Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11745
- Subject:
- XM_006521582.3
- Aligned Length:
- 1316
- Identities:
- 937
- Gaps:
- 280
Alignment
Query 1 ------------------ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAAC-------TCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAA 49
|||||..|..| |||.| .|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1 ATGTATGGTGTATATTGCATGGATTATCA-------GTATCCTCTTGTCCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAA 67
Query 50 CTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAG 123
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 68 CTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAA 141
Query 124 TATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCA 197
|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 142 TATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC- 214
Query 198 AGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCA 267
|||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..||.|||||||||||.|| ||||||||||||||||
Sbjct 215 AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCA 288
Query 268 CAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCA 341
|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||
Sbjct 289 CAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACA 362
Query 342 TGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGG-------------------- 395
|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 TGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAG 436
Query 396 ----------------------------------GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCA 435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437 ATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCA 510
Query 436 GACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACG 509
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 511 GACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACG 584
Query 510 TGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTAT 583
.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 585 GGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGT 658
Query 584 ATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTA 657
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.
Sbjct 659 ATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTG 732
Query 658 TCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTAC 719
|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||| |||||||||||||||||||.||
Sbjct 733 TCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAAC 806
Query 720 TGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCC 793
||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 807 TGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCC 880
Query 794 GAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTC 867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 GAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTC 954
Query 868 TAT---GGTG--GATATG---------CAGCCTA------------------------------CAGATATGCA 897
||| |.|| ||.||| ||..||| |.||||| .|
Sbjct 955 TATTCAGCTGAAGAAATGTTAACATCTCACTCTAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTTCTCTGATAT-AA 1027
Query 898 CAGCCT--GCTACTGC--------------AACCGCA-----------GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGC 944
||| .| |.|||||| || || ||||..||| |.|.||
Sbjct 1028 CAG-ATGGGTTACTGCTTGTTATAATTATTAA---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT-------CGGGTG---- 1086
Query 945 CGC-----TTAC------------------AGTGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--ACACA---GCCGAC 984
.|| |||| ||.||| .||||.||.|.|| ||| ||.|| |..|||
Sbjct 1087 GGCAAGATTTACTCCTCCTTTGGGCTGGGGAGGGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAACTCAAGTGGTGAC 1160
Query 985 ---------CC---CTACCATGCCCTTGCCCCTGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTA---T 1042
|| .|||||.|.|.|||...|||| |||| ||| |.|.|||..|||||| || .
Sbjct 1161 TGACTGTTTCCGTAATACCAGGTCGTTGTGGCTGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-------TACTTC 1224
Query 1043 ACCGAG---GTGGCTACAG-----------CCGATTTGCCCCCTAC------------ 1074
|||||| |||| ||.|| |||.|.| |||.|.
Sbjct 1225 ACCGAGCTTGTGG-TAGAGCCTAGGGCAAACCGCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA 1278