATGGCAGAAGCTCTGGAAAAGCTCTTCTTGCAAAAAATAAATGAGCTACCCACAGAAGAAACCGAGATCATGAT 518
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 ATGGCAGAAGCTCTGGAGAAGCTCTTCTTGCAAAAAATCAATGAACTGCCTACAGAAGAAACTGAGATCATGAT 518
Query 519 AGTCCAGGCAAAAGGAAGAGGACGTGGGAGGAAAGAAACAG---GGACAGCAAAACCTGGCGTTTCCACGGTAC 589
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||| ||.|||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 519 AGTCCAGGCAAAAGGAAGAGGACGAGGGAGGAAAGAAACAGGTAGGGCAGCAAAGCCTGGTGTATCCACGGTAC 592
Query 590 CAAACACAACTCAAGCATCGACTCCTCCGCAGACCCAGACCCCTCAGCCGAA---TCCTCCTCCTGTGCAGGCC 660
|||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||.||| ||||||.||||||||||||
Sbjct 593 CAAACACAACTCAAGCATCAACTTCTCCGCAGACCCAGACGCCTCAGCAGAACCCTCCTCCACCTGTGCAGGCC 666
Query 661 ACGCCTCACCCCTTCCCTGCCGTCACCCCGGACCTCATCGTCCAGACCCCTGTCATGACAGTGGTGCCTCCCCA 734
||..||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|.||||.|.||||||||||||.|||||||.||.||
Sbjct 667 ACAACTCACCCCTTTCCTGCTGTCACCCCAGACCTCATTGCCCAGCCTCCTGTCATGACAATGGTGCCCCCTCA 740
Query 735 GCCACTGCAGACGCCCCCGCCAGTGCCCCCCCAGCCACAACCCCCACCCGCTCCAGCTCCCCAGCCCGTACAGA 808
||||||.|||||.||..|.||.||.|||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||.|||||.||.||||
Sbjct 741 GCCACTTCAGACTCCTTCACCGGTACCCCCCCAGCCACCACCCCCACCTGCTCCAGTTCCACAGCCTGTGCAGA 814
Query 809 GCCACCCACCCATCATCGCGGCCACCCCACAGCCTGTGAAGACAAAGAAGGGAGTGAAGAGGAAAGCAGACACC 882
|.|||||.||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 815 GTCACCCGCCCATCATTGCGACCACCCCCCAGCCTGTGAAGACAAAGAAAGGGGTGAAGAGGAAAGCAGATACC 888
Query 883 ACCACCCCCACCACCATTGACCCCATTCACGAGCCACCCTCGCTGCCCCCGGAGCCCAAGACCACCAAGCTGGG 956
||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||.||||.||||||||||||.||||||||||
Sbjct 889 ACCACCCCTACCACCATCGACCCCATTCATGAGCCACCCTCACTGGCCCCAGAGCCCAAGACCGCCAAGCTGGG 962
Query 957 CCAGCGGCGGGAGAGCAGCCGGCCTGTGAAACCTCCAAAGAAGGACGTGCCCGACTCTCAGCAGCACCCAGCAC 1030
.|..|||||||||||||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||..|
Sbjct 963 TCCTCGGCGGGAGAGCAGCAGACCTGTGAAGCCTCCAAAGAAGGATGTACCGGACTCACAGCAGCACCCAGGGC 1036
Query 1031 CAGAGAAGAGCAGCAAGGTCTCGGAGCAGCTCAAGTGCTGCAGCGGCATCCTCAAGGAGATGTTTGCCAAGAAG 1104
|||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037 CAGAGAAGAGCAGCAAGATCTCTGAGCAGCTAAAGTGCTGCAGTGGCATCCTCAAGGAGATGTTTGCCAAGAAA 1110
Query 1105 CACGCCGCCTACGCCTGGCCCTTCTACAAGCCTGTGGACGTGGAGGCACTGGGCCTACACGACTACTGTGACAT 1178
||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111 CATGCTGCCTATGCCTGGCCTTTCTACAAGCCTGTGGATGTGGAGGCACTGGGTCTGCACGACTACTGTGACAT 1184
Query 1179 CATCAAGCACCCCATGGACATGAGCACAATCAAGTCTAAACTGGAGGCCCGTGAGTACCGTGATGCTCAGGAGT 1252
||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||.|.|||||.|||||.|
Sbjct 1185 CATCAAACATCCCATGGACATGAGCACAATCAAGTCTAAACTAGAGTCCCGAGAGTACAGAGATGCCCAGGAAT 1258
Query 1253 TTGGTGCTGACGTCCGATTGATGTTCTCCAACTGCTATAAGTACAACCCTCCTGACCATGAGGTGGTGGCCATG 1326
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1259 TTGGTGCTGATGTCCGATTGATGTTCTCCAACTGCTACAAGTACAACCCCCCTGACCATGAAGTGGTAGCCATG 1332
Query 1327 GCCCGCAAGCTCCAGGATGTGTTCGAAATGCGCTTTGCCAAGATGCCGGACGAGCCTGAGGAGCCAGTGGTGGC 1400
||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||..|
Sbjct 1333 GCTCGAAAACTCCAGGATGTGTTTGAAATGCGCTTTGCCAAGATGCCTGATGAGCCTGAAGAGCCAGTTGTTAC 1406
Query 1401 CGTGTCCTCCCCGGCAGTGCCCCCTCCCACCAAGGTTGTGGCCCCGCCCTCATCCAGCGACAGCAGCAGCGATA 1474
.||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1407 AGTGTCCTCTCCTGCAGTGCCACCCCCTACAAAGGTGGTAGCCCCACCCTCATCTAGTGACAGCAGCAGCGACA 1480
Query 1475 GCTCCTCGGACAGTGACAGTTCGACTGATGACTCTGAGGAGGAGCGAGCCCAGCGGCTGGCTGAGCTCCAGGAG 1548
|.||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1481 GTTCTTCCGACAGCGACAGTTCCACTGACGACTCTGAGGAAGAGCGAGCCCAGCGGCTGGCTGAACTCCAGGAA 1554
Query 1549 CAGCTCAAAGCCGTGCACGAGCAGCTTGCAGCCCTCTCTCAGCCCCAGCAGAACAAACCAAAGAAAAAGGAGAA 1622
||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CAGCTCAAGGCCGTGCATGAGCAGCTTGCAGCCCTCTCACAGCCCCAGCAGAACAAACCAAAGAAAAAGGAGAA 1628
Query 1623 AGACAAGAAGGAAAAGAAAAAAGAAAAGCACAAAAGGAAAGAGGAAGTGGAAGAGAATAAAAAAAGCAAAGCCA 1696
.||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||
Sbjct 1629 GGACAAGAAGGAAAAGAAAAAGGAAAAGCACAAAAAGAAAGAAGAAGTGGAGGAAAATAAAAAAAGCAAAACCA 1702
Query 1697 AGGAACCTCCTCCTAAAAAGACGAAGAAAAATAATAGCAGCAACAGCAATGTGAGCAAGAAGGAGCCAGCGCCC 1770
||||||.||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||
Sbjct 1703 AGGAACTTCCTCCCAAAAAGACAAAGAAAAATAACAGCAGCAACAGCAATGTGAGCAAGAAGGAACCAGTACCC 1776
Query 1771 ATGAAGAGCAAGCCCCCTCCCACGTATGAGTCGGAGGAAGAGGACAAGTGCAAGCCTATGTCCTATGAGGAGAA 1844
|.|||||.||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1777 ACGAAGACCAAGCCGCCTCCCACATATGAATCAGAAGAGGAGGATAAGTGTAAGCCCATGTCTTATGAGGAGAA 1850
Query 1845 GCGGCAGCTCAGCTTGGACATCAACAAGCTCCCCGGCGAGAAGCTGGGCCGCGTGGTGCACATCATCCAGTCAC 1918
|||||||||.||..|.||.||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||.
Sbjct 1851 GCGGCAGCTAAGTCTAGATATCAACAAACTTCCTGGTGAGAAGCTAGGCCGTGTAGTACACATAATTCAGTCAA 1924
Query 1919 GGGAGCCCTCCCTGAAGAATTCCAACCCCGACGAGATTGAAATCGACTTTGAGACCCTGAAGCCGTCCACACTG 1992
||||.||.||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1925 GGGAACCATCACTTAAAAACTCCAACCCCGATGAGATTGAGATTGACTTTGAGACCCTGAAGCCATCTACACTA 1998
Query 1993 CGTGAGCTGGAGCGCTATGTCACCTCCTGTTTGCGGAAGAAAAGGAAACCTCAAGCTGAGAAAGTTGATGTGAT 2066
||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1999 CGAGAGTTGGAGCGATATGTCACCTCCTGTTTGCGGAAGAAAAGGAAACCTCAAGCTGAAAAAGTTGACGTGAT 2072
Query 2067 TGCCGGCTCCTCCAAGATGAAGGGCTTCTCGTCCTCAGAGTCGGAGAGCTCCAGTGAGTCCAGCTCCTCTGACA 2140
|||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGCTGGTTCTTCCAAGATGAAGGGATTCTCATCCTCTGAGTCGGAGAGCACCAGCGAATCCAGCTCCTCTGACA 2146
Query 2141 GCGAAGACTCCGAAACAGCTTTCTGCACCAGTGGAGACTTCGTGTCCCCAGGGCCTTCCCCGTATCACAGTCAC 2214
|.||||||||.||||||| .|.||||.
Sbjct 2147 GTGAAGACTCTGAAACAG-GTCCTGCC----------------------------------------------- 2172
Query 2215 GTGCAGTGCGGCCGCTTCAGGGAGATGCTTCGCTGGTTTCTGGTGGATGTGGAGCAGACTGCAGCTGGCCAGCC 2288
Sbjct 2173 -------------------------------------------------------------------------- 2172
Query 2289 GCATCGCCAGTCTGCTGCTGGCCCTGCCATCACCTGGGCCCCAGCCATTGCCTACCCCTCCCCAGAGTGTGCTC 2362
Sbjct 2173 -------------------------------------------------------------------------- 2172
Query 2363 GTTGCTGTGTTGGCTGCTCC 2382
Sbjct 2173 -------------------- 2172