Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11838
- Subject:
- XM_011516035.3
- Aligned Length:
- 829
- Identities:
- 674
- Gaps:
- 128
Alignment
Query 1 ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA 74
Query 75 TCAGCCTTTGGACAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGCCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAGCCTTTGGACAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGCCA 148
Query 149 ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCT 222
Query 223 ATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACT----------------------------------------- 255
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACTAAGGTGTTAATTTTCTCAATATTGGGCACATCTTTCAAAGA 296
Query 256 -------------------------------------AAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACC 292
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAGAAGGAACCTTTCTCAGGAAGGAGGGAAGAGAAAAAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACC 370
Query 293 ACACTGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATC 366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACACTGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATC 444
Query 367 GTGACACTGGGAGGCCTTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCA 440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGACACTGGGAGGCCTTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCA 518
Query 441 CATCACTCCTTTTCCAATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGT 514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CATCACTCCTTTTCCAATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGT 592
Query 515 TGCATGTAGACACTGGAATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTAGTCAGGTTACA 588
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 593 TGCATGTAGACACTGGAATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTATGCAGGTTACA 666
Query 589 ACCACAGGCCTCAAGTGGAACCTCACAAATGATGTGCTTGCTTTTGGAACA-TTGGTCAGTACTTCCA---ATA 658
|||||||||||||||||||||||||.||.| ||||..|.|..|.|||.|| .|||..|| ||| |||
Sbjct 667 ACCACAGGCCTCAAGTGGAACCTCAGAACT--TGTGACTACACTAGGACCACCTGGATAG-----CCAAGGATA 733
Query 659 -------CCTACGACGGGTCTGGTGT--TGTGAC---------TGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACC 714
||.|.|||...||.|.| | |..||| |.||.|||.| |||||
Sbjct 734 ATCCCGTCCCAAGACTAATCAGAT-TAATCAGACTTAATCACATCTGTAAAGT----------TCCTC------ 790
Query 715 ATGGCCATCAAAAGC 729
|.|||||||||
Sbjct 791 -TTGCCATCAAA--- 801