Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11745
- Subject:
- NM_001110827.2
- Aligned Length:
- 1340
- Identities:
- 999
- Gaps:
- 271
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGAAGGCGGCCAGGCGCAGCAGCAGCCGCCTCAGCTCGGGCCCGGCGCTGCCGCCCGGGGCATGAAGCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGAGTCGGAGGTGGAGTTGCCGGTGCCCGGAGCGGGGGCAGACGGACCCGAGCCCGGCCTGAGCAAGCGGCCAC 148
Query 1 ---------------------------------------------------------ATGGAGAAAAAGAAA-- 15
|||||.....||.||
Sbjct 149 GCACAGAGGAGGCGGCCGACGGCGGGATGCAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATTCCCAGCAAGG 222
Query 16 -ATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCAT 88
|||| .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 223 GATGG----CCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGT 292
Query 89 TTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACC 162
|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 293 TCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACC 366
Query 163 GGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACAC 235
.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..|
Sbjct 367 AGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACC 439
Query 236 AAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAA 306
|.|||||||||||.|| |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 AGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAA 513
Query 307 AATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCT 380
||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 514 AATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCT 587
Query 381 CCGGCAGATGTTTGG------------------------------------------------------GGGAT 400
||||||||||||||| |||||
Sbjct 588 CCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCCAAGGGAT 661
Query 401 TCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAG 474
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 662 TCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGTGGTAGAG 735
Query 475 GGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAA 548
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 736 GGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAA 809
Query 549 TGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAG 622
|||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 810 TGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTG 883
Query 623 ATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATC 696
|||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct 884 ATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATC 957
Query 697 ATTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGG 770
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 958 ATTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGG 1031
Query 771 GCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGG 844
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 GCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGG 1105
Query 845 ACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCA 918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106 ACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCA 1179
Query 919 GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCA 992
|||||.||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1180 GCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGCGACGGTTACGGCAGGGTGTACACAGCTGACCCCTACCA 1253
Query 993 TGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTG 1066
||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 TGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTGTACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTG 1327
Query 1067 CCCCCTAC 1074
||||||||
Sbjct 1328 CCCCCTAC 1335