Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11745
• Subject: NM_001286419.1
• Aligned Length: 1093
• Identities: 934
• Gaps: 74

Alignment

Query    1  ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT  74

Query   75  TACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACT  148
            ||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct   75  TACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACT  148

Query  149  ATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAA  221
            ||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  149  ATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAA  221

Query  222  CTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACAC  295
            .||||||||||..||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  222  TTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACAC  295

Query  296  AAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGG  369
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  296  AAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGA  369

Query  370  GACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGC  443
            |||||||||||||||||||||||||||     |.|.||.|.||..|.|.|||  .|||                
Sbjct  370  GACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGG-----CAGTTTGGCAAAATCCTAGA--TGTG----------------  420

Query  444  CAGGGAGAAATTA-----------CACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGC  506
                  |||||.|           |.||||.|                     |.|||||||||||||.|||||
Sbjct  421  ------GAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTC---------------------CAAGGTGAATAATGCAACAGC  467

Query  507  ACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTG  580
            |||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  468  ACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTG  541

Query  581  TATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCC  654
            |.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct  542  TGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCC  615

Query  655  CTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCATTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCAC  728
            .|.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  616  TTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATCATTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCAC  689

Query  729  CACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTAC  802
            |||||||||.||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  690  CACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTAC  763

Query  803  CTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGT-TTACCAGGACGGATT--TTACGGTGCT----GACCTCTA  869
            ||||||||||||||||||||||||||||..|.|| ||| |||||...|.|  |||  |.|||    .||||| |
Sbjct  764  CTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGAATAGTGTTA-CAGGAACCAATCATTA--GCGCTAAAATACCTC-A  833

Query  870  TGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAG  943
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||
Sbjct  834  GGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAG  907

Query  944  CCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTAT  1017
            ||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  908  CCGCTTACAGCGACGGTTACGGCAGGGTGTACACAGCTGACCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTAT  981

Query 1018  GGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC  1074
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  982  GGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTGTACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC  1038