Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11838
- Subject:
- XM_011516043.1
- Aligned Length:
- 807
- Identities:
- 580
- Gaps:
- 225
Alignment
Query 1 ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA 74
Query 75 TCAGCCTTTGGACAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGCCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAGCCTTTGGACAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGCCA 148
Query 149 ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCT 222
Query 223 ATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACT----------------------------------------- 255
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACTAAGGTGTTAATTTTCTCAATATTGGGCACATCTTTCAAAGA 296
Query 256 -------------------------------------AAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACC 292
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAGAAGGAACCTTTCTCAGGAAGGAGGGAAGAGAAAAAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACC 370
Query 293 ACACTGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATC 366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACACTGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAG------------ 432
Query 367 GTGACACTGGGAGGCCTTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCA 440
Sbjct 433 -------------------------------------------------------------------------- 432
Query 441 CATCACTCCTTTTCCAATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGT 514
|||||||||||||
Sbjct 433 -------------------------------------------------------------GGAAAGCACAGGT 445
Query 515 TGCATGTAGACACTGGAATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTAGTCAGGTTACA 588
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 446 TGCATGTAGACACTGGAATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTATGCAGGTTACA 519
Query 589 ACCACAGGCCTCAAGTGGAACCTCACAAATGATGTGCTTGCTTTTGGAACATTGGTCAGTACTTCCAATACCTA 662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 520 ACCACAGGCCTCAAGTGGAACCTCACAAATGATGTGCTTGCTTTTGGAACATTGGTCAGTACTTCCAATACCTA 593
Query 663 CGACGGGTCTGGTGTTGTGACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAAAGC 729
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 594 CGACGGGTCTGGTGTTGTGACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAAAGC 660