Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_11798
Subject:
NM_001282743.1
Aligned Length:
558
Identities:
428
Gaps:
130

Alignment

Query   1  MAELNTHVNVKEKIYAVRSVVPNKSNNEIVLVLQQFDFNVDKAVQAFVDGSAIQVLKEWNMTG-KKNNKRKRSK  73
                                                                       ||| ||||||||||
Sbjct   1  ------------------------------------------------------------MTGKKKNNKRKRSK  14

Query  74  SKQHQGNKDAKDKVERPEAGPLQPQPPQIQNGPMNGCEKDSSSTDSANEKPALIPREKKISILEEPSKALRGVT  147
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  15  SKQHQGNKDAKDKVERPEAGPLQPQPPQIQNGPMNGCEKDSSSTDSANEKPALIPREKKISILEEPSKALRGVT  88

Query 148  ---------------------------------------------------------------------GPNIE  152
                                                                                |||||
Sbjct  89  EGNRLLQQKLSLDGNPKPIHGTTERSDGLQWSAEQPCNPSKPKAKTSPVKSNTPAAHLEIKPDELAKKRGPNIE  162

Query 153  KSVKDLQRCTVSLTRYRVMIKEEVDSSVKKIKAAFAELHNCIIDKEVSLMAEMDKVKEEAMEILTARQKKAEEL  226
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163  KSVKDLQRCTVSLTRYRVMIKEEVDSSVKKIKAAFAELHNCIIDKEVSLMAEMDKVKEEAMEILTARQKKAEEL  236

Query 227  KRLTDLASQMAEMQLAELRAEIKHFVSERKYDEELGKAARFSCDIEQLKAQIMLCGEITHPKNNYSSRTPCSSL  300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237  KRLTDLASQMAEMQLAELRAEIKHFVSERKYDEELGKAARFSCDIEQLKAQIMLCGEITHPKNNYSSRTPCSSL  310

Query 301  LPLLNAHAATSGKQSNFSRKSSTHNKPSEGKAANPKMVSSLPSTADPSHQTMPANKQNGSSNQRRRFNPQYHNN  374
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 311  LPLLNAHAATSGKQSNFSRKSSTHNKPSEGKAANPKMVSSLPSTADPSHQTMPANKQNGSSNQRRRFNPQYHNN  384

Query 375  RLNGPAKSQGSGNEAEPLGKGNSRHEHRRQPHNGFRPKNKGGAKNQEASLGMKTPEAPAHSEKPRRRQHAADTS  448
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385  RLNGPAKSQGSGNEAEPLGKGNSRHEHRRQPHNGFRPKNKGGAKNQEASLGMKTPEAPAHSEKPRRRQHAADTS  458

Query 449  EARPFRGSVGRVSQCNLCPTRIEVSTDAAVLSVPAVTLVA  488
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 459  EARPFRGSVGRVSQCNLCPTRIEVSTDAAVLSVPAVTLVA  498