Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11949
• Subject: NM_001302946.2
• Aligned Length: 1302
• Identities: 1154
• Gaps: 147

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTGAGGTGCCTGTATCATTGGCACAGGCCAGTGCTGAACCGTAGGTGGAGTAGGCTGTGCCTTCCGAAGCA  74

Query    1  -------------ATGAAGTTGCAGTCTCCCGAATTCCAGTCACTTTTCACAGAAGGACTGAAGAGTCTGACAG  61
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTATCTATTCACAATGAAGTTGCAGTCTCCCGAATTCCAGTCACTTTTCACAGAAGGACTGAAGAGTCTGACAG  148

Query   62  AATTATTTGTCAAAGAGAATCACGAATTAAGAATAGCAGGAGGAGCAGTGAGGGATTTATTAAATGGAGTAAAG  135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AATTATTTGTCAAAGAGAATCACGAATTAAGAATAGCAGGAGGAGCAGTGAGGGATTTATTAAATGGAGTAAAG  222

Query  136  CCTCAGGATATAGATTTTGCCACCACTGCTACCCCTACTCAAATGAAGGAGATGTTTCAGTCGGCTGGGATTCG  209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCAGGATATAGATTTTGCCACCACTGCTACCCCTACTCAAATGAAGGAGATGTTTCAGTCGGCTGGGATTCG  296

Query  210  GATGATAAACAACAGAGGAGAAAAGCACGGAACAATTACTGCCAGGCTTCATGAAGAAAATTTTGAGATTACTA  283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATGATAAACAACAGAGGAGAAAAGCACGGAACAATTACTGCCAGGCTTCATGAAGAAAATTTTGAGATTACTA  370

Query  284  CACTACGGATTGATGTCACCACTGATGGAAGACATGCTGAGGTAGAATTTACAACTGACTGGCAGAAAGATGCG  357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACTACGGATTGATGTCACCACTGATGGAAGACATGCTGAGGTAGAATTTACAACTGACTGGCAGAAAGATGCG  444

Query  358  GAACGCAGAGATCTCACTATAAATTCTATGTTTTTAGGTTTTGATGGCACTTTATTTGACTACTTTAATGGTTA  431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAACGCAGAGATCTCACTATAAATTCTATGTTTTTAGGTTTTGATGGCACTTTATTTGACTACTTTAATGGTTA  518

Query  432  TGAAGATTTAAAAAATAAGAAAGTTAGATTTGTTGGACATGCTAAACAGAGAATACAAGAGGATTATCTTAGAA  505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAGATTTAAAAAATAAGAAAGTTAGATTTGTTGGACATGCTAAACAGAGAATACAAGAGGATTATCTTAGAA  592

Query  506  TTTTAAGATACTTCAGGTTTTATGGGAGAATTGTAGACAAACCTGGTGACCATGATCCTGAGACTTTGGAAGCA  579
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTTAAGATACTTCAGGTTTTATGGGAGAATTGTAGACAAACCTGGTGACCATGATCCTGAGACTTTGGAAGCA  666

Query  580  ATTGCAGAAAATGCAAAAGGCTTGGCTGGAATATCAGGAGAAAGGATTTGGGTGGAACTGAAAAAAATTCTTGT  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTGCAGAAAATGCAAAAGGCTTGGCTGGAATATCAGGAGAAAGGATTTGGGTGGAACTGAAAAAAATTCTTGT  740

Query  654  TGGTAACCATGTAAATCATTTGATTCACCTTATCTATGATCTTGATGTGGCTCCTTATATAGGTTTACCTGCTA  727
            |                                                            |||||||||||||
Sbjct  741  T------------------------------------------------------------GGTTTACCTGCTA  754

Query  728  ATGCAAGTTTAGAAGAATTTGACAAAGTCAGTAAAAATGTTGATGGTTTTTCACCAAAGCCAGTGACTCTTTTG  801
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  755  ATGCAAGTTTAGAAGAATTTGACAAAGTCAGTAAAAATGTTGATGGTTTTTCACCAAAGCCAGTGACTCTTTTG  828

Query  802  GCCTCATTATTCAAAGTACAAGATGATGTCACAAAATTGGATTTGAGGTTGAAGATCGCGAAAGAGGAGAAAAA  875
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  829  GCCTCATTATTCAAAGTACAAGATGATGTCACAAAATTGGATTTGAGGTTGAAGATCGCAAAAGAGGAGAAAAA  902

Query  876  CCTTGGCTTATTTATAGTTAAAAATAGGAAAGATTTAATTAAAGCAACAGATAGTTCAGACCCATTGAAACCCT  949
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  903  CCTTGGCTTATTTATAGTTAAAAATAGGAAAGATTTAATTAAAGCAACAGATAGTTCAGACCCATTGAAACCCT  976

Query  950  ATCAAGACTTCATTATAGATTCTAGGGAACCTGATGCAACTACTCGTGTATGTGAACTACTGAAGTACCAAGGA  1023
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  977  ATCAAGACTTCATTATAGATTCTAGGGAACCTGATGCAACTACTCGTGTATGTGAACTACTGAAGTACCAAGGA  1050

Query 1024  GAGCACTGTCTCCTAAAGGAAATGCAGCAGTGGTCCATTCCTCCATTTCCTGTAAGTGGCCATGACATCAGAAA  1097
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051  GAGCACTGTCTCCTAAAGGAAATGCAGCAGTGGTCCATTCCTCCATTTCCTGTAAGTGGCCATGACATCAGAAA  1124

Query 1098  AGTGGGCATTTCTTCAGGAAAAGAAATTGGGGCTCTATTACAACAGTTGCGAGAACAGTGGAAAAAAAGTGGTT  1171
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125  AGTGGGCATTTCTTCAGGAAAAGAAATTGGGGCTCTATTACAACAGTTGCGAGAACAGTGGAAAAAAAGTGGTT  1198

Query 1172  ACCAAATGGAAAAAGATGAACTTCTGAGTTACATAAAGAAGACC  1215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199  ACCAAATGGAAAAAGATGAACTTCTGAGTTACATAAAGAAGACC  1242