Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11841
• Subject: NM_014386.4
• Aligned Length: 1886
• Identities: 1512
• Gaps: 364

Alignment

Query    1  ATGGCTGAGGCGTCACGGTGGCACCGAGGCGGGGCTTCGAAACATAAGTTGCATTACAGAAAGGAAGTAGAAAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGAGGCGTCACGGTGGCACCGAGGCGGGGCTTCGAAACATAAGTTGCATTACAGAAAGGAAGTAGAAAT  74

Query   75  TACAACCACACTTCAGGAATTGTTACTCTACTTTATTTTTTTAATAAACCTATGTATATTGACTTTTGGGATGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TACAACCACACTTCAGGAATTGTTACTCTACTTTATTTTTTTAATAAACCTATGTATATTGACTTTTGGGATGG  148

Query  149  TAAACCCACATATGTATTACTTAAACAAGGTTATGTCATCTCTATTTTTGGACACTTCTGTGCCTGGTGAAGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAAACCCACATATGTATTACTTAAACAAGGTTATGTCATCTCTATTTTTGGACACTTCTGTGCCTGGTGAAGAA  222

Query  223  AGAACCAACTTTAAGTCCATTCGCAGCATAACTGATTTTTGGAAGTTTATGGAAGGACCCCTTTTGGAAGGTCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAACCAACTTTAAGTCCATTCGCAGCATAACTGATTTTTGGAAGTTTATGGAAGGACCCCTTTTGGAAGGTCT  296

Query  297  GTACTGGGATTCATGGTACAATAACCAGCAGCTGTATAATTTAAAGAACAGCAGTCGCATCTACTATGAAAATA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTACTGGGATTCATGGTACAATAACCAGCAGCTGTATAATTTAAAGAACAGCAGTCGCATCTACTATGAAAATA  370

Query  371  TACTTCTAGGAGTTCCCAGAGTTCGTCAACTAAAAGTCCGCAACAACACATGCAAAGTCTATTCATCTTTTCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TACTTCTAGGAGTTCCCAGAGTTCGTCAACTAAAAGTCCGCAACAACACATGCAAAGTCTATTCATCTTTTCAG  444

Query  445  TCTTTGATGAGTGAATGTTATGGCAAATATACTTCTGCAAATGAAGACCTCTCTAATTTTGGCCTTCAAATTAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTTTGATGAGTGAATGTTATGGCAAATATACTTCTGCAAATGAAGACCTCTCTAATTTTGGCCTTCAAATTAA  518

Query  519  TACTGAATGGAGATATTCTACTTCTAATACCAACTCCCCTTGGCACTGGGGATTTCTTGGTGTTTACCGAAATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TACTGAATGGAGATATTCTACTTCTAATACCAACTCCCCTTGGCACTGGGGATTTCTTGGTGTTTACCGAAATG  592

Query  593  GGGGATACATTTTCACTTTATCAAAATCGAAATCTGAAACCAAAAACAAGTTCATTGACCTTCGACTGAACAGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGGATACATTTTCACTTTATCAAAATCGAAATCTGAAACCAAAAACAAGTTCATTGACCTTCGACTGAACAGC  666

Query  667  TGGATCACAAGAGGGACTAGAGTTATTTTTATTGATTTTTCCTTATATAATGCTAATGTAAATCTATTTTGTAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGGATCACAAGAGGGACTAGAGTTATTTTTATTGATTTTTCCTTATATAATGCTAATGTAAATCTATTTTGTAT  740

Query  741  TATCAGATTGGTGGCAGAATTCCCTGCAACTGGAGGAATACTTACTTCATGGCAGTTTTACTCTGTGAAGCTCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TATCAGATTGGTGGCAGAATTCCCTGCAACTGGAGGAATACTTACTTCATGGCAGTTTTACTCTGTGAAGCTCC  814

Query  815  TCAGATATGTTAGCTACTATGACTATTTTATTGCTTCCTGTGAAATCACATTCTGTATTTTTCTTTTTGTCTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCAGATATGTTAGCTACTATGACTATTTTATTGCTTCCTGTGAAATCACATTCTGTATTTTTCTTTTTGTCTTC  888

Query  889  ACAACACAAGAAGTCAAAAAAATAAAAGAATTTAAGTCTGCCTATTTCAAAAGTATTTGGAACTGGCTAGAATT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAACACAAGAAGTCAAAAAAATAAAAGAATTTAAGTCTGCCTATTTCAAAAGTATTTGGAACTGGCTAGAATT  962

Query  963  GCTACTTTTGCTGTTGTGTTTTGTGGCTGTTTCCTTCAACACATACTATAATGTACAAATTTTTCTCTTACTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTACTTTTGCTGTTGTGTTTTGTGGCTGTTTCCTTCAACACATACTATAATGTACAAATTTTTCTCTTACTTG  1036

Query 1037  GACAGCTGTTGAAAAGTACTGAAAAATATTCAGATTTCTATTTTCTTGCATGCTGGCACATTTATTACAATAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GACAGCTGTTGAAAAGTACTGAAAAATATTCAGATTTCTATTTTCTTGCATGCTGGCACATTTATTACAATAAT  1110

Query 1111  ATAATTGCTATTACCATCTTTTTTGCATGGATAAA---------------------------------------  1145
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct 1111  ATAATTGCTATTACCATCTTTTTTGCATGGATAAAGATATTCAAATTCATAAGCTTTAACAAGACAATGTCTCA  1184

Query 1146  --------------------------------------------------------------------------  1145
                                                                                      
Sbjct 1185  GCTGTCATCAACCTTGTCCCGTTGTGTTAAAGACATAGTAGGATTTGCCATCATGTTTTTTATAATATTCTTTG  1258

Query 1146  --------------------------------------------------------------------------  1145
                                                                                      
Sbjct 1259  CTTATGCCCAGTTAGGATTTCTTGTTTTTGGATCACAAGTTGATGACTTTTCCACTTTTCAGAATTCCATATTT  1332

Query 1146  --------------------------------------------------------------------------  1145
                                                                                      
Sbjct 1333  GCACAATTTCGAATTGTTCTTGGAGATTTTAATTTTGCTGGTATTCAGCAAGCCAATCCTATCTTGGGACCCAT  1406

Query 1146  ------------------------------------------GAATATGTTCTTGGCAATTATTAATGATACCT  1177
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTACTTCATCACTTTCATCTTTTTTGTGTTCTTTGTCCTGCTGAATATGTTCTTGGCAATTATTAATGATACCT  1480

Query 1178  ATTCTGAAGTGAAAGCTGACTATTCAATAGGCAGAAGGCCAGATTTTGAACTTGGCAAAATGATTAAACAGAGT  1251
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATTCTGAAGTGAAAGCTGACTATTCAATAGGCAGAAGGCTAGATTTTGAACTTGGCAAAATGATTAAACAGAGT  1554

Query 1252  TACAAAAATGTTCTCGAGAAATTCAGACTGAAGAAAGCTCAAAAAGATGAAGACAAGAAAACCAAAGGCAGCGG  1325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TACAAAAATGTTCTCGAGAAATTCAGACTGAAGAAAGCTCAAAAAGATGAAGACAAGAAAACCAAAGGCAGCGG  1628

Query 1326  AGATTTGGCTGAACAAGCCAGAAGAGAAGGCTTTGACGAAAATGAGATTCAAAACGCAGAGCAGATGAAAAAAT  1399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGATTTGGCTGAACAAGCCAGAAGAGAAGGCTTTGACGAAAATGAGATTCAAAACGCAGAGCAGATGAAAAAAT  1702

Query 1400  GGAAAGAGAGGCTTGAGAAAAAGTATTATTCTATGGAAATTCAAGATGACTACCAGCCTGTCACTCAAGAAGAA  1473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGAAAGAGAGGCTTGAGAAAAAGTATTATTCTATGGAAATTCAAGATGACTACCAGCCTGTCACTCAAGAAGAA  1776

Query 1474  TTTCGAGAACTTTTTTTATATGCTGTGGAGCTGGAGAAGGAATTACACTACATCAATTTGAAG--CTAAATCA-  1544
            ||||||||                 |||                 |||.|||.|     .|||  |.||||.| 
Sbjct 1777  TTTCGAGA-----------------TGG-----------------CACCACAAC-----CAAGTACAAAATGAG  1811

Query 1545  --------AGTG-GTGAGAAA--GGTTTCAGCTCTA  1569
                    |||| .|||.|||  |..||        
Sbjct 1812  ATTCTCTGAGTGCCTGACAAAACGAATT--------  1839