Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11906
- Subject:
- XM_006520882.3
- Aligned Length:
- 2014
- Identities:
- 1667
- Gaps:
- 98
Alignment
Query 1 ATGGATGATATTGCTGATAGGATGAGGATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAGTGAACCACAACTCCGTATTCAA 74
||||||||.|..||||||.||.|||.||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||..||||...||||.
Sbjct 1 ATGGATGACACAGCTGATGGGGTGAAGATGGACGCTGGGGAGGTGACCTTAGTGAACCACGGCTCCACTTTCAG 74
Query 75 AACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCTGACCAGCAGATTTTATCTTCCA 148
||||||||.||.||||||..||||.|||||||||||.||||||..|||||||||||||||||..||..|||.||
Sbjct 75 AACCCACCGCCCGCCACAGTCAGGCTTTCCAGAGGAGCAGCTTCTGCTTTCTGACCAGCAGAGCTTGCCTTTCA 148
Query 149 GGCAAGG-ACATTTGGACCGATCTTTTACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTTATAATCCAAGCTATTACTCAGA 221
||||.|| || |||.||..|||||||.||.|||||.||||||||..||||.|||..||||...|||.|||||||
Sbjct 149 GGCAGGGTAC-TTTAGATGGATCTTTCACGTGTTCTACAAGAAGCCCAGCCTATCGTCCAGATTATCACTCAGA 221
Query 222 TAATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGCCAGAGTGCAAATGGCCAATGGA 295
|||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||..|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 222 TAACCCTTCCTCAGACAGTTTCCTTGGCTCAGGTGACGTAAGAACCTTTGGTCAAAGTGCAAATGGACAATGGA 295
Query 296 GAAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCGAAGTCTTTACCTCGAAACCCGA 369
|||||||.||.|||.|||||.|||||.|...|||||||.|||||||.|||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct 296 GAAATTCCACTCCAGCGTCAGGCTCAGCGCCACAAAAACCAAGAAATAGCCGAAGTCTTTGCCTCGAAACCCGG 369
Query 370 AAGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACTGCCATGTATCTGCATATGAAAA 443
|||||||||||||||||||||||||..||||.|||.|||||.||.||.||||||||..|.|||||.||||||||
Sbjct 370 AAGACCTCAAGTGGATTATCAAACACCTTTGTGGGCAAGTCCAATCACCACTGCCACATGTCTGCGTATGAAAA 443
Query 444 ATCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGTCGAAGTCTCTTGAGCCCCAAGA 517
.||.|||||.|||||.||||..|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct 444 GTCATTTCCCATTAAGCCTGCCCCAAGTCCATCCTGGAGTGGGTCATGTCGTCGGAGTCTTTTAAGCCCTAAGA 517
Query 518 AAACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGA-AAGAGAGGTTTACAGACAGCT 590
|||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||.|.|||||||||||
Sbjct 518 AAACTCAGAGGCGACATTTCAGCACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGAGAAG-GAGATCTACAGACAGCT 590
Query 591 GCTACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAGCCAAACCCACCACACATTTTCCTTTACACCTGTCTCGAT 664
|||.|||||||||||||||||.|||||...|.||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||||||.|
Sbjct 591 GCTGCAGATGGTCACAGGGAAGCAGTTCTGTGTAGCGAAACCCACCACACATTTTCCGTTACGCCTGTCTCGGT 664
Query 665 GTCTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCACTGTTTAAAAATGGAAACTCTTGTGCATCTCAGATCATT 738
||||||||||||.|||.||..|||||||||||||.|||||.|.|||.||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct 665 GTCTTAGTTCCAATAAGAACTCTTTGAAAGACTCGCTGTTGAGAAACGGAAACTCTTGTGCATCTCATGTCATT 738
Query 739 GGCTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTAACCAGGAACAGCTGTCCCACAGTGTATATTC 812
||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||...|||||.|||.||||||||||||.|.||||
Sbjct 739 GGTTCTGATACGTCATCCTCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTGCACAGGAGCAGTTGTCCCACAGTGCACATTC 812
Query 813 CCTATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGATCCAAAGATTCTGGTACTCTTCATCATCCCCATCATCACC 886
|||.||.|||..|||||||||||||||.||||||||||||||.|||| ||||.||.|||||||
Sbjct 813 CCTGTCATCTGGTACCCCAGATGTTGCCTTTGGATCCAAAGACTCTG------------ATCCTCACCATCACC 874
Query 887 ACTCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCTTCAAATACACAATCTGAAGGATCAGACTCTGTGATTTTA 960
.|.|||..||.|||||||||.|||.||||.||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 875 TCGCTGCACCTCATCAGCCAAATAGCTTACCAGCATCAAATACACAGTCCGAAGGGTCAGACTCTGTGATTTTA 948
Query 961 CTGAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAGTT------------------------------------- 997
||.|||||||||||.||.|||||||||.||.||||.|
Sbjct 949 CTTAAAGTGAAAGAATCTCAGACTCCAGCTTCCAGATACCTCAGTCCATTGAAGAGACGTTCTTGCCCCTACAT 1022
Query 998 -----------------------------------------CTACTTTCTTCCAGGCAGAGCTGTGGATCAAAG 1030
||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1023 TATTCCTTATTCAGCAGTCATGGATCTGCTCTCTAGCAGCCCTACGTTCTTCCAGGCAGAGCTATGGATCAAAG 1096
Query 1031 AATTAACTAGTGTTTATGGTTCTCGAGCACGAGAAAGATTGCGCCAGATTGAAGAACAGAAGGCATTGGCCTTA 1104
||||||||||.|||||||..||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||.|||||.||||||||..||
Sbjct 1097 AATTAACTAGCGTTTATGACTCTCGAGCTCGGGAAAGATTGCGCCGGATTGAAGAGCAGAAAGCATTGGCACTA 1170
Query 1105 CAGCTTCAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCAGTACATGATTCAGTAGAACTACATCTTCGTGTACC 1178
|||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||||||.|||.||.|||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1171 CAGCTTCAAAACCAGCGACTGCAGGAGCAGGAACATGCAGTACTTGACTCCGTAGAGCTTCACCTTCGTGTGCC 1244
Query 1179 TCTTGAAAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAACACA--AAAAAAAGGTCATAAATTAACTGATAGTGA 1250
|||||||||||||||||||||.||.|.||.||||||||| || ||||||| |.||..|..|.|||||.|||||
Sbjct 1245 TCTTGAAAAGGAGATTCCTGTCACAGCTGCCCAAGAAAC-CAGGAAAAAAA-GCCACCAGCTGACTGACAGTGA 1316
Query 1251 AGATGAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAATGGGAATCAGGATG 1324
|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1317 AGACGAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAAAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAACGGTAACCAGGATG 1390
Query 1325 AAGTTCTCAGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAAGATATTCAAACTCTAAACCATCTGAATTGGCTC 1398
||||.||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1391 AAGTCCTCAGTGAGGCATTCCGCTTGACCATTACACGCAAAGACATTCAGACTCTAAACCATCTAAACTGGCTC 1464
Query 1399 AATGATGAGATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGAGCGAAGTAAAGAGAAGGGCTTGCCAAGTGTGCA 1472
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1465 AATGATGAGATCATCAATTTCTACATGAACATGCTAATGGAACGCAGTAAAGAGAAGGGGTTTCCAAGTGTACA 1538
Query 1473 TGCATTTAATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACGTTGGACAAAGAAAG 1546
|||.|||||||||||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1539 TGCGTTTAATACCTTCTTCTTCACTAAGCTAAAAACAGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACGCTGGACAAAGAAGG 1612
Query 1547 TAGATGTATTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCACCTGGGAGTACACTGGTGTCTAGCTGTTGTGGAC 1620
|.||||||||.||.|||||.||||||.||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1613 TGGATGTATTCTCCGTTGATATTCTTCTGGTGCCCATTCACTTGGGTGTGCACTGGTGTCTAGCTGTTGTAGAC 1686
Query 1621 TTTAGAAAGAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGGGATAAACAATGAAGCCTGCAGAATACTCTTGCA 1694
|||||||.|||||.|||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 1687 TTTAGAAGGAAGAGTATCACCTACTATGATTCTATGGGTGGAATAAACAACGAGGCCTGCAGGATCCTCTTGCA 1760
Query 1695 ATACCTAAAGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAATGGCTGGCAGCTTTTCAGCAAGA 1768
|||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1761 ATACCTAAAACAAGAAAGTGTTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAACGGCTGGCAGCTCTTCAGCAAGA 1834
Query 1769 AAAGCCAGGAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGTGGGATGTTTGCCTGCAAATATGCTGACTGTATT 1842
|.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1835 AGAGCCAGGAAATCCCACAGCAGATGAATGGGAGTGACTGTGGAATGTTTGCTTGCAAATATGCTGACTGCATT 1908
Query 1843 ACCAAAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATACTTCCGGAAGCGGATGGTCTGGGAGATCCT 1916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1909 ACCAAAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATATTTCCGAAAGCGAATGGTCTGGGAGATCCT 1982
Query 1917 CCACCGAAAACTCTTG 1932
||||||.||.||||||
Sbjct 1983 CCACCGGAAGCTCTTG 1998