Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11896
• Subject: NM_172765.3
• Aligned Length: 1401
• Identities: 1197
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGGGTGTGAAAACATTTACTCATAGCTCCTCTTCCCACAGCCAGGAAATGCTTGGAAAGCTAAATATGCTGCG  74
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct    1  ATGGGTGTGAAAACATTTACTCACAGCTCCTCTTCCCACAGCCAGGAAATGCTGGGGAAACTAAATATGCTCCG  74

Query   75  AAATGATGGACATTTTTGTGATATCACTATTCGTGTCCAGGACAAAATCTTCCGGGCACATAAGGTGGTACTAG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct   75  AAATGATGGACATTTTTGTGATATCACTATTCGTGTCCAGGACAAAATCTTCCGGGCTCACAAGGTAGTACTAG  148

Query  149  CAGCTTGCAGTGATTTCTTTCGCACCAAACTTGTAGGCCAAGCCGAGGATGAGAACAAGAATGTGTTGGATCTG  222
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCTTGCAGTGATTTCTTTCGAACCAAACTTGTTGGCCAAACAGAAGATGAGAACAAAAATGTGTTGGATCTG  222

Query  223  CATCATGTTACAGTGACTGGCTTTATACCTCTTTTAGAATATGCTTACACAGCCACTCTATCAATTAACACAGA  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  223  CATCATGTTACAGTGACTGGCTTTATACCTCTTTTAGAATACGCTTACACAGCCACTCTGTCAATTAACACGGA  296

Query  297  AAATATTATTGATGTTCTAGCAGCAGCCAGCTATATGCAAATGTTCAGTGTTGCCAGCACCTGCTCAGAGTTCA  370
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct  297  AAATATTATTGATGTTCTAGCGGCAGCCAGCTATATGCAAATGTTTAGTGTTGCTAGTACATGCTCAGAGTTCA  370

Query  371  TGAAATCAAGCATTTTATGGAATACACCCAACAGCCAACCTGAAAAGGGTCTAGATGCTGGACAAGAAAATAAT  444
            ||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  371  TGAAGTCAAGTATTTTGTGGAATACACCTAATAGCCAACCAGAAAAGAGTCTAGATGCTGGACAAGAAAATAGC  444

Query  445  TCTAACTGCAATTTTACTTCTCGAGATGGGAGCATTTCTCCCGTGTCCTCAGAGTGCAGTGTGGTAGAAAGAAC  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||..||.||.||.||
Sbjct  445  TCCAACTGCAATTTTACTTCTCGAGATGGAAGCATTTCTCCAGTGTCTTCAGAGTGCAGTGCTGTGGAGAGGAC  518

Query  519  CATTCCTGTCTGCCGAGAATCCCGGAGAAAGCGCGAAAGCTACATTGTTATGTCTCCTGAAAGTCCTGTAAAGT  592
            ||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|
Sbjct  519  CATTCCTGTCTGCCGAGAGTCCCGGAGGAAGCGCAAAAGCTACATTGTTATGTCTCCCGAGAGTCCCGTGAAAT  592

Query  593  GTGGCACACAAACAAGCTCACCCCAGGTATTGAATTCTTCAGCTTCCTACTCAGAAAATAGAAACCAACCAGTT  666
            ||.||||.||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||..||||||||||||..||.||||||
Sbjct  593  GTAGCACCCAAACAAGTTCCCCCCAGGTACTGAATTCTTCAGCTTCCTATGCAGAAAATAGAAGTCAGCCAGTT  666

Query  667  GACTCTTCCTTAGCTTTTCCTTGGACTTTTCCTTTTGGAATTGATCGAAGGATTCAGCCTGAGAAAGTTAAGCA  740
            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct  667  GACTCTTCTTTAGCTTTTCCTTGGACTTTCCCTTTTGGAATAGATCGAAGGATTCAGCCTGAGAAAGCAAAGCA  740

Query  741  AGCAGAAAATACCCGGACTTTAGAATTACCTGGCCCATCTGAGACCGGTAGAAGAATGGCTGATTATGTGACTT  814
            .||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||||||.|||||||.||||||||||
Sbjct  741  GGCAGAAAATACCCGGACTTTAGAATTGCCTGGCCCATCCGAGGCAGGTAGAAGAGTGGCTGACTATGTGACTT  814

Query  815  GTGAGAGCACAAAAACTACCTTGCCTTTAGGTACCGAAGAAGATGTCCGGGTCAAAGTAGAAAGATTAAGTGAT  888
            ||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGAGAGCACAAAACCCACCTTGCCTCTAGGTACAGAAGAAGATGTCCGGGTCAAAGTAGAAAGATTAAGTGAT  888

Query  889  GAGGAGGTCCATGAGGAAGTGTCCCAGCCTGTCAGTGCATCTCAGAGTTCGCTGAGTGATCAGCAGACAGTTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  GAGGAGGTCCATGAGGAAGTGTCCCAGCCTGTTAGTGCATCTCAGAGCTCACTGAGTGATCAGCAGACAGTGCC  962

Query  963  AGGAAGTGAACAAGTCCAAGAGGACCTTCTGATTAGTCCACAGTCTTCCTCTATAGGCTCAGTAGATGAAGGCG  1036
            .||||||||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  963  CGGAAGTGAACCAGTTCAAGAGGACCTTCTGATCAGTCCACAGTCTTCCTCTATAGGCTCAGTAGATGAAGGAG  1036

Query 1037  TTTCTGAGGGCTTGCCTACACTTCAAAGCACGTCTAGCACTAATGCTCCTCCGGATGATGATGATCGATTGGAA  1110
            |..||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||.|.|.|||||.|||||          
Sbjct 1037  TCACTGAAGGATTGCCTACACTTCAGAGCACCTCTAGCACCAATGCTCATGCAGATGACGATGA----------  1100

Query 1111  AATGTTCAGTATCCCTACCAACTCTACATTGCTCCTTCCACCAGCAGTACAGAGCGACCAAGTCCAAATGGTCC  1184
                                                        ||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1101  --------------------------------------------CAGTACAGAGCGGCCAAGTCCAAATGGTCC  1130

Query 1185  CGACAGACCTTTTCAGTGTCCAACCTGCGGGGTGCGATTCACCCGTATTCAGAACCTAAAGCAGCACATGCTCA  1258
            .||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 1131  AGACAGACCGTTTCAGTGTCCAACCTGTGGGGTCCGCTTCACCCGTATTCAGAATCTAAAACAGCACATGCTTA  1204

Query 1259  TCCACTCAGGAATTAAACCATTTCAGTGTGACCGCTGTGGGAAAAAGTTCACCAGGGCTTACTCGCTAAAGATG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1205  TCCACTCAGGAATTAAACCATTTCAGTGTGACTGCTGTGGAAAAAAGTTTACCAGGGCTTACTCGCTAAAGATG  1278

Query 1333  CATCGCCTAAAGCATGAAGGGCATCCCAGGAAATCAGCTTCTAGATCTAGCTCTGCCACTAACTGCTGT  1401
            ||||||||||||||.||||.| ||              ||||                           
Sbjct 1279  CATCGCCTAAAGCACGAAGTG-AT--------------TTCT---------------------------  1305