Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11825
• Subject: NM_001242333.2
• Aligned Length: 1151
• Identities: 1019
• Gaps: 115

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------ATGGCCCAGCCAGGGTCCGG  20
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGCCGGGGGTTGTGCCGGCGCAGCGCTGAGAATCCCGACGCGGGGCCGGTGATGGCCCAGCCAGGGTCCGG  74

Query   21  CTGCAAAGCGACCACCCGCTGTCTTGAAGGGACCGCGCCGCCCGCCATGGCTCAGTCTGACGCCGAGGCCCTGG  94
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGCAAAGCGACCACCCGCTGTCTTGAAGGGACCGCGCCGCCCGCCATGGCTCAGTCTGACGCCGAGGCCCTGG  148

Query   95  CAGGAGCTCTGGACAAGGACGAGGGTCAGGCCTCCCCATGTACGCCCAGCACGCCATCTGTCTGCTCACCGCCC  168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGGAGCTCTGGACAAGGACGAGGGTCAGGCCTCCCCATGTACGCCCAGCACGCCATCTGTCTGCTCACCGCCC  222

Query  169  TCTGCCGCCTCCTCCGTGCCGTCTGCAGGCAAGAACATCTGCTCCAGCTGCGGCCTCGAGATCCTGGACCGATA  242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTGCCGCCTCCTCCGTGCCGTCTGCAGGCAAGAACATCTGCTCCAGCTGCGGCCTCGAGATCCTGGACCGATA  296

Query  243  TCTGCTCAAGGTCAACAACCTCATCTGGCACGTGCGGTGCCTCGAGTGCTCCGTGTGTCGCACGTCGCTGAGGC  316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTGCTCAAGGTCAACAACCTCATCTGGCACGTGCGGTGCCTCGAGTGCTCCGTGTGTCGCACGTCGCTGAGGC  370

Query  317  AGCAGAACAGCTGCTACATCAAGAACAAGGAGATCTTCTGCAAGATGGACTACTTCAGCCGATTCGGGACCAAG  390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCAGAACAGCTGCTACATCAAGAACAAGGAGATCTTCTGCAAGATGGACTACTTCAGCCGATTCGGGACCAAG  444

Query  391  TGTGCCCGGTGCGGCCGACAGATCTACGCCAGCGACTGGGTGCGGAGAGCTCGCGGCAACGCCTACCACCTGGC  464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGTGCCCGGTGCGGCCGACAGATCTACGCCAGCGACTGGGTGCGGAGAGCTCGCGGCAACGCCTACCACCTGGC  518

Query  465  CTGCTTCGCCTGCTTCTCGTGCAAGCGCCAGCTGTCCACTGGTGAGGAGTTCGGCCTGGTCGAGGAGAAGGTGC  538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGCTTCGCCTGCTTCTCGTGCAAGCGCCAGCTGTCCACTGGTGAGGAGTTCGGCCTGGTCGAGGAGAAGGTGC  592

Query  539  TCTGCCGCATCCACTACGACACCATGATTGAGAACCTCAAGAGGGCCGCCGAGAACGGGAACGGCCTCACGTTG  612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTGCCGCATCCACTACGACACCATGATTGAGAACCTCAAGAGGGCCGCCGAGAACGGGAACGGCCTCACGTTG  666

Query  613  GAGGGGGCAGTGCCCTCGGAACAGGACAGTCAACCCAAGCCGGCCAAGCGCGCGCGGACGTCCTTCACCGCGGA  686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGGGGCAGTGCCCTCGGAACAGGACAGTCAACCCAAGCCGGCCAAGCGCGCGCGGACGTCCTTCACCGCGGA  740

Query  687  ACAGCTGCAGGTTATGCAGGCGCAGTTCGCGCAGGACAACAACCCCGACGCTCAGACGCTGCAGAAGCTGGCGG  760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGCTGCAGGTTATGCAGGCGCAGTTCGCGCAGGACAACAACCCCGACGCTCAGACGCTGCAGAAGCTGGCGG  814

Query  761  ACATGACGGGCCTCAGCCGGAGAGTCATCCAGGTGTGGTTTCAAAACTGCCGGGCGCGTCATAAAAAGCACACG  834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACATGACGGGCCTCAGCCGGAGAGTCATCCAGGTGTGGTTTCAAAACTGCCGGGCGCGTCATAAAAAGCACACG  888

Query  835  CCGCAACACCCAGTGCCGCCCTCGGGGGCGCCCCCGTCCCGCCTTCCCTCCGCCCTGTCCGACGACATCCACTA  908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCGCAACACCCAGTGCCGCCCTCGGGGGCGCCCCCGTCCCGCCTTCCCTCCGCCCTGTCCGACGACATCCACTA  962

Query  909  CACCCCGTTCAGCAGCCCCGAGCGGGCGCGCATGGTCACCCTGCACGGCTACATTGAGAGTCA----GGTACAG  978
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ..|.|||
Sbjct  963  CACCCCGTTCAGCAGCCCCGAGCGGGCGCGCATGGTCACCCTGCACGGCTACATTGAGAGTCATCCTTTTTCAG  1036

Query  979  TGCGGGCAGGT-GCACTGCCGGCTGCCTTACACCGCA-CCCCCCGT--CCACCTCAAAGCCGATATGGATGGGC  1048
            |.|       | .|.||||||||  .|||   ||||| |..|||||  .|.||.||.|||           .||
Sbjct 1037  TAC-------TAACGCTGCCGGC--ACTT---CCGCATCTGCCCGTGGGCGCCCCACAGC-----------TGC  1087

Query 1049  CGCTCTCCAACCGGGGTGAGAAGGTCATCCTTTTTCAGTAC  1089
            |.||   ||.|||.                           
Sbjct 1088  CCCT---CAGCCGC---------------------------  1098