Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11952
• Subject: NM_016121.5
• Aligned Length: 2445
• Identities: 2439
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGGCGGGAGGGCACTGCGGCAGCTTCCCCGCGGCGGCGGCCGGCAGCGGCGAGATCGTCCAACTGAACGTAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGGAGGGCACTGCGGCAGCTTCCCCGCGGCGGCGGCCGGCAGCGGCGAGATCGTCCAACTGAACGTAGG  74

Query   75  GGGGACCAGATTTAGTACCTCAAGACAAACTCTTATGTGGATTCCAGATTCTTTTTTTTCCAGTTTGCTGAGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGGACCAGATTTAGTACCTCAAGACAAACTCTTATGTGGATTCCAGATTCTTTTTTTTCCAGTTTGCTGAGTG  148

Query  149  GGAGAATTTCAACACTTCGAGATGAAACTGGTGCTATATTTATTGATAGAGATCCAGCAGCATTTGCACCCATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGAGAATTTCAACACTTCGAGATGAAACTGGTGCTATATTTATTGATAGAGATCCAGCAGCATTTGCACCCATT  222

Query  223  TTAAATTTTCTTCGGACAAAAGAACTAGACTTAAGGGGAGTGAGTATTAATGTTCTCAGGCATGAAGCAGAATT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTAAATTTTCTTCGGACAAAAGAACTAGACTTAAGGGGAGTGAGTATTAATGTTCTCAGGCATGAAGCAGAATT  296

Query  297  TTACGGGATCACTCCATTAGTAAGAAGGCTTCTCTTATGTGAAGAATTGGAGCGTTCCTCTTGTGGCAGTGTCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTACGGGATCACTCCATTAGTAAGAAGGCTTCTCTTATGTGAAGAATTGGAGCGTTCCTCTTGTGGCAGTGTCC  370

Query  371  TTTTTCATGGTTACTTGCCCCCACCAGGTATTCCTAGTCGTAAAATAAACAACACAGTCAGATCTGCTGATTCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTTTCATGGTTACTTGCCCCCACCAGGTATTCCTAGTCGTAAAATAAACAACACAGTCAGATCTGCTGATTCT  444

Query  445  AGGAATGGTCTAAATTCTACAGAAGGTGAAGCCCGGGGAAATGGTACACAGCCTGTTCTCTCTGGAACGGGAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGAATGGTCTAAATTCTACAGAAGGTGAAGCCCGGGGAAATGGTACACAGCCTGTTCTCTCTGGAACGGGAGA  518

Query  519  AGAAACTGTTAGGCTAGGATTTCCTGTGGATCCACGAAAGGTGCTAATAGTAGCTGGCCATCACAACTGGATTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAACTGTTAGGCTAGGATTTCCTGTGGATCCACGAAAGGTGCTAATAGTAGCTGGCCATCACAACTGGATTG  592

Query  593  TAGCTGCATATGCCCATTTTGCTGTGTGTTACAGAATCAAAGAATCTTCAGGATGGCAGCAAGTGTTTACGAGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAGCTGCATATGCCCATTTTGCTGTGTGTTACAGAATCAAAGAATCTTCAGGATGGCAGCAAGTGTTTACGAGC  666

Query  667  CCATATTTGGATTGGACTATCGAACGAGTAGCTTTAAATGCAAAGGTGGTTGGAGGGCCACATGGAGACAAAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCATATTTGGATTGGACTATCGAACGAGTAGCTTTAAATGCAAAGGTGGTTGGAGGGCCACATGGAGACAAAGA  740

Query  741  CAAAATGGTTGCTGTTGCCTCAGAGAGTAGCATCATCTTGTGGAGTGTTCAGGATGGGGGAAGTGGAAGTGAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAAATGGTTGCTGTTGCCTCAGAGAGTAGCATCATCTTGTGGAGTGTTCAGGATGGGGGAAGTGGAAGTGAAA  814

Query  815  TTGGAGTGTTCAGCCTGGGTGTTCCTGTAGATGCTCTCTTCTTTATTGGTAACCAGTTGGTGGCCACGAGTCAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGGAGTGTTCAGCCTGGGTGTTCCTGTAGATGCTCTCTTCTTTATTGGTAACCAGTTGGTGGCCACGAGTCAT  888

Query  889  ACAGGGAAAGTGGGAGTGTGGAATGCTGTCACTCAGCACTGGCAGGTTCAAGATGTTGTTCCTATAACTAGTTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAGGGAAAGTGGGAGTGTGGAATGCTGTCACTCAGCACTGGCAGGTTCAAGATGTTGTTCCTATAACTAGTTA  962

Query  963  TGACACTGCTGGATCATTCCTTCTGCTTGGATGTAACAATGGATCAATATATTACATAGATATGCAGAAGTTCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACACTGCTGGATCATTCCTTCTGCTTGGATGTAACAATGGATCAATATATTACATAGATATGCAGAAGTTCC  1036

Query 1037  CCTTGCGAATGAAAGATAATGATCTTCTTGTAACTGAACTGTATCATGATCCTTCAAATGATGCTATTACTGCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTTGCGAATGAAAGATAATGATCTTCTTGTAACTGAACTGTATCATGATCCTTCAAATGATGCTATTACTGCT  1110

Query 1111  CTGAGTGTTTACCTCACACCCAAAACAAGTGTCAGTGGTAACTGGATCGAGATCGCCTATGGTACGAGCTCTGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGAGTGTTTACCTCACACCCAAAACAAGTGTCAGTGGTAACTGGATCGAGATCGCCTATGGTACGAGCTCTGG  1184

Query 1185  AGCAGTACGAGTGATTGTACAACACCCAGAGACAGTTGGGTCAGGTCCTCAGCTTTTTCAGACTTTCACAGTTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGCAGTACGAGTGATTGTACAACACCCAGAGACAGTTGGGTCAGGTCCTCAGCTTTTTCAGACTTTCACAGTTC  1258

Query 1259  ACCGAAGTCCCGTAACAAAAATCATGCTATCAGAGAAGCATCTTGTATCAGTCTGTGCAGATAATAATCATGTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACCGAAGTCCCGTAACAAAAATCATGCTATCAGAGAAGCATCTTGTATCAGTCTGTGCAGATAATAATCATGTC  1332

Query 1333  CGGACGTGGACAGTAACACGATTCAGAGGAATGATCTCTACTCAGCCAGGTTCTACTCCTTTAGCGTCATTCAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGGACGTGGACAGTAACACGATTCAGAGGAATGATCTCTACTCAGCCAGGTTCTACTCCTTTAGCGTCATTCAA  1406

Query 1407  GATACTATCCCTGGAGGAGACAGAAAGTCATGGTAGCTATTCCTCTGGAAATGACATAGGACCTTTTGGAGAGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GATACTATCCCTGGAGGAGACAGAAAGTCATGGTAGCTATTCCTCTGGAAATGACATAGGACCTTTTGGAGAGC  1480

Query 1481  GAGACGATCAACAGGTGTTTATCCAGAAAGTTGTTCCCATCACCAACAAACTATTTGTAAGACTCTCATCGACT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GAGACGATCAACAGGTGTTTATCCAGAAAGTTGTTCCCATCACCAACAAACTATTTGTAAGACTCTCATCGACT  1554

Query 1555  GGAAAAAGAATATGTGAGATCCAGGCTGTTGACTGTACTACAATATCCTCATTTACAGTGAGGGAATGTGAGGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGAAAAAGAATATGTGAGATCCAGGCTGTTGACTGTACTACAATATCCTCATTTACAGTGAGGGAATGTGAGGG  1628

Query 1629  ATCCAGTAGGATGGGCTCAAGACCAAGGCGCTACTTGTTCACAGGCCATACAAATGGCAGTATTCAAATGTGGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ATCCAGTAGGATGGGCTCAAGACCAAGGCGCTACTTGTTCACAGGCCATACAAATGGCAGTATTCAAATGTGGG  1702

Query 1703  ATCTGACCACTGCTATGGATATGGTTAACAAAAGTGAAGATAAG------GGTGGTCCAACCGAAGAAGAGCTA  1770
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATCTGACCACTGCTATGGATATGGTTAACAAAAGTGAAGATAAGGATGTAGGTGGTCCAACCGAAGAAGAGCTA  1776

Query 1771  CTCAAATTACTCGATCAATGTGATTTGAGCACATCTCGCTGTGCTACTCCTAACATCAGTCCAGCAACTTCCGT  1844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTCAAATTACTCGATCAATGTGATTTGAGCACATCTCGCTGTGCTACTCCTAACATCAGTCCAGCAACTTCCGT  1850

Query 1845  AGTTCAGCATAGCCACTTACGAGAATCAAATTCTAGCCTTCAGCTTCAGCACCATGATACCACCCATGAAGCAG  1918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGTTCAGCATAGCCACTTACGAGAATCAAATTCTAGCCTTCAGCTTCAGCACCATGATACCACCCATGAAGCAG  1924

Query 1919  CTACTTACGGTTCCATGAGGCCTTACAGAGAAAGTCCTTTATTAGCAAGGGCAAGAAGGACTGAGAGCTTTCAC  1992
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTACTTACGGTTCCATGAGGCCTTACAGAGAAAGTCCTTTATTAGCAAGGGCAAGAAGGACTGAGAGCTTTCAC  1998

Query 1993  AGTTATAGGGACTTCCAGACTATTAATTTGAACAGAAATGTAGAAAGAGCTGTCCCTGAAAATGGTAACTTGGG  2066
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGTTATAGGGACTTCCAGACTATTAATTTGAACAGAAATGTAGAAAGAGCTGTCCCTGAAAATGGTAACTTGGG  2072

Query 2067  TCCAATACAAGCTGAAGTGAAAGGGGCAACAGGGGAATGTAATATATCTGAGAGAAAGTCTCCTGGAGTAGAAA  2140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TCCAATACAAGCTGAAGTGAAAGGGGCAACAGGGGAATGTAATATATCTGAGAGAAAGTCTCCTGGAGTAGAAA  2146

Query 2141  TAAAAAGTTTGAGAGAATTGGATAGTGGATTGGAAGTGCATAAAATAGCTGAAGGTTTTTCAGAATCCAAGAAA  2214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TAAAAAGTTTGAGAGAATTGGATAGTGGATTGGAAGTGCATAAAATAGCTGAAGGTTTTTCAGAATCCAAGAAA  2220

Query 2215  AGGTCATCAGAAGATGAAAATGAAAATAAAATAGAGTTTAGGAAGAAAGGAGGATTTGAAGGGGGAGGATTCCT  2288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AGGTCATCAGAAGATGAAAATGAAAATAAAATAGAGTTTAGGAAGAAAGGAGGATTTGAAGGGGGAGGATTCCT  2294

Query 2289  TGGAAGAAAGAAAGTTCCCTATCTGGCGTCATCACCAAGTACTTCCGATGGAGGAACTGACTCACCTGGTACTG  2362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGGAAGAAAGAAAGTTCCCTATCTGGCGTCATCACCAAGTACTTCCGATGGAGGAACTGACTCACCTGGTACTG  2368

Query 2363  CGTCCCCATCTCCTACAAAGACTACTCCATCTCCTCGGCATAAAAAAAGTGATTCTTCAGGTCAGGAGTACAGC  2436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CGTCCCCATCTCCTACAAAGACTACTCCATCTCCTCGGCATAAAAAAAGTGATTCTTCAGGTCAGGAGTACAGC  2442

Query 2437  TTG  2439
            |||
Sbjct 2443  TTG  2445