Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11825
• Subject: XM_011518522.3
• Aligned Length: 1165
• Identities: 1044
• Gaps: 107

Alignment

Query    1  ATGGCCCAGCCAGGGTCCGGCTGCAAAGCGACCACCCGCTGTCTTGAAGGGACCGCGCCGCCCGCCATGGCTCA  74
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Sbjct    1  ATGGCCCAGCCAGGGTCCGGCTGCAAAGCGACCACCCGCTGTCTTGAAGGGACCGCGCCGCCCGCCATGGCTCA  74

Query   75  GTCTGACGCCGAGGCCCTGGCAGGAGCTCTGGACAAGGACGAGGGTCAGGCCTCCCCATGTACGCCCAGCACGC  148
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Sbjct   75  GTCTGACGCCGAGGCCCTGGCAGGAGCTCTGGACAAGGACGAGGGTCAGGCCTCCCCATGTACGCCCAGCACGC  148

Query  149  CATCTGTCTGCTCACCGCCCTCTGCCGCCTCCTCCGTGCCGTCTGCAGGCAAGAACATCTGCTCCAGCTGCGGC  222
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Sbjct  149  CATCTGTCTGCTCACCGCCCTCTGCCGCCTCCTCCGTGCCGTCTGCAGGCAAGAACATCTGCTCCAGCTGCGGC  222

Query  223  CTCGAGATCCTGGACCGATATCTGCTCAAGGTCAACAACCTCATCTGGCACGTGCGGTGCCTCGAGTGCTCCGT  296
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Sbjct  223  CTCGAGATCCTGGACCGATATCTGCTCAAGGTCAACAACCTCATCTGGCACGTGCGGTGCCTCGAGTGCTCCGT  296

Query  297  GTGTCGCACGTCGCTGAGGCAGCAGAACAGCTGCTACATCAAGAACAAGGAGATCTTCTGCAAGATGGACTACT  370
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Sbjct  297  GTGTCGCACGTCGCTGAGGCAGCAGAACAGCTGCTACATCAAGAACAAGGAGATCTTCTGCAAGATGGACTACT  370

Query  371  TCAGCCGATTCGGGACCAAGTGTGCCCGGTGCGGCCGACAGATCTACGCCAGCGACTGGGTGCGGAGAGCTCGC  444
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Sbjct  371  TCAGCCGATTCGGGACCAAGTGTGCCCGGTGCGGCCGACAGATCTACGCCAGCGACTGGGTGCGGAGAGCTCGC  444

Query  445  GGCAACGCCTACCACCTGGCCTGCTTCGCCTGCTTCTCGTGCAAGCGCCAGCTGTCCACTGGTGAGGAGTTCGG  518
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Sbjct  445  GGCAACGCCTACCACCTGGCCTGCTTCGCCTGCTTCTCGTGCAAGCGCCAGCTGTCCACTGGTGAGGAGTTCGG  518

Query  519  CCTGGTCGAGGAGAAGGTGCTCTGCCGCATCCACTACGACACCATGATTGAGAACCTCAAGAGGGCCGCCGAGA  592
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Sbjct  519  CCTGGTCGAGGAGAAGGTGCTCTGCCGCATCCACTACGACACCATGATTGAGAACCTCAAGAGGGCCGCCGAGA  592

Query  593  ACGGGAACGGCCTCACGTTGGAGGGGGCAGTGCCCTCGGAACAGGACAGTCAACCCAAGCCGGCCAAGCGCGCG  666
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Sbjct  593  ACGGGAACGGCCTCACGTTGGAGGGGGCAGTGCCCTCGGAACAGGACAGTCAACCCAAGCCGGCCAAGCGCGCG  666

Query  667  CGGACGTCCTTCACCGCGGAACAGCTGCAGGTTATGCAGGCGCAGTTCGCGCAGGACAACAACCCCGACGCTCA  740
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Sbjct  667  CGGACGTCCTTCACCGCGGAACAGCTGCAGGTTATGCAGGCGCAGTTCGCGCAGGACAACAACCCCGACGCTCA  740

Query  741  GACGCTGCAGAAGCTGGCGGACATGACGGGCCTCAGCCGGAGAGTCATCCAGGTGTGGTTTCAAAACTGCCGGG  814
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Sbjct  741  GACGCTGCAGAAGCTGGCGGACATGACGGGCCTCAGCCGGAGAGTCATCCAGGTGTGGTTTCAAAACTGCCGGG  814

Query  815  CGCGTCATAAAAAGCACACGCCGCAACACCCAGTGCCGCCCTCGGGGGCGCCCCCGTCCCGCCTTCCCTCCGCC  888
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Sbjct  815  CGCGTCATAAAAAGCACACGCCGCAACACCCAGTGCCGCCCTCGGGGGCGCCCCCGTCCCGCCTTCCCTCCGCC  888

Query  889  CTGTCCGACGACATCCACTACACCCCGTTCAGCAGCCCCGAGCGGGCGCGCATGGTCACCCTGCACGGCTACAT  962
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Sbjct  889  CTGTCCGACGACATCCACTACACCCCGTTCAGCAGCCCCGAGCGGGCGCGCATGGTCACCCTGCACGGCTACAT  962

Query  963  TGAGA---------GTCAGGTACAGTGCGGGCAGG----------TGCACTGCCGGC--------TGCC--TTA  1007
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Sbjct  963  TGAGACAAATGCGCGTC--------TGCTGGCAGGGATGTGTGATTG--GTGCGGGCATTTGATTTGGCAGTTA  1026

Query 1008  CACCGCA----CCCCCCGTCCACCTCAAAGCC-----------------------------GAT-----ATGGA  1043
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Sbjct 1027  CAGCGTATTATCCC----TCCA---CAAAGCCTTCATTACGGTGCTGCTAACAACACCGCAGATAAAGCATGGA  1093

Query 1044  TG---------GGCCGCTCTCCAACCGGGGTGAGAAGGTCATCCTTTTTCAGTAC  1089
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Sbjct 1094  TGTCCCCGCGTGCCAGC-CTCCA-----GGTGA-----TTATAACATTTCGG---  1134