Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11798
• Subject: XM_006496211.3
• Aligned Length: 1737
• Identities: 1279
• Gaps: 276

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGGCTGAACTCAA  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGGAACACAGGAAACCGGCGCTTCGGCAAGCAAGGCTTATACCCCTAGAAGGAAGATGGCTGAACTCAA  74

Query   15  TACTCATGTGAATGTCAAGGAAAAGATCTATGCAGTTAGATCAGTTGTTCCCAACAAAAGCAATAATGAAATAG  88
            .|||||||||||..||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CACTCATGTGAACATCAAAGAGAAGATCTACGCAGTTAGATCAGTTGTTCCGAACAAAAGCAATAATGAAATCG  148

Query   89  TCCTGGTGCTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTGCAAGCCTTTGTGGATGGCAGTGCAATTCAA  162
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  TGCTGGTACTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTACAGGCCTTTGTGGATGGCAGTGCTATTCAA  222

Query  163  GTTCTAAAAGAATGGAATATGACAGGA---AAGAAGAACAATAAAAGAAAAAGAAGCAAGTCCAAGCAGCATCA  233
            |||||.|||||||||||.|||||.|||   ||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  GTTCTTAAAGAATGGAACATGACGGGAAAGAAGAAGAATAATAAAAGGAAGAGAAGCAAATCCAAGCAGCATCA  296

Query  234  AGGCAACAAAGATGCTAAAGACAAGGTGGAGAGGCCTGAGGCAGGGCCCCTGCAGCCGCAGCCACCACAGATTC  307
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||..||||||||||||||.|||.||||||.|.|.|
Sbjct  297  AGGCAACAAAGATGCTAAGGACAAGGTGGAGAGGCCAGAGGTGGGGCCCCTGCAGCCCCAGGCACCACTGGTAC  370

Query  308  AAAACGGCCCCATGAATGGCTGCGAGAAGGACAGCTCGTCCACAGATTCTGCTAACGAAAAACCAGCCCTTATC  381
            ||||.||.|.|||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.|||.|.|..|||||||..|||||.|..
Sbjct  371  AAAATGGTCACATGAATGGCTGCGAAAAGGACAGCTCATCCCCTGACTCTACCAGAGAAAAACTGGCCCTCACA  444

Query  382  CCTCGTGAGAAAAAGATCTCGATACTTGAGGAACCTTCAAAGGCACTTCGTGGGGTCAC---------------  440
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||.|||.|..|||||||||||               
Sbjct  445  CCACGTGAGAAAAAGATCTCGATACTGGAGGAACCTCCAAGGGCTCAGCGTGGGGTCACAGAAGGCGGCAGACT  518

Query  441  --------------------------------------------------------------------------  440
                                                                                      
Sbjct  519  ACTGCAGCAGAAAATGTCCTTAGATGGGAACCCCAGAGCGATTCATGGACCATCAGAGAGGTCAGATGGCCCAC  592

Query  441  --------------------------------------------------------------------------  440
                                                                                      
Sbjct  593  AGTGGTCAGCTGGGCAGCCTTGTAACCCAAGCAAGCCTAAGGCAAAAACATCTCCTGTTAAGTCCAATGCCCCT  666

Query  441  --------------------------------------------AGGCCCAAATATTGAGAAATCAGTGAAGGA  470
                                                        |||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  GCAGCTCATCTTGAAATAAAGCCAGATGAGCTGGCAAAGAAAAGAGGCCCAAATATTGAGAAATCGGTGAAGGA  740

Query  471  TTTGCAACGCTGCACCGTTTCTCTAACTAGATATCGCGTCATGATTAAGGAAGAAGTGGATAGTTCCGTGAAGA  544
            |.||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  741  TCTGCAGCGCTGCACTGTTTCTCTGACGAGATACCGCGTCATGATCAAGGAAGAAGTGGACAGTTCCGTGAAGA  814

Query  545  AGATCAAAGCTGCCTTTGCTGAATTACACAACTGCATCATTGACAAAGAAGTTTCATTAATGGCAGAAATGGAT  618
            ||||||||||.||.||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||.
Sbjct  815  AGATCAAAGCAGCATTTGCTGAGCTACACAACTGCATCATTGACAAAGAAGTTTCACTGATGGCAGAAATGGAC  888

Query  619  AAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGAAATCCTGACTGCTCGTCAGAAGAAAGCAGAAGAACTAAAGAGACTCACTGA  692
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct  889  AAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGACATCCTGACTGCCCGTCAGAAGAAAGCAGAGGAGCTGAAGAGACTGACTGA  962

Query  693  CCTTGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGGGCAGAAATTAAGCACTTTGTCAGCGAGCGTA  766
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  963  CCTAGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGAGCTGAAATTAAGCACTTTGTCAGCGAACGCA  1036

Query  767  AATATGACGAGGAGCTCGGGAAAGCTGCCCGGTTTTCCTGTGACATCGAACAGCTGAAGGCCCAAATCATGCTC  840
            |.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||.||.||
Sbjct 1037  AGTATGACGAGGAGCTGGGGAAGGCTGCCCGCTTCTCCTGTGACATTGAACAACTGAAAGCCCAAATCCTGATC  1110

Query  841  TGCGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAACTATTCCTCAAGAACTCCCTGCAGCTCCCTGCTGCCTCTGCTGAA  914
            ||.|||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGTGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAGCTACTCCTCAAGAACTCCCTGCAGCTCCCTGCTGCCTCTGCTGAA  1184

Query  915  TGCGCACGCAGCAACCTCTGGGAAACAGAGTAACTTTTCCCGAAAATCATCCACTCACAATAAGCCCTCTGAAG  988
            ..|.||.||.|.|.|.||.|||||||||.|.||.|||.||||.||.||||||..||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1185  CACTCATGCGGTAGCTTCCGGGAAACAGGGGAATTTTGCCCGGAAGTCATCCGGTCACAACAAGCCCTCTGAGG  1258

Query  989  GCAAAGCGGCAAACCCCAAAATGGTGAGCAGTCTCCCCAGCACCGCCGACCCCTCTCACCAGACCATGCCGGCC  1062
            |.|||||.|||||||||||||||||||||.|.||..|||.|||.|||||..|.|.|||||||||||||||..|.
Sbjct 1259  GGAAAGCAGCAAACCCCAAAATGGTGAGCGGACTTGCCAACACTGCCGATGCGTGTCACCAGACCATGCCCACT  1332

Query 1063  AACA---AGCAGAATGGATCTTCTAACCAAAGACGGAGATTTAATCCACAGTATCATAACAACAGGCTAAATGG  1133
            ||||   |||||||||||.||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
Sbjct 1333  AACAAGCAGCAGAATGGACCTTCCAGCCAAAGACGAAGATTTAATCCACAGTATC---ACAACAGGCTAAATGG  1403

Query 1134  GCCTGCCAAGTCGCAGGGCAGTGGGAATGAAGCCGAGCCACTGGGAAAGGGCAACAGCCGCCACGAACACAGAA  1207
            .||.||||||||.|||||..||||.||||||||.||.||..|||..|||.|||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1404  TCCAGCCAAGTCACAGGGTGGTGGTAATGAAGCGGATCCCATGGCGAAGAGCAACAGCCGCCATGAACACAGAA  1477

Query 1208  GACAGCCGCACAACGGCTTCCGGCCCAAAAACAAAGGCGGTGCCAAAAATCAAGAGGCTTCCTTGGGGATGAAG  1281
            |||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||..|||||||||..|||
Sbjct 1478  GACAGCCACATAATGGTTTCCGTCCCAAAAACAAAGGTGGTGCCAAAAACCAAGAGGCCCCCTTGGGGACAAAG  1551

Query 1282  ACCCCCGAGGCCCCGGCCCATTCTGAAAAGCCCCGGCGAAGGCAGCACGCTGCAGACACCTCGGAGGCCAGGCC  1355
            .||||.||||||||..|.||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||.||..|||||||||||
Sbjct 1552  GCCCCAGAGGCCCCCCCACATTCTGAAAAGGCCCGTCGAAGGCAGCATGCTGCAGACAACTTAGAGGCCAGGCC  1625

Query 1356  CTTCCGGGGTAGTGTCGGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTCTGCCCCACGAGAATAGAAGTTTCCACAGATGCAG  1429
            .||||||||||.|||..||||||||||||||||||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||..
Sbjct 1626  TTTCCGGGGTAATGTTAGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTTTGTCCCTCTAGAATAGAAGTTTCCACGGAGGCCA  1699

Query 1430  CAGTTCTCTCAGTCCCGGCTGTGACGTTGGTGGCC  1464
            |.||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1700  CGGTCCTCTCAGTCCCCGCTGTGACGTTGGTGGCC  1734