Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11745
- Subject:
- XM_017028690.1
- Aligned Length:
- 1204
- Identities:
- 1062
- Gaps:
- 131
Alignment
Query 1 ------------------ATGGA-GAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTG 55
||||| .|..||.|...||.|..| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTATGGTGTATATTGTATGGATTATCAATATCCTGTTGTC-CAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTG 73
Query 56 ACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGG 129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 ACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGG 147
Query 130 GTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCA 203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 GTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCA 221
Query 204 CGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAG 274
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 CGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAG 295
Query 275 ACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCT 348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 ACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCT 369
Query 349 AATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGG--------------------------- 395
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 AATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGA 443
Query 396 ---------------------------GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGG 442
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 AATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGG 517
Query 443 CCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATG 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 CCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATG 591
Query 517 ACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCC 590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 ACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCC 665
Query 591 GGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAA 664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 GGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAA 739
Query 665 GAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCC 726
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 GAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCC 813
Query 727 ACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGT 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 ACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGT 887
Query 801 ACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT---- 870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 ACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATATAG 961
Query 871 ----------------------------GGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCG 916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 AATCTGCAAACTGCTTCAGATCAAACAGGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCG 1035
Query 917 CAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTAC 990
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 CAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTAC 1109
Query 991 CATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATT 1064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 CATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATT 1183
Query 1065 TGCCCCCTAC---------- 1074
||||||||||
Sbjct 1184 TGCCCCCTACTGAAGTGACG 1203