Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11825
- Subject:
- XM_011518521.2
- Aligned Length:
- 1252
- Identities:
- 1044
- Gaps:
- 194
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTACTGGAAGCATGAGAACGCCGCCCCGGCGTTGCCCGAGGGCTGCCGGCTGCCGGCCGAGGGCGGCCCCGC 74
Query 1 -------------ATGGCCCAGCCAGGGTCCGGCTGCAAAGCGACCACCCGCTGTCTTGAAGGGACCGCGCCGC 61
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Sbjct 75 CACCGACCAGGTGATGGCCCAGCCAGGGTCCGGCTGCAAAGCGACCACCCGCTGTCTTGAAGGGACCGCGCCGC 148
Query 62 CCGCCATGGCTCAGTCTGACGCCGAGGCCCTGGCAGGAGCTCTGGACAAGGACGAGGGTCAGGCCTCCCCATGT 135
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Sbjct 149 CCGCCATGGCTCAGTCTGACGCCGAGGCCCTGGCAGGAGCTCTGGACAAGGACGAGGGTCAGGCCTCCCCATGT 222
Query 136 ACGCCCAGCACGCCATCTGTCTGCTCACCGCCCTCTGCCGCCTCCTCCGTGCCGTCTGCAGGCAAGAACATCTG 209
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Sbjct 223 ACGCCCAGCACGCCATCTGTCTGCTCACCGCCCTCTGCCGCCTCCTCCGTGCCGTCTGCAGGCAAGAACATCTG 296
Query 210 CTCCAGCTGCGGCCTCGAGATCCTGGACCGATATCTGCTCAAGGTCAACAACCTCATCTGGCACGTGCGGTGCC 283
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Sbjct 297 CTCCAGCTGCGGCCTCGAGATCCTGGACCGATATCTGCTCAAGGTCAACAACCTCATCTGGCACGTGCGGTGCC 370
Query 284 TCGAGTGCTCCGTGTGTCGCACGTCGCTGAGGCAGCAGAACAGCTGCTACATCAAGAACAAGGAGATCTTCTGC 357
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Sbjct 371 TCGAGTGCTCCGTGTGTCGCACGTCGCTGAGGCAGCAGAACAGCTGCTACATCAAGAACAAGGAGATCTTCTGC 444
Query 358 AAGATGGACTACTTCAGCCGATTCGGGACCAAGTGTGCCCGGTGCGGCCGACAGATCTACGCCAGCGACTGGGT 431
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Sbjct 445 AAGATGGACTACTTCAGCCGATTCGGGACCAAGTGTGCCCGGTGCGGCCGACAGATCTACGCCAGCGACTGGGT 518
Query 432 GCGGAGAGCTCGCGGCAACGCCTACCACCTGGCCTGCTTCGCCTGCTTCTCGTGCAAGCGCCAGCTGTCCACTG 505
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Sbjct 519 GCGGAGAGCTCGCGGCAACGCCTACCACCTGGCCTGCTTCGCCTGCTTCTCGTGCAAGCGCCAGCTGTCCACTG 592
Query 506 GTGAGGAGTTCGGCCTGGTCGAGGAGAAGGTGCTCTGCCGCATCCACTACGACACCATGATTGAGAACCTCAAG 579
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Sbjct 593 GTGAGGAGTTCGGCCTGGTCGAGGAGAAGGTGCTCTGCCGCATCCACTACGACACCATGATTGAGAACCTCAAG 666
Query 580 AGGGCCGCCGAGAACGGGAACGGCCTCACGTTGGAGGGGGCAGTGCCCTCGGAACAGGACAGTCAACCCAAGCC 653
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Sbjct 667 AGGGCCGCCGAGAACGGGAACGGCCTCACGTTGGAGGGGGCAGTGCCCTCGGAACAGGACAGTCAACCCAAGCC 740
Query 654 GGCCAAGCGCGCGCGGACGTCCTTCACCGCGGAACAGCTGCAGGTTATGCAGGCGCAGTTCGCGCAGGACAACA 727
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Sbjct 741 GGCCAAGCGCGCGCGGACGTCCTTCACCGCGGAACAGCTGCAGGTTATGCAGGCGCAGTTCGCGCAGGACAACA 814
Query 728 ACCCCGACGCTCAGACGCTGCAGAAGCTGGCGGACATGACGGGCCTCAGCCGGAGAGTCATCCAGGTGTGGTTT 801
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Sbjct 815 ACCCCGACGCTCAGACGCTGCAGAAGCTGGCGGACATGACGGGCCTCAGCCGGAGAGTCATCCAGGTGTGGTTT 888
Query 802 CAAAACTGCCGGGCGCGTCATAAAAAGCACACGCCGCAACACCCAGTGCCGCCCTCGGGGGCGCCCCCGTCCCG 875
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Sbjct 889 CAAAACTGCCGGGCGCGTCATAAAAAGCACACGCCGCAACACCCAGTGCCGCCCTCGGGGGCGCCCCCGTCCCG 962
Query 876 CCTTCCCTCCGCCCTGTCCGACGACATCCACTACACCCCGTTCAGCAGCCCCGAGCGGGCGCGCATGGTCACCC 949
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Sbjct 963 CCTTCCCTCCGCCCTGTCCGACGACATCCACTACACCCCGTTCAGCAGCCCCGAGCGGGCGCGCATGGTCACCC 1036
Query 950 TGCACGGCTACATTGAGA---------GTCAGGTACAGTGCGGGCAGG----------TGCACTGCCGGC---- 1000
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Sbjct 1037 TGCACGGCTACATTGAGACAAATGCGCGTC--------TGCTGGCAGGGATGTGTGATTG--GTGCGGGCATTT 1100
Query 1001 ----TGCC--TTACACCGCA----CCCCCCGTCCACCTCAAAGCC----------------------------- 1035
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Sbjct 1101 GATTTGGCAGTTACAGCGTATTATCCC----TCCA---CAAAGCCTTCATTACGGTGCTGCTAACAACACCGCA 1167
Query 1036 GAT-----ATGGATG---------GGCCGCTCTCCAACCGGGGTGAGAAGGTCATCCTTTTTCAGTAC 1089
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Sbjct 1168 GATAAAGCATGGATGTCCCCGCGTGCCAGC-CTCCA-----GGTGA-----TTATAACATTTCGG--- 1221