Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11745
• Subject: NM_001349994.2
• Aligned Length: 1206
• Identities: 1025
• Gaps: 174

Alignment

Query    1  -----------------------------------ATG-GAGAAAAAG----------------AAAATGGTAA  22
                                               .|| |||||..||                |..||||  |
Sbjct    1  ATGTCATCAGATTCCATGGACCAGCCCAGGAACCCCTGTGAGAACGAGCCTCTGACTCCAGGTTATCATGG--A  72

Query   23  CT----------------CAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTAC  80
            .|                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   73  TTCCCAGCGCGGGACAGCCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTAC  146

Query   81  CATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCG  154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  CATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCG  220

Query  155  GCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCC  228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  GCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCC  294

Query  229  AGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAG  302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  AGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAG  368

Query  303  TGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTG  376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  TGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTG  442

Query  377  ACCTCCGGCAGATGTTTGG------------------------------------------------------G  396
            |||||||||||||||||||                                                      |
Sbjct  443  ACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAG  516

Query  397  GGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGT  470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  GGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGT  590

Query  471  AGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATG  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  AGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATG  664

Query  545  CAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAA  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  CAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAA  738

Query  619  GCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTT  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  GCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTT  812

Query  693  AATCATTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCA  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  AATCATTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCA  886

Query  767  GAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTAC  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct  887  GAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGG----------  950

Query  841  CAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAAC  914
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  951  ------------------------------GGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAAC  994

Query  915  CGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCT  988
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  995  CGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCT  1068

Query  989  ACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGA  1062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1069  ACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGA  1142

Query 1063  TTTGCCCCCTAC----------  1074
            ||||||||||||          
Sbjct 1143  TTTGCCCCCTACTGAAGTGACG  1164