Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11896
• Subject: NM_001301099.1
• Aligned Length: 1438
• Identities: 1378
• Gaps: 53

Alignment

Query    1  ATGGGTGTGAAAACATTTACTCATAGCTCCTCTTCCCACAGCCAGGAAATGCTTGGAAAGCTAAATATGCTGCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGTGTGAAAACATTTACTCATAGCTCCTCTTCCCACAGCCAGGAAATGCTTGGAAAGCTAAATATGCTGCG  74

Query   75  AAATGATGGACATTTTTGTGATATCACTATTCGTGTCCAGGACAAAATCTTCCGGGCACATAAGGTGGTACTAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAATGATGGACATTTTTGTGATATCACTATTCGTGTCCAGGACAAAATCTTCCGGGCACATAAGGTGGTACTAG  148

Query  149  CAGCTTGCAGTGATTTCTTTCGCACCAAACTTGTAGGCCAAGCCGAGGATGAGAACAAGAATGTGTTGGATCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCTTGCAGTGATTTCTTTCGCACCAAACTTGTAGGCCAAGCCGAGGATGAGAACAAGAATGTGTTGGATCTG  222

Query  223  CATCATGTTACAGTGACTGGCTTTATACCTCTTTTAGAATATGCTTACACAGCCACTCTATCAATTAACACAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATCATGTTACAGTGACTGGCTTTATACCTCTTTTAGAATATGCTTACACAGCCACTCTATCAATTAACACAGA  296

Query  297  AAATATTATTGATGTTCTAGCAGCAGCCAGCTATATGCAAATGTTCAGTGTTGCCAGCACCTGCTCAGAGTTCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAATATTATTGATGTTCTAGCAGCAGCCAGCTATATGCAAATGTTCAGTGTTGCCAGCACCTGCTCAGAGTTCA  370

Query  371  TGAAATCAAGCATTTTATGGAATACACCCAACAGCCAACCTGAAAAGGGTCTAGATGCTGGACAAGAAAATAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAAATCAAGCATTTTATGGAATACACCCAACAGCCAACCTGAAAAGGGTCTAGATGCTGGACAAGAAAATAAT  444

Query  445  TCTAACTGCAATTTTACTTCTCGAGATGGGAGCATTTCTCCCGTGTCCTCAGAGTGCAGTGTGGTAGAAAGAAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTAACTGCAATTTTACTTCTCGAGATGGGAGCATTTCTCCCGTGTCCTCAGAGTGCAGTGTGGTAGAAAGAAC  518

Query  519  CATTCCTGTCTGCCGAGAATCCCGGAGAAAGCGCGAAAGCTACATTGTTATGTCTCCTGAAAGTCCTGTAAAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATTCCTGTCTGCCGAGAATCCCGGAGAAAGCGCAAAAGCTACATTGTTATGTCTCCTGAAAGTCCTGTAAAGT  592

Query  593  GTGGCACACAAACAAGCTCACCCCAGGTATTGAATTCTTCAGCTTCCTACTCAGAAAATAGAAACCAACCAGTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGGCACACAAACAAGCTCACCCCAGGTATTGAATTCTTCAGCTTCCTACTCAGAAAATAGAAACCAACCAGTT  666

Query  667  GACTCTTCCTTAGCTTTTCCTTGGACTTTTCCTTTTGGAATTGATCGAAGGATTCAGCCTGAGAAAGTTAAGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACTCTTCCTTAGCTTTTCCTTGGACTTTTCCTTTTGGAATTGATCGAAGGATTCAGCCTGAGAAAGTTAAGCA  740

Query  741  AGCAGAAAATACCCGGACTTTAGAATTACCTGGCCCATCTGAGACCGGTAGAAGAATGGCTGATTATGTGACTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCAGAAAATACCCGGACTTTAGAATTACCTGGCCCATCTGAGACCGGTAGAAGAATGGCTGATTATGTGACTT  814

Query  815  GTGAGAGCACAAAAACTACCTTGCCTTTAGGTACCGAAGAAGATGTCCGGGTCAAAGTAGAAAGATTAAGTGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGAGAGCACAAAAACTACCTTGCCTTTAGGTACCGAAGAAGATGTCCGGGTCAAAGTAGAAAGATTAAGTGAT  888

Query  889  GAGGAGGTCCATGAGGAAGTGTCCCAGCCTGTCAGTGCATCTCAGAGTTCGCTGAGTGATCAGCAGACAGTTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGGAGGTCCATGAGGAAGTGTCCCAGCCTGTCAGTGCATCTCAGAGTTCGCTGAGTGATCAGCAGACAGTTCC  962

Query  963  AGGAAGTGAACAAGTCCAAGAGGACCTTCTGATTAGTCCACAGTCTTCCTCTATAGGCTCAGTAGATGAAGGCG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGAAGTGAACAAGTCCAAGAGGACCTTCTGATTAGTCCACAGTCTTCCTCTATAGGCTCAGTAGATGAAGGCG  1036

Query 1037  TTTCTGAGGGCTTGCCTACACTTCAAAGCACGTCTAGCACTAATGCTCCTCCGGATGATGATGATCGATTGGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTTCTGAGGGCTTGCCTACACTTCAAAGCACGTCTAGCACTAATGCTCCTCCGGATGATGATGATCGATTGGAA  1110

Query 1111  AATGTTCAGTATCCCTACCAACTCTACATTGCTCCTTCCACCAGCAGTACAGAGCGACCAAGTCCAAATGGTCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AATGTTCAGTATCCCTACCAACTCTACATTGCTCCTTCCACCAGCAGTACAGAGCGACCAAGTCCAAATGGTCC  1184

Query 1185  CGACAGACCTTTTCAGTGTCCAACCTGCGGGGTGCGATTCACCCGTATTCAGAACCTAAAGCAGCACATGCTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGACAGACCTTTTCAGTGTCCAACCTGCGGGGTGCGATTCACCCGTATTCAGAACCTAAAGCAGCACATGCTCA  1258

Query 1259  TCCACTCAGGAATTAAACCATTTCAGTGTGACCGCTGTGGGAAAAAGTTCACCAGGGCTTACTCGCTAAAGATG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCACTCAGGAATTAAACCATTTCAGTGTGACCGCTGTGGGAAAAAGTTCACCAGGGCTTACTCGCTAAAGATG  1332

Query 1333  CATCGCCTAAAGCATGAAG------------GGCATCCCAGGAA-----------ATCAGCTTCTAGATCTAGC  1383
            |||||||||||||||||||            ||||    |||||           |.|||        ||.|||
Sbjct 1333  CATCGCCTAAAGCATGAAGTACCACTCCAAAGGCA----AGGAACCATGATTGACAACAG--------TCAAGC  1394

Query 1384  TCTG----------CCACTAACTGCTGT----  1401
            |.||          |||..|||    |.    
Sbjct 1395  TGTGGATGAAATGACCAGGAAC----GGAGAA  1422