Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11752
• Subject: XM_024447922.1
• Aligned Length: 1083
• Identities: 884
• Gaps: 183

Alignment

Query    1  ATGGCCTCGCGCTGGTGGCGGTGGCGGCGCGGCTGCTCCTGGAAGCCGGCGGCGCGGAGCCCCGGGCCCGGCTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCTCGCGCTGGTGGCGGTGGCGGCGCGGCTGCTCCTGGAAGCCGGCGGCGCGGAGCCCCGGGCCCGGCTC  74

Query   75  CCCCGGCCGTGCGGTACCGTTGGGGCCGAGCGCCGCTGCCGAAGTCCGCGCGCAGGTTCATAGGCGGAAGGGAC  148
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCCGGCCGTGCGGGACCGTTGGGGCCGAGCGCCGCTGCCGAAGTCCGCGCGCAGGTTCATAGGCGGAAGGGAC  148

Query  149  TTGACTTGTCTCAGATACCCTATATTAATCTTGTGAAGCATTTAACATCTGCCTGTCCAAATGTATGTCGTATA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGACTTGTCTCAGATACCCTATATTAATCTTGTGAAGCATTTAACATCTGCCTGTCCAAATGTATGTCGTATA  222

Query  223  TCACGGTTTCATCACACAACCCCAGACAGTAAAACACACAGTGGTGAAAAATACACCGATCCTTTCAAACTCGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCACGGTTTCATCACACAACCCCAGACAGTAAAACACACAGTGGTGAAAAATACACCGATCCTTTCAAACTCGG  296

Query  297  TTGGAGAGACTTGAAAGGTCTGTATGAGGACATTAGAAAGGAACTGCTTATATCAACATCAGAACTTAAGGAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTGGAGAGACTTGAAAGGTCTGTATGAGGACATTAGAAAGGAACTGCTTATATCAACATCAGAACTTAAGGAAA  370

Query  371  TGTCTGAGTACTACTTTGATGGGAAAGGGAAAGCCTTTCGACCAATTATTGTGGCGCTAATGGCCCGAGCATGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTCTGAGTACTACTTTGATGGGAAAGGGAAAGCCTTTCGACCAATTATTGTGGCGCTAATGGCCCGAGCATGC  444

Query  445  AATATTCATCATAACAACTCCCGACATGTGCAAGCCAGCCAGCGCGCCATAGCCTTAATTGCAGAAATGATCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATATTCATCATAACAACTCCCGACATGTGCAAGCCAGCCAGCGCGCCATAGCCTTAATTGCAGAAATGATCCA  518

Query  519  CACTGCTAGTCTGGTTCACGATGACGTTATTGACGATGCAAGTTCTCGAAGAGGAAAACACACAGTTAATAAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACTGCTAGTCTGGTTCACGATGACGTTATTGACGATGCAAGTTCTCGAAGAGGAAAACACACAGTTAATAAGA  592

Query  593  TCTGGGGTGAAAAGAAGGCTGTTCTTGCTGGAGATTTAATTCTTTCTGCAGCATCTATAGCTCTGGCACGAATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTGGGGTGAAAAGAAGGCTGTTCTTGCTGGAGATTTAATTCTTTCTGCAGCATCTATAGCTCTGGCACGAATT  666

Query  667  GGAAATACAACTGTTATATCTATTTTAACCCAAGTTATTGAAGATTTGGTGCGTGGTGAATTTCTTCAGCTCGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGAAATACAACTGTTATATCTATTTTAACCCAAGTTATTGAAGATTTGGTGCGTGGTGAATTTCTTCAGCTCGG  740

Query  741  GTCAAAAGAAAATGAGAATGAAAGATTTGCACACTACCTTGAGAAGACATTCAAGAAGACCGCCAGCCTGATAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTCAAAAGAAAATGAGAATGAAAGATTTGCACACTACCTTGAGAAGACATTCAAGAAGACCGCCAGCCTGATAG  814

Query  815  CCAACAGTTGTAAAGCAGTATTTCCCAGAAATGAATGCTATGATC----ATG---CGAC-----GGT---TCAG  873
            |||||||||||||||||||                  ||.||.||    |||   ||||     |||   |.||
Sbjct  815  CCAACAGTTGTAAAGCAGT------------------CTCTGTTCTAGGATGTCCCGACCCAGTGGTGCATGAG  870

Query  874  TTTGCCT--------GG---AGATGTAGACAGAGCTCGACAG-TA-------------TGTACTACA----GAG  918
            .|.||||        ||   |.||||||..|.||||...||| ||             ||.|||.||    |.|
Sbjct  871  ATCGCCTATCAGTACGGAAAAAATGTAGGAATAGCTTTTCAGCTAATAGATGATGTATTGGACTTCACCTCGTG  944

Query  919  --------------------------------------------------------------------------  918
                                                                                      
Sbjct  945  TTCTGACCAGATGGGCAAACCAACATCAGCTGATCTGAAGCTCGGGTTAGCCACTGGTCCTGTCCTGTTTGCCT  1018

Query  919  -----------------------------------------------  918
                                                           
Sbjct 1019  GTCAGCAGGTTCACTGCCAGGGAAAAACTGGCAGCTGCTGTAAGCAC  1065