Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11828
- Subject:
- NM_001302140.1
- Aligned Length:
- 2061
- Identities:
- 1478
- Gaps:
- 484
Alignment
Query 1 MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLDFSSSLGIIVKDFET 74
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Sbjct 1 MLRVIVESATNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLDSSSSLVIVVKDFET 74
Query 75 IGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDLVIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGE 148
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Sbjct 75 IGQNKLIGTATVSLKDLIGDQNRSLPYKQTSLLNEKGQDTGATIDLVIGYTPPSAPHPNDPSGTSVPGMGEEEE 148
Query 149 EDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGTVSEAQLARRLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKV 222
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Sbjct 149 EDQGDEDRVDGIVRGPGPKGPSGTVSEAQLARRITKGKSSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLCGNNIRPVVKV 222
Query 223 HVCGQTHRTRIKRGNNPFFDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVM 296
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Sbjct 223 HICGQTHRTRIKRGNNPFFDELFFYNVHITPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVM 296
Query 297 RKWLLLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTFLLKIYRAEDI 370
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Sbjct 297 RKWLLLNDPEDTSSGAKGYMKVSMFVLGTGDEPPPEKRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTFMLKIYRAEDI 370
Query 371 PQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYD 444
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Sbjct 371 PQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIERNANPEWNQVVNLQIKFPSMCEKIKLTVYD 444
Query 445 WDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTGAASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPD 518
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Sbjct 445 WDRLTKNDVVGTTYLYLSKIAASGGEVEDFSSSGAGAASYTATTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPD 518
Query 519 PYDELNTGKGEGVAYRGRILVELATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEA 592
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Sbjct 519 PYDELNSGKGEGVAYRGRIFVELNTFLEKKPPEKKLEPISSDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEA 592
Query 593 IQFEVSIGNYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTLLAMAER 666
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Sbjct 593 IQFEVSIGNYGNKFDATCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTLLVMAER 666
Query 667 LQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDTQIRKLRSRSLSQIHEAAVRM 740
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Sbjct 667 LQSNIEAVKSGIQGKIPANQLAEVWLKLIDEVIEDTRYTLPVTEGKANVTVLDTQIRKLRSRFLSQIHEAALRM 740
Query 741 RSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQ 814
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Sbjct 741 RSEATDVKSTLLEIEEWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGGNASGKYCGKTQ 814
Query 815 TIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDV 888
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Sbjct 815 TILLKYPQEKTNGPKVPVELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALVFGKWGTSGLVGRHKFSDV 888
Query 889 TGKIKLKREFFLPPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDKAA 962
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Sbjct 889 TGKIKLKREFFLPPKGWEWEGDWVVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNENRYPGGEWKQAEDTYTDANGDKAA 962
Query 963 SPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTAS 1036
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Sbjct 963 SPSEMTCPPGWEWEDDAWIYDINRAVDEKGWEYGITIPPDNKPKSWVAAEKMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTAS 1036
Query 1037 STARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKS 1110
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Sbjct 1037 STARAMEELEDREGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGEEKG 1110
Query 1111 LEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYHLRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNP 1184
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Sbjct 1111 PEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYHLRCYIYQARNLMALDKDSFSDPYAHVSFLHRSKTTEIIHSTLNP 1184
Query 1185 TWDQTIIFDEVEIYGEPQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGK----------------------------------- 1223
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Sbjct 1185 TWDQTIIFDEVEIFGEPQTVLQNPPNVTIELFDNDQVGKDEFLGRSICSPLVKLNSETDITPKLLWHPVMNGDK 1258
Query 1224 -------------------------------------------------------------------------- 1223
Sbjct 1259 ACGDVLVTAELILRNKDGSNLPILPSQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNYQMASVTSPSLVVE 1332
Query 1224 -------------------------------------------------------------------------- 1223
Sbjct 1333 CGGERVESVVIKSLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDHRQFGRKPVVGQCTIDHLDRFRCDPYA 1406
Query 1224 -------------------------------------------------------------------------- 1223
Sbjct 1407 GKEDIVPQLKASLMSAPPCREVVIEIEDTKPLLASKLSEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKI 1480
Query 1224 -------------------------------------------------------------------------- 1223
Sbjct 1481 YDCELEDVADFEGLTDFSDTFKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQFRELPDSVPQECT 1554
Query 1224 -------------------------------------------------------------------------- 1223
Sbjct 1555 VRIYIVQGLQLQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTF 1628
Query 1224 -------------------------------------------------------------------------- 1223
Sbjct 1629 TRDEKVGETTIDLENRFLSRFGSHCGIPEQYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPPPVLSEDGSRIRYGG 1702
Query 1224 -----DEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGP 1292
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Sbjct 1703 RDYHLDEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGP 1776
Query 1293 PFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVF 1366
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Sbjct 1777 PFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEDMSDIYVKGWISGSEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVF 1850
Query 1367 PFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMI 1440
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Sbjct 1851 PFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRVPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLHRTIIPAKTSEKCSLDMI 1924
Query 1441 PDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEPNMNPKLDL 1514
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Sbjct 1925 PDLKAMDPLKAKTASLFEQRSMKGWWPCYADKDGTRVMAGKVEMTLEVLNEREADERPAGKGRSEPNMNPKLDP 1998
Query 1515 PNRPETSFLWFTNPCKTMKFIVWRRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV 1577
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Sbjct 1999 PNRPETSFLWFTNPCKTMRFIVWRRFKWVIIGLLLLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVRPNA 2061