Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11906
- Subject:
- XM_017019234.2
- Aligned Length:
- 1932
- Identities:
- 1908
- Gaps:
- 21
Alignment
Query 1 ATGGATGATATTGCTGATAGGATGAGGATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAGTGAACCACAACTCCGTATTCAA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------ATGAGGATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAGTGAACCACAACTCCGTATTCAA 53
Query 75 AACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCTGACCAGCAGATTTTATCTTCCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 54 AACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCTGACCAGCAGATTTTATCTTCCA 127
Query 149 GGCAAGGACATTTGGACCGATCTTTTACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTTATAATCCAAGCTATTACTCAGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 128 GGCAAGGACATTTGGACCGATCTTTTACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTTATAATCCAAGCTATTACTCAGAT 201
Query 223 AATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGCCAGAGTGCAAATGGCCAATGGAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 202 AATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGCCAGAGTGCAAATGGCCAATGGAG 275
Query 297 AAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCGAAGTCTTTACCTCGAAACCCGAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 276 AAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCGAAGTCTTTACCTCGAAACCCGAA 349
Query 371 AGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACTGCCATGTATCTGCATATGAAAAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 AGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACTGCCATGTATCTGCATATGAAAAA 423
Query 445 TCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGTCGAAGTCTCTTGAGCCCCAAGAA 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 424 TCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGTCGAAGTCTTTTGAGCCCCAAGAA 497
Query 519 AACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGAAAGAGAGGTTTACAGACAGCTGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 498 AACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGAAAGAGAGATTTACAGACAGCTGC 571
Query 593 TACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAGCCAAACCCACCACACATTTTCCTTTACACCTGTCTCGATGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 572 TACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAGCCAAACCCACCACACATTTTCCTTTACACCTGTCTCGATGT 645
Query 667 CTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCACTGTTTAAAAATGGAAACTCTTGTGCATCTCAGATCATTGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 646 CTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCACTGTTTAAAAATGGAAACTCTTGTGCATCTCAGATCATTGG 719
Query 741 CTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTAACCAGGAACAGCTGTCCCACAGTGTATATTCCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 CTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTAACCAGGAACAGCTGTCCCACAGTGTATATTCCC 793
Query 815 TATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGATCCAAAGATTCTGGTACTCTTCATCATCCCCATCATCACCAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 794 TATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGATCCAAAGATTCTGGTACTCTTCATCATCCCCATCATCACCAC 867
Query 889 TCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCTTCAAATACACAATCTGAAGGATCAGACTCTGTGATTTTACT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 868 TCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCTTCAAATACACAATCTGAAGGATCAGACTCTGTGATTTTACT 941
Query 963 GAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAGTTCTACTTTCTTCCAGGCAGAGCTGTGGATCAAAGAATTAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 942 GAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAGTTCTACTTTCTTCCAGGCAGAGCTGTGGATCAAAGAATTAA 1015
Query 1037 CTAGTGTTTATGGTTCTCGAGCACGAGAAAGATTGCGCCAGATTGAAGAACAGAAGGCATTGGCCTTACAGCTT 1110
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016 CTAGTGTTTATGATTCTCGAGCACGAGAAAGATTGCGCCAGATTGAAGAACAGAAGGCATTGGCCTTACAGCTT 1089
Query 1111 CAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCAGTACATGATTCAGTAGAACTACATCTTCGTGTACCTCTTGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090 CAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCAGTACATGATTCAGTAGAACTACATCTTCGTGTACCTCTTGA 1163
Query 1185 AAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAACACAAAAAAAAGGTCATAAATTAACTGATAGTGAAGATGAAT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164 AAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAACACAAAAAAAAGGTCATAAATTAACTGATAGTGAAGATGAAT 1237
Query 1259 TTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAATGGGAATCAGGATGAAGTTCTC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238 TTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAATGGGAATCAGGATGAAGTTCTC 1311
Query 1333 AGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAAGATATTCAAACTCTAAACCATCTGAATTGGCTCAATGATGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312 AGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAAGATATTCAAACTCTAAACCATCTGAATTGGCTCAATGATGA 1385
Query 1407 GATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGAGCGAAGTAAAGAGAAGGGCTTGCCAAGTGTGCATGCATTTA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386 GATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGAGCGAAGTAAAGAGAAGGGCTTGCCAAGTGTGCATGCATTTA 1459
Query 1481 ATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACGTTGGACAAAGAAAGTAGATGTA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1460 ATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACGTTGGACAAAGAAAGTAGATGTA 1533
Query 1555 TTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCACCTGGGAGTACACTGGTGTCTAGCTGTTGTGGACTTTAGAAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1534 TTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCACCTGGGAGTACACTGGTGTCTAGCTGTTGTGGACTTTAGAAA 1607
Query 1629 GAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGGGATAAACAATGAAGCCTGCAGAATACTCTTGCAATACCTAA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608 GAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGGGATAAACAATGAAGCCTGCAGAATACTCTTGCAATACCTAA 1681
Query 1703 AGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAATGGCTGGCAGCTTTTCAGCAAGAAAAGCCAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1682 AGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAATGGCTGGCAGCTTTTCAGCAAGAAAAGCCAG 1755
Query 1777 GAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGTGGGATGTTTGCCTGCAAATATGCTGACTGTATTACCAAAGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1756 GAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGTGGGATGTTTGCCTGCAAATATGCTGACTGTATTACCAAAGA 1829
Query 1851 CAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATACTTCCGGAAGCGGATGGTCTGGGAGATCCTCCACCGAA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1830 CAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATACTTCCGGAAGCGGATGGTCTGGGAGATCCTCCACCGAA 1903
Query 1925 AACTCTTG 1932
||||||||
Sbjct 1904 AACTCTTG 1911