Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_11767
Subject:
NM_012337.3
Aligned Length:
1653
Identities:
1398
Gaps:
255

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCACTAAGCACAGCTGGCATCCTGAGCTCCTCTTCTGCCGCTTCCAACAGGTCAAGGAATAAGGCTCGCTA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCGGACCAAAGCCGTGAGCTCTGAGGTGGATGAGAGCCTCTTTGGAGATATCAAGTCCCCAGCCCAGGGCCAGA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GCGACAGCCCCATTGTGCTGCTCCGAGATAAGCATACCCTTCAAAAAACTCTCACTGCTTTGGGCTTGGATCGC  222

Query    1  ---------------------------------ATGGTCCGAGAACTCATTGTTCCCACAGAGGATCCCTCCGG  41
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGCCAGAGACCATCCAGCTCATCACCCGGGACATGGTCCGAGAACTCATTGTTCCCACAGAGGATCCCTCCGG  296

Query   42  GGAGTCCCTAATCATCAGCCCTGAGGAGTTTGAGCGAATCAAATGGGCATCCCATGTCCTGACCAGAGAAGAAC  115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGTCCCTAATCATCAGCCCTGAGGAGTTTGAGCGAATCAAATGGGCATCCCATGTCCTGACCAGAGAAGAAC  370

Query  116  TTGAGGCCAGGGACCAGGCCTTCAAGAAGGAGAAGGAAGCCACCATGGATGCAGTGATGACACGAAAGAAGATC  189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGAGGCCAGGGACCAGGCCTTCAAGAAGGAGAAGGAAGCCACCATGGATGCAGTGATGACACGAAAGAAGATC  444

Query  190  ATGAAACAGAAGGAGATGGTGTGGAACAACAACAAGAAGCTCAGTGACCTGGAGGAGGTGGCCAAGGAACGGGC  263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGAAACAGAAGGAGATGGTGTGGAACAACAACAAGAAGCTCAGTGACCTGGAGGAGGTGGCCAAGGAACGGGC  518

Query  264  CCAGAACCTCCTGCAGAGAGCCAACAAGCTGCGGATGGAGCAGGAGGAGGAGCTCAAGGACATGAGCAAGATTA  337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCAGAACCTCCTGCAGAGAGCCAACAAGCTGCGGATGGAGCAGGAGGAGGAGCTCAAGGACATGAGCAAGATTA  592

Query  338  TCCTCAATGCTAAGTGCCATGCCATCCGGGATGCCCAAATCCTGGAGAAGCAGCAGATCCAAAAAGAACTGGAC  411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCTCAATGCTAAGTGCCATGCCATCCGGGATGCCCAAATCCTGGAGAAGCAGCAGATCCAAAAAGAACTGGAC  666

Query  412  ACAGAAGAGAAGCGGTTGGATCAGATGATGGAAGTGGAGCGGCAGAAATCCATTCAAAGGCAGGAGGAACTGGA  485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACAGAAGAGAAGCGGTTGGATCAGATGATGGAAGTGGAGCGGCAGAAATCCATTCAAAGGCAGGAGGAACTGGA  740

Query  486  GAGGAAGAGGAGGGAGGAAAGAATTAGAGGAAGGCGGCAAATTGTGGAACAGATGGAAAAGAACCAGGAGGAGC  559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGGAAGAGGAGGGAGGAAAGAATTAGAGGAAGGCGGCAAATTGTGGAACAGATGGAAAAGAACCAGGAGGAGC  814

Query  560  GATCGCTGCTTGCTGAGCAGCGGGAGCAGGAGAAGGAGCAGATGCTGGAATATATGGAACAGCTCCAAGAGGAA  633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GATCGCTGCTTGCTGAGCAGCGGGAGCAGGAGAAGGAGCAGATGCTGGAATATATGGAACAGCTCCAAGAGGAA  888

Query  634  GATCTAAAGGACATGGAACGAAGGCAGCAACAAAAACTGAAGATGCAAGCTGAGATTAAGCGCATCAATGATGA  707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATCTAAAGGACATGGAACGAAGGCAGCAACAAAAACTGAAGATGCAAGCTGAGATTAAGCGCATCAATGATGA  962

Query  708  AAACCAGAAACAGAAAGCAGAACTGCTGGCTCAGGAGAAGCTGGCAGACCAGATGGTGATGGAGTTTACCAAGA  781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAACCAGAAACAGAAAGCAGAACTGCTGGCTCAGGAGAAGCTGGCAGACCAGATGGTGATGGAGTTTACCAAGA  1036

Query  782  AGAAGATGGCTCGAGAAGCAGAGTTTGAGGCTGAGCAGGAGAGAATCCGGAGGGAGAAAGAGAAGGAGATCGCA  855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAAGATGGCTCGAGAAGCAGAGTTTGAGGCTGAGCAGGAGAGAATCCGGAGGGAGAAAGAGAAGGAGATCGCA  1110

Query  856  CGCTTGAGGGCCATGCAGGAGAAGGCCCAGGATTACCAGGCAGAACAGGATGCCTTGCGGGCCAAGCGCAACCA  929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGCTTGAGGGCCATGCAGGAGAAGGCCCAGGATTACCAGGCAGAACAGGATGCCTTGCGGGCCAAGCGCAACCA  1184

Query  930  GGAGGTTGCAGACAGAGAGTGGCGCAGAAAGGAAAAGGAAAATGCGCGGAAGAAGATGGAAACAGAGGCTGAGC  1003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGGTTGCAGACAGAGAGTGGCGCAGAAAGGAAAAGGAAAATGCGCGGAAGAAGATGGAAACAGAGGCTGAGC  1258

Query 1004  TGCGAAAAAGTCGGCTCGAACAGGTGGCTTTCAAGGAGCACGCTCTGGCTGTTCAGGTGCAACGGGACCGGGAT  1077
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCGAAAAAGTCGGCTCGAACAGGTGGCTTTCAAGGAGCACGCTCTGGCTGTTCAGGTGCAACGGGACCGGGAT  1332

Query 1078  GAGTTCGAGAGGATTCTTCGGGCTCAGAGAGAACAGATTGAGAAGGAGCGGCTGGAGGAGGAGAAAAAGGCCAC  1151
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGTTCGAGAGGATTCTTCGGGCTCAGAGAGAACAGATTGAGAAGGAGCGGCTGGAGGAGGAGAAAAAGGCCAC  1406

Query 1152  AGGGCGCTTACAGCATGCCAATGAGCTCCGGCGCCAGGTGCGCGAGAACCAGCAGAAGGAAGTGCAGAACCGGA  1225
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGGGCGCTTACAGCATGCCAATGAGCTCCGGCGCCAGGTGCGCGAGAACCAGCAGAAGGAAGTGCAGAACCGGA  1480

Query 1226  TTGCCACCTTTGAGGAGGGCCGGCGCCTCAAAGAGGAGGCCCAGAAACGCCGTGAGCGCATCGATGAGATCAAG  1299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTGCCACCTTTGAGGAGGGCCGGCGCCTCAAAGAGGAGGCCCAGAAACGCCGTGAGCGCATCGATGAGATCAAG  1554

Query 1300  AGGAAAAAGCTTGAAGAGCTGAGAGCCACTGGCCTTCCCGAGAAGTACTGCATTGAAGCTGAGCGCAAAGCTAA  1373
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGGAAAAAGCTTGAAGAGCTGAGAGCCACTGGCCTTCCCGAGAAGTACTGCATTGAAGCTGAGCGCAAAGCTAA  1628

Query 1374  CATCCTGCCAGCTACCTCTGTGAAC  1398
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATCCTGCCAGCTACCTCTGTGAAC  1653