Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11745
• Subject: NM_001110829.2
• Aligned Length: 1139
• Identities: 996
• Gaps: 70

Alignment

Query    1  ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT  74

Query   75  TACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACT  148
            ||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct   75  TACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACT  148

Query  149  ATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAA  221
            ||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  149  ATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAA  221

Query  222  CTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGA  292
            .||||||||||..||.|||||||||||.||   |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  222  TTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGA  295

Query  293  CACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTC  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  296  CACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTC  369

Query  367  CGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGG---------------------------------------------  395
            ||.||||||||||||||||||||||||||                                             
Sbjct  370  CGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCG  443

Query  396  ---------GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACG  460
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  444  CGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACG  517

Query  461  GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTC  534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  518  GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTC  591

Query  535  ACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATC  608
            ||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  592  ACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATC  665

Query  609  CAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTT  682
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  666  CAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTT  739

Query  683  ACATTCCTTTAATCATTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCAT  756
            ||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  740  ACATCCCTCTAATCATTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCAT  813

Query  757  TTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGG  830
            .||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGG  887

Query  831  TGTGGT-TTACCAGGACGGATT--TTACGGTGCT----GACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCA  897
            ..|.|| ||| |||||...|.|  |||  |.|||    .||||| |.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  AATAGTGTTA-CAGGAACCAATCATTA--GCGCTAAAATACCTC-AGGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCA  957

Query  898  CAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGT  971
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  958  CAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGCGACGGTTACGGCAGGGT  1031

Query  972  GTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACC  1045
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1032  GTACACAGCTGACCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTGTACC  1105

Query 1046  GAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC  1074
            |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  GAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC  1134