Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11945
• Subject: XM_017008278.1
• Aligned Length: 1323
• Identities: 1080
• Gaps: 243

Alignment

Query    1  ATGGACAGCAACAATTTCTTAGGCAATTGTGGTGTGGGAGAAAGGGAAGGGAGAGTGGCATCCGCACTGGTTGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCGTCGTCATTACAGGTTCATTCATGGCATTGGACGATCCGGTGATATTTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCTCTAGCCTTTTGAACAAAATTACCAATTCTTTGGTCCTGGACATTATAAAGCTGGCTGGTGTCCATACAGTA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCCAACTGCTTTGTAGTTCCTATGGCAACTGGTATGAGTCTAACTCTGTGTTTCTTAACATTACGACACAAAAG  296
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------ATGGCAACTGGTATGAGTCTAACTCTGTGTTTCTTAACATTACGACACAAAAG  53

Query  297  ACCAAAGGCAAAGTATATTATATGGCCACGAATAGACCAGAAGTCCTGCTTTAAATCCATGATCACTGCAGGTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   54  ACCAAAGGCAAAGTATATTATATGGCCACGAATAGACCAGAAGTCCTGCTTTAAATCCATGATCACTGCAGGTT  127

Query  371  TTGAGCCTGTGGTGATAGAAAATGTTTTGGAAGGTGACGAGCTGCGTACAGACCTGAAAGCAGTGGAGGCTAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  128  TTGAGCCTGTGGTGATAGAAAATGTTTTGGAAGGTGACGAGCTGCGTACAGACCTGAAAGCAGTGGAGGCTAAA  201

Query  445  GTCCAGGAACTTGGGCCTGATTGCATTCTGTGTATTCATTCTACTACATCCTGTTTTGCTCCAAGGGTGCCTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  202  GTCCAGGAACTTGGGCCTGATTGCATTCTGTGTATTCATTCTACTACATCCTGTTTTGCTCCAAGGGTGCCTGA  275

Query  519  TAGATTAGAAGAACTGGCTGTGATTTGTGCTAATTATGACATTCCACATATAGTTAATAATGCTTATGGAGTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  276  TAGATTAGAAGAACTGGCTGTGATTTGTGCTAATTATGACATTCCACATATAGTTAATAATGCTTATGGAGTGC  349

Query  593  AGTCTTCAAAGTGTATGCATCTCATTCAGCAGGGGGCTCGAGTTGGTAGAATAGATGCTTTTGTTCAGAGCTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  350  AGTCTTCAAAGTGTATGCATCTCATTCAGCAGGGGGCTCGAGTTGGTAGAATAGATGCTTTTGTTCAGAGCTTG  423

Query  667  GACAAAAATTTTATGGTTCCAGTAGGTGGTGCTATAATTGCTGGCTTTAATGATTCATTCATTCAGGAAATCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  424  GACAAAAATTTTATGGTTCCAGTAGGTGGTGCTATAATTGCTGGCTTTAATGATTCATTCATTCAGGAAATCAG  497

Query  741  CAAGATGTATCCAGGAAGAGCTTCAGCTTCACCTTCTTTAGATGTCCTTATTACTTTATTGTCACTTGGATCAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  CAAGATGTATCCAGGAAGAGCTTCAGCTTCACCTTCTTTAGATGTCCTTATTACTTTATTGTCACTTGGATCAA  571

Query  815  ATGGCTATAAGAAGCTACTAAAAGAAAGAAAGGAAATGTTTTCATATTTGTCCAACCAAATAAAGAAGTTGTCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  572  ATGGCTATAAGAAGCTACTAAAAGAAAGAAAGGAAATGTTTTCATATTTGTCCAACCAAATAAAGAAGTTGTCA  645

Query  889  GAAGCCTACAATGAAAGACTGTTGCATACACCTCACAATCCCATATCTTTAGCTATGACACTTAAAACACTAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  646  GAAGCCTACAATGAAAGACTGTTGCATACACCTCACAATCCCATATCTTTAGCTATGACACTTAAAACACTAGA  719

Query  963  TGAACACCGTGACAAAGCTGTCACTCAGCTTGGCTCGATGCTTTTTACCAGACAGGTTTCTGGAGCCAGGGTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  TGAACACCGTGACAAAGCTGTCACTCAGCTTGGCTCGATGCTTTTTACCAGACAGGTTTCTGGAGCCAGGGTTG  793

Query 1037  TGCCTCTTGGGTCCATGCAAACTGTGAGTGGCTATACTTTCAGAGGCTTTATGTCACATACAAATAATTACCCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  TGCCTCTTGGGTCCATGCAAACTGTGAGTGGCTATACTTTCAGAGGCTTTATGTCACATACAAATAATTACCCT  867

Query 1111  TGTGCTTACCTCAATGCTGCATCAGCCATCGGAATGAAGATGCAGGATGTGGACCTGTTCATAAAGAGACTTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868  TGTGCTTACCTCAATGCTGCATCAGCCATCGGAATGAAGATGCAGGATGTGGACCTGTTCATAAAGAGACTTGA  941

Query 1185  CAGGTGTTTAAAGGCAGTAAGAAAAGAACGAAGTAAAGAGAGTGATGACAATTATGACAAAACTGAAGATGTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  CAGGTGTTTAAAGGCAGTAAGAAAAGAACGAAGTAAAGAGAGTGATGACAATTATGACAAAACTGAAGATGTGG  1015

Query 1259  ATATTGAAGAAATGGCTTTAAAACTAGATAATGTACTTCTTGACACATACCAGGATGCTTCTTCA  1323
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016  ATATTGAAGAAATGGCTTTAAAACTAGATAATGTACTTCTTGACACATACCAGGATGCTTCTTCA  1080