Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11745
- Subject:
- NM_001349995.2
- Aligned Length:
- 1174
- Identities:
- 967
- Gaps:
- 191
Alignment
Query 1 -----------------------------------ATG-GAGAAAAAG----------------AAAATGGTAA 22
.|| |||||..|| |..|||| |
Sbjct 1 ATGTCATCAGATTCCATGGACCAGCCCAGGAACCCCTGTGAGAACGAGCCTCTGACTCCAGGTTATCATGG--A 72
Query 23 CT----------------CAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTAC 80
.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 TTCCCAGCGCGGGACAGCCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTAC 146
Query 81 CATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCG 154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147 CATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCG 220
Query 155 GCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCC 228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 GCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCC 294
Query 229 AGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAG 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 AGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAG 368
Query 303 TGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTG 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 TGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTG 442
Query 377 ACCTCCGGCAGATGTTTGGGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCT-GATGCAGACAGGGCCAGGGA 449
|||||||||||||||||||| |.|.||.|.|| |.|.|| ||| |.|
Sbjct 443 ACCTCCGGCAGATGTTTGGG-----CAGTTTGGCAA-----------AATCCTAGAT--------------GTA 486
Query 450 GAAA------TTACACGGCACCGTGG---TAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAA 514
|||| ||| |.| |.||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 487 GAAATAATCTTTA-ATG--AACGTGGCTCTA----------------AGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAA 541
Query 515 TGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGT 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 542 TGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGT 615
Query 589 CCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGG 662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 616 CCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGG 689
Query 663 AAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAG 724
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 690 AAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAG 763
Query 725 CCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCG 798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 764 CCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCG 837
Query 799 GTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGG 872
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 838 GTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGG----------------------------------------GG 871
Query 873 TGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCG 946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 872 TGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCG 945
Query 947 CTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGA 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 946 CTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGA 1019
Query 1021 GTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC---------- 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTACTGAAGTGACG 1083