Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11749
• Subject: NM_012455.3
• Aligned Length: 3168
• Identities: 3077
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGATGGGTGACTACAGACTCCCTGACCACCCCCAGCCCATGGAAATTCTCAACCTGTACTTGGGAGACAGCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGGGTGACTACAGACTCCCTGACCACCCCCAGCCCATGGAAATTCTCAACCTGTACTTGGGAGACAGCCT  74

Query   75  GGAGCCCCACCCAGGAGAGTGCCCAAGGGAAACGTGCAGCCATGAGGATCCACCGGAGCCTTTCGAGGAGCAAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGCCCCACCCAGGAGAGTGCCCAAGGGAAACGTGCAGCCATGAGGATCCACCGGAGCCTTTCGAGGAGCAAA  148

Query  149  CCTGGGCCACTGACCCTCCTGAACCTACCAGACAAAATGTTCCTCCCTGGGGCTCCGGTGTGGAGCTCACACAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTGGGCCACTGACCCTCCTGAACCTACCAGACAAAATGTTCCTCCCTGGGGCTCCGGTGTGGAGCTCACACAC  222

Query  223  CTGGGGAGCTGGGTCCATCAGGACGGGCTGGAGCCTTGCCAGGAGCAAACCCGGGCCACTGACCCTCCTGAATC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGGGAGCTGGGTCCATCAGGACGGGCTGGAGCCTTGCCAGGAGCAAACCCGGGCCACTGACCCTCCTGAATC  296

Query  297  TACCAGACAAGATGCTCCTCCCTGGGGCTCCGGTGTGGAGCTCACACACCTGGGGAGCCCCTCTGCCCAGAGGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TACCAGACAAGATGCTCCTCCCTGGGGCTCCGGTGTGGAGCTCACACACCTGGGGAGCCCCTCTGCCCAGAGGG  370

Query  371  ATCACAGGCAGAACACAGCATCACCAGGGTCACCAGTGAACAGCCATCTACCGGGGAGCCCAAAGCAGAACCGG  444
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCACAGGCAGAACACAGCATCACCAGGGTCACCAGTGAACAGCCATCTACCGGGGAGCCCAAAGCAGAACCGG  444

Query  445  AGCACGTCCACACAGGTAGTGTTCTGGGCAGGCATCCTGCAGGCCCAGATGTGTGTCCTAGACCTGGAGGAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCACGTCCACACAGGTAGTGTTCTGGGCAGGCATCCTGCAGGCCCAGATGTGTGTCCTAGACCTGGAGGAGGA  518

Query  519  GCTGGAGAAGACGGAAGGGCTCAAGGCTGGGCTGAAATGCTGTCTCCCCACGCCCCCTGTGGACCTCCCCGGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGGAGAAGACGGAAGGGCTCAAGGCTGGGCTGAAATGCTGTCTCCCCACGCCCCCTGTGGACCTCCCCGGGG  592

Query  593  ACACGGGCCTGCACTCCAGCCCACCTGAGAATGAAGACTCAGGGGAAGACAGCAGCGAGCCTGAGGGAGAGGGC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACACGGGCCTGCACTCCAGCCCACCTGAGAATGAAGACTCAGGGGAAGACAGCAGTGAGCCTGAGGGAGAGGGC  666

Query  667  CAGGCATGGCTGAGAGAGGGAACCCCAGACTCTTCCCCACAGTGGGGAGCTGAGGAGGAGAGCATGTTCTTCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGGCATGGCTGAGAGAGGGAACCCCAGACTCTTCCCCACAGTGGGGAGCTGAGGAGGAGAGCATGTTCTTCAG  740

Query  741  CAACCCCCTCTTCCTGGCGAGTCCTTGCTCAGAGAACAGTGCTTCTGGAGAGTGCTTTTCCTGGGCGGCTTCAG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  741  CAACCCCCTCTTCCTGGCGAGTCCTTGCTCAGAGAACAGTGCTTCTGGAGAGTGCTTTTCCTGGGGGGCTTCAG  814

Query  815  ACTCCCATGCAGGTGTGAGGACTGGACCTGAGAGCCCAGCGACTCTGGAGCCTCCCCTCCCAGAAGACACAGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACTCCCATGCAGGTGTGAGGACTGGACCTGAGAGCCCAGCGACTCTGGAGCCTCCCCTCCCAGAAGACACAGTG  888

Query  889  CTGTGGGAGCTGGAAAGTGAGCCAGATTTGGGGGACGGCGCTGCTATCAGTGGGCATTGTACCCCTCCATTCCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGTGGGAGCTGGAAAGTGAGCCAGATTTGGGGGACGGCGCTGCTATCAGTGGGCATTGTACCCCTCCATTCCC  962

Query  963  TGTGCCCATCTATAAACCACACTCCATCTGCTGGGCCTCAGTGGCTGCCGCTGAGGGGGCTCCTGCAGCACCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTGCCCATCTATAAACCACACTCCATCTGCTGGGCCTCAGTGGCTGCCGCTGAGGGGGCTCCTGCAGCACCTC  1036

Query 1037  CTGGTCACGGGGAGAGTGAGGGAGATAGGCTTGGTCCTGCTCCATCTGCAGCACCGTGTGTGGACGAAGCATTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGGTCACGGGGAGAGTGAGGGAGATAGGCTTGGTCCTGCTCCATCTGCAGCACCGTGTGTGGACGAAGCATTG  1110

Query 1111  ACCTGGGAATCAGGATGTGTCGGATCTGATCTTGGCCCTGCTGCACATCCTGTGCAACCTTGGGCCTCTCTCAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCTGGGAATCAGGATGTGTCGGATCTGATCTTGGCCCTGCTGCACATCCTGTGCAACCTTGGGCCTCTCTCAG  1184

Query 1185  CCCTGAGGGCTGGCAGAGAGGAGGTCCTTTTTGGCCCCAGGTGACTCTTAACTCCCAGGACAG-----------  1247
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct 1185  CCCTGAGGGCTGGCAGAGAGGAGGTCCTTTTTGGCCCCAGGTGACTCTTAACTCCCAGGACAGAGATGAGAGGG  1258

Query 1248  -------------------------------------------------------------------------A  1248
                                                                                     |
Sbjct 1259  AGGGTGGACACCCCCAGGAATCTCTTCCCTGCACCTTGGCCCCCTGCCCCTGGAGGAGCCCAGCTTCTTCTCCA  1332

Query 1249  GAGCCTAGCAGCCCAGAATCTGAGAGCAGAGGCCCTGGTCCCAGGCCCAGCCCTGCATCGTCCCAGGAGGGCAG  1322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGCCTAGCAGCCCAGAATCTGAGAGCAGAGGCCCTGGTCCCAGGCCCAGCCCTGCATCGTCCCAGGAGGGCAG  1406

Query 1323  CCCGCAGCTTCAACACCACAGCTCAGGCATTTTGCCCAAGTGGACACTAGATGCTTCACAGTCTTCACTCTTGG  1396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCCGCAGCTTCAACACCACAGCTCAGGCATTTTGCCCAAGTGGACACTAGATGCTTCACAGTCTTCACTCTTGG  1480

Query 1397  AGACGGATGGGGAACAGCCAAGTTCCTTGAAGAAAAAGGAGGCAGGGGAGGCCCCAAAACCAGGCGAGGAAGTA  1470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGACGGATGGGGAACAGCCAAGTTCCTTGAAGAAAAAGGAGGCAGGGGAGGCCCCAAAACCAGGCGAGGAAGTA  1554

Query 1471  AAGAGTGAAGGAACAGCCAGGCCTGCAGAGACTGGAGACGTCCAGCCTGACATTCACCTGACTTCTGCAGAACA  1544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGAGTGAAGGAACAGCCAGGCCTGCAGAGACTGGAGACGTCCAGCCTGACATTCACCTGACTTCTGCAGAACA  1628

Query 1545  TGAGAATCTGAGGACACCGATGAACTCTTCTTGGCTTCCTGGGAGCCCTATGCCCCAAGCACAGTCCCCAGAGG  1618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGAGAATCTGAGGACACCGATGAACTCTTCTTGGCTTCCTGGGAGCCCTATGCCCCAAGCACAGTCCCCAGAGG  1702

Query 1619  AAGGCCAGAGACCACCAGCTGGAGACAAGCTAGCTAATGGCGTCAGGAACAACAAGGTAGCCTGGAACTTGGCC  1692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAGGCCAGAGACCACCAGCTGGAGACAAGCTAGCTAATGGCGTCAGGAACAACAAGGTAGCCTGGAACTTGGCC  1776

Query 1693  TCACGCCTCTATCGCCTGGAGGGCTTCCGGAAGTCTGAAGTGGCTGCCTACCTGCAGAAGAACAATGACTTTAG  1766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCACGCCTCTATCGCCTGGAGGGCTTCCGGAAGTCTGAAGTGGCTGCCTACCTGCAGAAGAACAATGACTTTAG  1850

Query 1767  CAGGGCTGTGGCTGAGGAGTACCTGTCCTTCTTCCAGTTTGGAGGCCAGAGTCTGGACCGAGCCCTCCGGAGCT  1840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAGGGCTGTGGCTGAGGAGTACCTGTCCTTCTTCCAGTTTGGAGGCCAGAGTCTGGACCGAGCCCTCCGGAGCT  1924

Query 1841  TCCTCCAGGCCTTGGTGCTCAGTGGGGAGACTCAGGAACGGGAGCGAATCCTCTACCAGTTCTCCAGACGCTTC  1914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCCTCCAGGCCTTGGTGCTCAGTGGGGAGACTCAGGAACGGGAGCGAATCCTCTACCAGTTCTCCAGACGCTTC  1998

Query 1915  CACCATTGCAATCCGGGGATCTTCCCCTCAGTAGATTCTGTACACACCTTGACATGTGCAATCATGCTGCTTAA  1988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CACCATTGCAATCCGGGGATCTTCCCCTCAGTAGATTCTGTACACACCTTGACATGTGCAATCATGCTGCTTAA  2072

Query 1989  CACGGACCTGCATGGACAGAACATTGGGAAGAGCATGAGCTGCCAGGAATTCATAACCAACCTGAATGGGCTGA  2062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CACGGACCTGCATGGACAGAACATTGGGAAGAGCATGAGCTGCCAGGAATTCATAACCAACCTGAATGGGCTGA  2146

Query 2063  GGGATGGCGGGAACTTCCCCAAGGAGCTGCTGAAGGCCCTCTACTGGTCTATCCGCAGCGAGAAGCTCGAGTGG  2136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GGGATGGCGGGAACTTCCCCAAGGAGCTGCTGAAGGCCCTCTACTGGTCTATCCGCAGCGAGAAGCTCGAGTGG  2220

Query 2137  GCCGTGGATGAAGAAGACACAGCCAGACCTGAGAAGGCCCAGCCGTCCCTGCCAGCTGGCAAGATGAGCAAGCC  2210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GCCGTGGATGAAGAAGACACAGCCAGACCTGAGAAGGCCCAGCCGTCCCTGCCAGCTGGCAAGATGAGCAAGCC  2294

Query 2211  CTTCCTTCAGCTGGCTCAGGATCCCACAGTGCCCACCTACAAGCAGGGCATCCTGGCTCGGAAAATGCATCAAG  2284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CTTCCTTCAGCTGGCTCAGGATCCCACAGTGCCCACCTACAAGCAGGGCATCCTGGCTCGGAAAATGCATCAAG  2368

Query 2285  ATGCAGACGGCAAGAAGACGCCATGGGGCAAGCGTGGCTGGAAGATGTTCCACACCTTACTGCGAGGGATGGTT  2358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ATGCAGACGGCAAGAAGACGCCATGGGGCAAGCGTGGCTGGAAGATGTTCCACACCTTACTGCGAGGGATGGTT  2442

Query 2359  CTCTACTTCCTGA---AGGGAGAAGACCACTGTCTGGAGGGGGAGAGCTTGGTGGGGCAGATGGTGGATGAGCC  2429
            |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CTCTACTTCCTGAAGCAGGGAGAAGACCACTGTCTGGAGGGGGAGAGCTTGGTGGGGCAGATGGTGGATGAGCC  2516

Query 2430  CGTGGGGGTGCACCACTCGCTGGCCACCCCCGCCACGCATTACACCAAGAAGCCGCACGTCTTCCAGCTGCGCA  2503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CGTGGGGGTGCACCACTCGCTGGCCACCCCCGCCACGCATTACACCAAGAAGCCGCACGTCTTCCAGCTGCGCA  2590

Query 2504  CGGCTGACTGGCGCCTCTACCTCTTCCAGGCACCCACTGCCAAGGAGATGAGCTCCTGGATCGCGCGCATCAAC  2577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CGGCTGACTGGCGCCTCTACCTCTTCCAGGCACCCACTGCCAAGGAGATGAGCTCCTGGATCGCGCGCATCAAC  2664

Query 2578  TTGGCTGCGGCCACCCACTCCGCGCCGCCCTTCCCCGCCGCTGTGGGCTCCCAGCGCAGATTCGTGCGGCCCAT  2651
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  TTGGCTGCGGCCACGCACTCCGCGCCGCCCTTCCCCGCCGCTGTGGGCTCCCAGCGCAGATTCGTGCGGCCCAT  2738

Query 2652  CCTGCCCGTGGGCCCCGCCCAGAGCTCCCTGGAGGAGCAGCATCGATCCCACGAGAACTGCCTGGACGCTGCCG  2725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CCTGCCCGTGGGCCCCGCCCAGAGCTCCCTGGAGGAGCAGCATCGATCCCACGAGAACTGCCTGGACGCTGCCG  2812

Query 2726  CGGACGACCTGCTGGATCTACAGAGGAACCTGCCGGAGCGGCGGGGCCGTGGCCGCGAGCTGGAGGAGCACCGC  2799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CGGACGACCTGCTGGATCTACAGAGGAACCTGCCGGAGCGGCGGGGCCGTGGCCGCGAGCTGGAGGAGCACCGC  2886

Query 2800  CTGCGGAAGGAGTACCTGGAGTACGAGAAAACCCGCTACGAGACCTACGTGCAGCTGCTGGTGGCCCGCCTGCA  2873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CTGCGGAAGGAGTACCTGGAGTACGAGAAAACCCGCTACGAGACCTACGTGCAGCTGCTGGTGGCCCGCCTGCA  2960

Query 2874  CTGCCCCTCTGATGCTCTGGACCTGTGGGAGGAGCAGCTGGGGAGGGAAGCTGGAGGCACTCGGGAGCCCAAGC  2947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CTGCCCCTCTGATGCTCTGGACCTGTGGGAGGAGCAGCTGGGGAGGGAAGCTGGAGGCACTCGGGAGCCCAAGC  3034

Query 2948  TCAGCCTGAAGAAGTCCCACTCGAGCCCGTCCCTGCACCAGGATGAGGCTCCCACCACGGCCAAGGTGAAGCGC  3021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  TCAGCCTGAAGAAGTCCCACTCGAGCCCGTCCCTGCACCAGGATGAGGCTCCCACCACGGCCAAGGTGAAGCGC  3108

Query 3022  AACATCTCAGAGCGCAGAACCTACCGGAAGATCATCCCTAAGCGGAACCGCAATCAGCTG  3081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  AACATCTCAGAGCGCAGAACCTACCGGAAGATCATCCCTAAGCGGAACCGCAATCAGCTG  3168