Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11798
• Subject: XM_017003784.2
• Aligned Length: 1557
• Identities: 1464
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGACCCGTTTTGCCATAGCTCTTCAGAAACCAGGCTGCTTTCAGGAACATTGCTGTGGATTCCCAGGGCCTA  74

Query    1  ----------------ATGGCTGAACTCAATACTCATGTGAATGTCAAGGAAAAGATCTATGCAGTTAGATCAG  58
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCCACTAGAAGCAAGATGGCTGAACTCAATACTCATGTGAATGTCAAGGAAAAGATCTATGCAGTTAGATCAG  148

Query   59  TTGTTCCCAACAAAAGCAATAATGAAATAGTCCTGGTGCTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTG  132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGTTCCCAACAAAAGCAATAATGAAATAGTCCTGGTGCTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTG  222

Query  133  CAAGCCTTTGTGGATGGCAGTGCAATTCAAGTTCTAAAAGAATGGAATATGACAGG---AAAGAAGAACAATAA  203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGCCTTTGTGGATGGCAGTGCAATTCAAGTTCTAAAAGAATGGAATATGACAGGAAAAAAGAAGAACAATAA  296

Query  204  AAGAAAAAGAAGCAAGTCCAAGCAGCATCAAGGCAACAAAGATGCTAAAGACAAGGTGGAGAGGCCTGAGGCAG  277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAAAAAGAAGCAAGTCCAAGCAGCATCAAGGCAACAAAGATGCTAAAGACAAGGTGGAGAGGCCTGAGGCAG  370

Query  278  GGCCCCTGCAGCCGCAGCCACCACAGATTCAAAACGGCCCCATGAATGGCTGCGAGAAGGACAGCTCGTCCACA  351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCCCCTGCAGCCGCAGCCACCACAGATTCAAAACGGCCCCATGAATGGCTGCGAGAAGGACAGCTCGTCCACA  444

Query  352  GATTCTGCTAACGAAAAACCAGCCCTTATCCCTCGTGAGAAAAAGATCTCGATACTTGAGGAACCTTCAAAGGC  425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATTCTGCTAACGAAAAACCAGCCCTTATCCCTCGTGAGAAAAAGATCTCGATACTTGAGGAACCTTCAAAGGC  518

Query  426  ACTTCGTGGGGTCACAGGCCCAAATATTGAGAAATCAGTGAAGGATTTGCAACGCTGCACCGTTTCTCTAACTA  499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACTTCGTGGGGTCACAGGCCCAAATATTGAGAAATCAGTGAAGGATTTGCAACGCTGCACCGTTTCTCTAACTA  592

Query  500  GATATCGCGTCATGATTAAGGAAGAAGTGGATAGTTCCGTGAAGAAGATCAAAGCTGCCTTTGCTGAATTACAC  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GATATCGCGTCATGATTAAGGAAGAAGTGGATAGTTCCGTGAAGAAGATCAAAGCTGCCTTTGCTGAATTACAC  666

Query  574  AACTGCATCATTGACAAAGAAGTTTCATTAATGGCAGAAATGGATAAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGAAATCCT  647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACTGCATCATTGACAAAGAAGTTTCATTAATGGCAGAAATGGATAAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGAAATCCT  740

Query  648  GACTGCTCGTCAGAAGAAAGCAGAAGAACTAAAGAGACTCACTGACCTTGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGC  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GACTGCTCGTCAGAAGAAAGCAGAAGAACTAAAGAGACTCACTGACCTTGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGC  814

Query  722  TGGCCGAACTCAGGGCAGAAATTAAGCACTTTGTCAGCGAGCGTAAATATGACGAGGAGCTCGGGAAAGCTGCC  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGCCGAACTCAGGGCAGAAATTAAGCACTTTGTCAGCGAGCGTAAATATGACGAGGAGCTCGGGAAAGCTGCC  888

Query  796  CGGTTTTCCTGTGACATCGAACAGCTGAAGGCCCAAATCATGCTCTGCGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAA  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGGTTTTCCTGTGACATCGAACAGCTGAAGGCCCAAATCATGCTCTGCGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAA  962

Query  870  CTATTCCTCAAGAACTCCCTGCAGCTCCCTGCTGCCTCTGCTGAATGCGCACGCAGCAACCTCTGGGAAACAGA  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTATTCCTCAAGAACTCCCTGCAGCTCCCTGCTGCCTCTGCTGAATGCGCACGCAGCAACCTCTGGGAAACAGA  1036

Query  944  GTAACTTTTCCCGAAAATCATCCACTCACAATAAGCCCTCTGAAGGCAAAGCGGCAAACCCCAAAATGGTGAGC  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTAACTTTTCCCGAAAATCATCCACTCACAATAAGCCCTCTGAAGGCAAAGCGGCAAACCCCAAAATGGTGAGC  1110

Query 1018  AGTCTCCCCAGCACCGCCGACCCCTCTCACCAGACCATGCCGGCCAACAAGCAGAATGGATCTTCTAACCAAAG  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGTCTCCCCAGCACCGCCGACCCCTCTCACCAGACCATGCCGGCCAACAAGCAGAATGGATCTTCTAACCAAAG  1184

Query 1092  ACGGAGATTTAATCCACAGTATCATAACAACAGGCTAAATGGGCCTGCCAAGTCGCAGGGCAGTGGGAATGAAG  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACGGAGATTTAATCCACAGTATCATAACAACAGGCTAAATGGGCCTGCCAAGTCGCAGGGCAGTGGGAATGAAG  1258

Query 1166  CCGAGCCACTGGGAAAGGGCAACAGCCGCCACGAACACAGAAGACAGCCGCACAACGGCTTCCGGCCCAAAAAC  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCGAGCCACTGGGAAAGGGCAACAGCCGCCACGAACACAGAAGACAGCCGCACAACGGCTTCCGGCCCAAAAAC  1332

Query 1240  AAAGGCGGTGCCAAAAATCAAGAGGCTTCCTTGGGGATGAAGACCCCCGAGGCCCCGGCCCATTCTGAAAAGCC  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAAGGCGGTGCCAAAAATCAAGAGGCTTCCTTGGGGATGAAGACCCCCGAGGCCCCGGCCCATTCTGAAAAGCC  1406

Query 1314  CCGGCGAAGGCAGCACGCTGCAGACACCTCGGAGGCCAGGCCCTTCCGGGGTAGTGTCGGTAGGGTTTCACAGT  1387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCGGCGAAGGCAGCACGCTGCAGACACCTCGGAGGCCAGGCCCTTCCGGGGTAGTGTCGGTAGGGTTTCACAGT  1480

Query 1388  GCAATCTCTGCCCCACGAGAATAGAAGTTTCCACAGATGCAGCAGTTCTCTCAGTCCCGGCTGTGACGTTGGTG  1461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCAATCTCTGCCCCACGAGAATAGAAGTTTCCACAGATGCAGCAGTTCTCTCAGTCCCGGCTGTGACGTTGGTG  1554

Query 1462  GCC  1464
            |||
Sbjct 1555  GCC  1557