Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11798
- Subject:
- XM_005246459.1
- Aligned Length:
- 1467
- Identities:
- 1464
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGGCTGAACTCAATACTCATGTGAATGTCAAGGAAAAGATCTATGCAGTTAGATCAGTTGTTCCCAACAAAAG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTGAACTCAATACTCATGTGAATGTCAAGGAAAAGATCTATGCAGTTAGATCAGTTGTTCCCAACAAAAG 74
Query 75 CAATAATGAAATAGTCCTGGTGCTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTGCAAGCCTTTGTGGATG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAATAATGAAATAGTCCTGGTGCTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTGCAAGCCTTTGTGGATG 148
Query 149 GCAGTGCAATTCAAGTTCTAAAAGAATGGAATATGACAGG---AAAGAAGAACAATAAAAGAAAAAGAAGCAAG 219
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAGTGCAATTCAAGTTCTAAAAGAATGGAATATGACAGGAAAAAAGAAGAACAATAAAAGAAAAAGAAGCAAG 222
Query 220 TCCAAGCAGCATCAAGGCAACAAAGATGCTAAAGACAAGGTGGAGAGGCCTGAGGCAGGGCCCCTGCAGCCGCA 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCCAAGCAGCATCAAGGCAACAAAGATGCTAAAGACAAGGTGGAGAGGCCTGAGGCAGGGCCCCTGCAGCCGCA 296
Query 294 GCCACCACAGATTCAAAACGGCCCCATGAATGGCTGCGAGAAGGACAGCTCGTCCACAGATTCTGCTAACGAAA 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCCACCACAGATTCAAAACGGCCCCATGAATGGCTGCGAGAAGGACAGCTCGTCCACAGATTCTGCTAACGAAA 370
Query 368 AACCAGCCCTTATCCCTCGTGAGAAAAAGATCTCGATACTTGAGGAACCTTCAAAGGCACTTCGTGGGGTCACA 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AACCAGCCCTTATCCCTCGTGAGAAAAAGATCTCGATACTTGAGGAACCTTCAAAGGCACTTCGTGGGGTCACA 444
Query 442 GGCCCAAATATTGAGAAATCAGTGAAGGATTTGCAACGCTGCACCGTTTCTCTAACTAGATATCGCGTCATGAT 515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCCCAAATATTGAGAAATCAGTGAAGGATTTGCAACGCTGCACCGTTTCTCTAACTAGATATCGCGTCATGAT 518
Query 516 TAAGGAAGAAGTGGATAGTTCCGTGAAGAAGATCAAAGCTGCCTTTGCTGAATTACACAACTGCATCATTGACA 589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TAAGGAAGAAGTGGATAGTTCCGTGAAGAAGATCAAAGCTGCCTTTGCTGAATTACACAACTGCATCATTGACA 592
Query 590 AAGAAGTTTCATTAATGGCAGAAATGGATAAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGAAATCCTGACTGCTCGTCAGAAG 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGAAGTTTCATTAATGGCAGAAATGGATAAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGAAATCCTGACTGCTCGTCAGAAG 666
Query 664 AAAGCAGAAGAACTAAAGAGACTCACTGACCTTGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGGGC 737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAAGCAGAAGAACTAAAGAGACTCACTGACCTTGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGGGC 740
Query 738 AGAAATTAAGCACTTTGTCAGCGAGCGTAAATATGACGAGGAGCTCGGGAAAGCTGCCCGGTTTTCCTGTGACA 811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGAAATTAAGCACTTTGTCAGCGAGCGTAAATATGACGAGGAGCTCGGGAAAGCTGCCCGGTTTTCCTGTGACA 814
Query 812 TCGAACAGCTGAAGGCCCAAATCATGCTCTGCGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAACTATTCCTCAAGAACT 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCGAACAGCTGAAGGCCCAAATCATGCTCTGCGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAACTATTCCTCAAGAACT 888
Query 886 CCCTGCAGCTCCCTGCTGCCTCTGCTGAATGCGCACGCAGCAACCTCTGGGAAACAGAGTAACTTTTCCCGAAA 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCCTGCAGCTCCCTGCTGCCTCTGCTGAATGCGCACGCAGCAACCTCTGGGAAACAGAGTAACTTTTCCCGAAA 962
Query 960 ATCATCCACTCACAATAAGCCCTCTGAAGGCAAAGCGGCAAACCCCAAAATGGTGAGCAGTCTCCCCAGCACCG 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATCATCCACTCACAATAAGCCCTCTGAAGGCAAAGCGGCAAACCCCAAAATGGTGAGCAGTCTCCCCAGCACCG 1036
Query 1034 CCGACCCCTCTCACCAGACCATGCCGGCCAACAAGCAGAATGGATCTTCTAACCAAAGACGGAGATTTAATCCA 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCGACCCCTCTCACCAGACCATGCCGGCCAACAAGCAGAATGGATCTTCTAACCAAAGACGGAGATTTAATCCA 1110
Query 1108 CAGTATCATAACAACAGGCTAAATGGGCCTGCCAAGTCGCAGGGCAGTGGGAATGAAGCCGAGCCACTGGGAAA 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGTATCATAACAACAGGCTAAATGGGCCTGCCAAGTCGCAGGGCAGTGGGAATGAAGCCGAGCCACTGGGAAA 1184
Query 1182 GGGCAACAGCCGCCACGAACACAGAAGACAGCCGCACAACGGCTTCCGGCCCAAAAACAAAGGCGGTGCCAAAA 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGGCAACAGCCGCCACGAACACAGAAGACAGCCGCACAACGGCTTCCGGCCCAAAAACAAAGGCGGTGCCAAAA 1258
Query 1256 ATCAAGAGGCTTCCTTGGGGATGAAGACCCCCGAGGCCCCGGCCCATTCTGAAAAGCCCCGGCGAAGGCAGCAC 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATCAAGAGGCTTCCTTGGGGATGAAGACCCCCGAGGCCCCGGCCCATTCTGAAAAGCCCCGGCGAAGGCAGCAC 1332
Query 1330 GCTGCAGACACCTCGGAGGCCAGGCCCTTCCGGGGTAGTGTCGGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTCTGCCCCAC 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCTGCAGACACCTCGGAGGCCAGGCCCTTCCGGGGTAGTGTCGGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTCTGCCCCAC 1406
Query 1404 GAGAATAGAAGTTTCCACAGATGCAGCAGTTCTCTCAGTCCCGGCTGTGACGTTGGTGGCC 1464
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAGAATAGAAGTTTCCACAGATGCAGCAGTTCTCTCAGTCCCGGCTGTGACGTTGGTGGCC 1467