Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11964
• Subject: XM_005254431.3
• Aligned Length: 1338
• Identities: 1200
• Gaps: 138

Alignment

Query    1  ATGATCATCCCCTCTCTAGAGGAGCTGGACTCCCTCAAGTACAGTGACCTGCAGAACTTAGCCAAGAGTCTGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATCATCCCCTCTCTAGAGGAGCTGGACTCCCTCAAGTACAGTGACCTGCAGAACTTAGCCAAGAGTCTGGG  74

Query   75  TCTCCGGGCCAACCTGAGGGCAACCAAGTTGTTAAAAGCCTTGAAAGGCTACATTAAACATGAGGCAAGAAAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTCCGGGCCAACCTGAGGGCAACCAAGTTGTTAAAAGCCTTGAAAGGCTACATTAAACATGAGGCAAGAAAAG  148

Query  149  GAAATGAGAATCAGGATGAAAGTCAAACTTCTGCATCCTCTTGTGATGAGACTGAGATACAGATCAGCAACCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAAATGAGAATCAGGATGAAAGTCAAACTTCTGCATCCTCTTGTGATGAGACTGAGATACAGATCAGCAACCAG  222

Query  223  GAAGAAGCTGAGAGACAGCCACTTGGCCATGTCACCAAAACAAGGAGAAGGTGCAAGACTGTCCGTGTGGACCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGAAGCTGAGAGACAGCCACTTGGCCATGTCACCAAAACAAGGAGAAGGTGCAAGACTGTCCGTGTGGACCC  296

Query  297  TGACTCA---CAGAATCATTCAGAGATAAAAATAAGTAATCCCACTGAATTCCAGAATCATGAAAAGCAGGAAA  367
            |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACTCACAGCAGAATCATTCAGAGATAAAAATAAGTAATCCCACTGAATTCCAGAATCATGAAAAGCAGGAAA  370

Query  368  GCCAGGATCTCAGAGCTACTGCAAAAGTTCCTTCTCCACCAGACGAGCACCAAGAAGCTGAGAATGCTGTTTCC  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCAGGATCTCAGAGCTACTGCAAAAGTTCCTTCTCCACCAGACGAGCACCAAGAAGCTGAGAATGCTGTTTCC  444

Query  442  TCA------------------GGTAACAGAGATTCAAAGGTACCTTCAGAAGGAAAGAAATCTCTCTACACAGA  497
            |||                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCAGGTAAACGTGGAATAAATGGTAACAGAGATTCAAAGGTACCTTCAGAAGGAAAGAAATCTCTCTACACAGA  518

Query  498  TGAGTCATCCAAACCTGGAAAAAATAAAAGAACTGCAATCACTACTCCAAACTTTAAGAAGCTTCATGAAGCTC  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAGTCATCCAAACCTGGAAAAAATAAAAGAACTGCAATCACTACTCCAAACTTTAAGAAGCTTCATGAAGCTC  592

Query  572  ATTTTAAGGAAATGGAGTCCATTGATCAATATATTGAGAGAAAAAAGAAACATTTTGAAGAACACAATTCCATG  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTTTAAGGAAATGGAGTCCATTGATCAATATATTGAGAGAAAAAAGAAACATTTTGAAGAACACAATTCCATG  666

Query  646  AATGAACTGAAGCAGCCCATCAATAAGGGAGGGGTCAGGACTCCAGTACCTCCAAGAGGAAGACTCTCTGTGGC  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATGAACTGAAGCAGCCCATCAATAAGGGAGGGGTCAGGACTCCAGTACCTCCAAGAGGAAGACTCTCTGTGGC  740

Query  720  TTCTACTCCCATCAGCCAACGACGCTCGCAAGGCCGGTCTTGTGGCCCTGCAAGTCAGAGTACCTTGGGTCTGA  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTCTACTCCCATCAGCCAACGACGCTCGCAAGGCCGGTCTTGTGGCCCTGCAAGTCAGAGTACCTTGGGTCTGA  814

Query  794  AGGGGTCACTCAAGCGCTCTGCTATCTCTGCAGCTAAAACGGGTGTCAGGTTTTCAGCTGCTACTAAAGATAAT  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGGGTCACTCAAGCGCTCTGCTATCTCTGCAGCTAAAACGGGTGTCAGGTTTTCAGCTGCTACTAAAGATAAT  888

Query  868  GAGCATAAGCGTTCACTGACCAAGACTCCAGCCAGAAAGTCTGCACATGTGACCGTGTCTGGGGGCACCCCAAA  941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGCATAAGCGTTCACTGACCAAGACTCCAGCCAGAAAGTCTGCACATGTGACCGTGTCTGGGGGCACCCCAAA  962

Query  942  AGGCGAGGCTGTGCTTGGGACACACAAATTAAAGACCATCACGGGGAATTCTGCTGCTGTTATTACCCCATTCA  1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct  963  AGGCGAGGCTGTGCTTGGGACACACAAATTAAAGACCATCACGGGGAATTCTGCTGCT----------------  1020

Query 1016  AGTTGACAACTGAGGCAACGCAGACTCCAGTCTCCAATAAGAAACCAGTGTTTGATCTTAAAGCAAGTTTGTCT  1089
                                                                                      
Sbjct 1021  --------------------------------------------------------------------------  1020

Query 1090  CGTCCCCTCAACTATGAACCACACAAAGGAAAGCTAAAACCATGGGGGCAATCTAAAGAAAATAATTATCTAAA  1163
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  ---------------------------GGAAAGCTAAAACCATGGGGGCAATCTAAAGAAAATAATTATCTAAA  1067

Query 1164  TCAACATGTCAACAGAATTAACTTCTACAAGAAAACTTACAAACAACCCCATCTCCAGACAAAGGAAGAGCAAC  1237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068  TCAACATGTCAACAGAATTAACTTCTACAAGAAAACTTACAAACAACCCCATCTCCAGACAAAGGAAGAGCAAC  1141

Query 1238  GGAAGAAACGCGAGCAAGAACGAAAGGAGAAGAAAGCAAAGGTTTTGGGAATGCGAAGGGGCCTCATTTTGGCT  1311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142  GGAAGAAACGCGAGCAAGAACGAAAGGAGAAGAAAGCAAAGGTTTTGGGAATGCGAAGGGGCCTCATTTTGGCT  1215

Query 1312  GAAGAT  1317
            ||||||
Sbjct 1216  GAAGAT  1221