Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11906
• Subject: XM_017019230.2
• Aligned Length: 2121
• Identities: 1888
• Gaps: 228

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAAAATCCCCTTAACTGCCACAATTTGCTTACCTGGCTCATCGCCTCCTGGACTTTGTATCTTTGCTAAAGT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CAGTGATGTGAAAAGACTTGAAATGGAGACAAGATTTTGCCTTATTTCCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGGCT  148

Query    1  -----------------------------------------ATGGATGATATTGCTGATAGGATGAGGATGGAT  33
                                                     |..||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAGCCATTCGTCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGTATTACAGATGATATTGCTGATAGGATGAGGATGGAT  222

Query   34  GCTGGAGAAGTGACTTTAGTGAACCACAACTCCGTATTCAAAACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGA  107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTGGAGAAGTGACTTTAGTGAACCACAACTCCGTATTCAAAACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGA  296

Query  108  GGACCAGCTTTCGCTTTCTGACCAGCAGATTTTATCTTCCAGGCAAGGACATTTGGACCGATCTTTTACATGTT  181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGACCAGCTTTCGCTTTCTGACCAGCAGATTTTATCTTCCAGGCAAGGACATTTGGACCGATCTTTTACATGTT  370

Query  182  CCACAAGAAGTGCAGCTTATAATCCAAGCTATTACTCAGATAATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGC  255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCACAAGAAGTGCAGCTTATAATCCAAGCTATTACTCAGATAATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGC  444

Query  256  GATTTAAGAACCTTTGGCCAGAGTGCAAATGGCCAATGGAGAAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACA  329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATTTAAGAACCTTTGGCCAGAGTGCAAATGGCCAATGGAGAAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACA  518

Query  330  AAAATCAAGAAACAGCCGAAGTCTTTACCTCGAAACCCGAAAGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGG  403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAATCAAGAAACAGCCGAAGTCTTTACCTCGAAACCCGAAAGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGG  592

Query  404  GAAAGTCAAACCATCACTGCCATGTATCTGCATATGAAAAATCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCT  477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAAGTCAAACCATCACTGCCATGTATCTGCATATGAAAAATCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCT  666

Query  478  TGGAGTGGTTCATGTCGTCGAAGTCTCTTGAGCCCCAAGAAAACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGA  551
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGGAGTGGTTCATGTCGTCGAAGTCTTTTGAGCCCCAAGAAAACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGA  740

Query  552  GACAGTTCAAGAAGAAGAAAGAGAGGTTTACAGACAGCTGCTACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAG  625
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GACAGTTCAAGAAGAAGAAAGAGAGATTTACAGACAGCTGCTACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAG  814

Query  626  CCAAACCCACCACACATTTTCCTTTACACCTGTCTCGATGTCTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCA  699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAAACCCACCACACATTTTCCTTTACACCTGTCTCGATGTCTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCA  888

Query  700  CTGTTTAAAAATGGAAACTCTTGTGCATCTCAGATCATTGGCTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCAT  773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGTTTAAAAATGGAAACTCTTGTGCATCTCAGATCATTGGCTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCAT  962

Query  774  TTTAACTAACCAGGAACAGCTGTCCCACAGTGTATATTCCCTATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGAT  847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTTAACTAACCAGGAACAGCTGTCCCACAGTGTATATTCCCTATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGAT  1036

Query  848  CCAAAGATTCTGGTACTCTTCATCATCCCCATCATCACCACTCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCT  921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCAAAGATTCTGGTACTCTTCATCATCCCCATCATCACCACTCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCT  1110

Query  922  TCAAATACACAATCTGAAGGATCAGACTCTGTGATTTTACTGAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAG  995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCAAATACACAATCTGAAGGATCAGACTCTGTGATTTTACTGAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAG  1184

Query  996  TTCTACTTTCTTCCAGGCAGAGCTGTGGATCAAAGAATTAACTAGTGTTTATGGTTCTCGAGCACGAGAAAGAT  1069
                                                   ||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ---------------------------------------AACTAGTGTTTATGATTCTCGAGCACGAGAAAGAT  1219

Query 1070  TGCGCCAGATTGAAGAACAGAAGGCATTGGCCTTACAGCTTCAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCA  1143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1220  TGCGCCAGATTGAAGAACAGAAGGCATTGGCCTTACAGCTTCAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCA  1293

Query 1144  GTACATGATTCAGTAGAACTACATCTTCGTGTACCTCTTGAAAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAAC  1217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1294  GTACATGATTCAGTAGAACTACATCTTCGTGTACCTCTTGAAAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAAC  1367

Query 1218  ACAAAAAAAAGGTCATAAATTAACTGATAGTGAAGATGAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAA  1291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1368  ACAAAAAAAAGGTCATAAATTAACTGATAGTGAAGATGAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAA  1441

Query 1292  TAAAGAATGTATTTCGTAATGGGAATCAGGATGAAGTTCTCAGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAA  1365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1442  TAAAGAATGTATTTCGTAATGGGAATCAGGATGAAGTTCTCAGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAA  1515

Query 1366  GATATTCAAACTCTAAACCATCTGAATTGGCTCAATGATGAGATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGA  1439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1516  GATATTCAAACTCTAAACCATCTGAATTGGCTCAATGATGAGATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGA  1589

Query 1440  GCGAAGTAAAGAGAAGGGCTTGCCAAGTGTGCATGCATTTAATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTG  1513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1590  GCGAAGTAAAGAGAAGGGCTTGCCAAGTGTGCATGCATTTAATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTG  1663

Query 1514  GTTATCAGGCAGTGAAACGTTGGACAAAGAAAGTAGATGTATTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCAC  1587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1664  GTTATCAGGCAGTGAAACGTTGGACAAAGAAAGTAGATGTATTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCAC  1737

Query 1588  CTGGGAGTACACTGGTGTCTAGCTGTTGTGGACTTTAGAAAGAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGG  1661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738  CTGGGAGTACACTGGTGTCTAGCTGTTGTGGACTTTAGAAAGAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGG  1811

Query 1662  GATAAACAATGAAGCCTGCAGAATACTCTTGCAATACCTAAAGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGT  1735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1812  GATAAACAATGAAGCCTGCAGAATACTCTTGCAATACCTAAAGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGT  1885

Query 1736  TTGACACCAATGGCTGGCAGCTTTTCAGCAAGAAAAGCCAGGAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGT  1809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1886  TTGACACCAATGGCTGGCAGCTTTTCAGCAAGAAAAGCCAGGAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGT  1959

Query 1810  GGGATGTTTGCCTGCAAATATGCTGACTGTATTACCAAAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCC  1883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1960  GGGATGTTTGCCTGCAAATATGCTGACTGTATTACCAAAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCC  2033

Query 1884  ATACTTCCGGAAGCGGATGGTCTGGGAGATCCTCCACCGAAAACTCTTG  1932
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2034  ATACTTCCGGAAGCGGATGGTCTGGGAGATCCTCCACCGAAAACTCTTG  2082