Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11984
• Subject: XM_011245638.1
• Aligned Length: 1479
• Identities: 1230
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  ATGGCTGACTCAGAAGCACTCCCCTCCCTTGCTGGGGACCCAGTGGCTGTGGAAGCCTTGCTCCGGGCCGTGTT  74
            ||||||||||||.||.|||||....||||.|.|||||||||.|||||||||||.||||||||||.||.||||||
Sbjct    1  ATGGCTGACTCAAAACCACTCAGGACCCTGGATGGGGACCCCGTGGCTGTGGAGGCCTTGCTCCAGGACGTGTT  74

Query   75  TGGGGTTGTTGTGGATGAGGCCATTCAGAAAGGAACCAGTGTCTCCCAGAAGGTCTGTGAGTGGAAGGAGCCTG  148
            ||||.|||||||.|||||||||||||.|||.||.|||||||.|||..||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  TGGGATTGTTGTAGATGAGGCCATTCTGAAGGGGACCAGTGCCTCTGAGAAGGTCTGCGAATGGAAGGAGCCTG  148

Query  149  AGGAGCTGAAGCAGCTGCTGGATTTGGAGCTGCGGAGCCAGGGCGAGTCACAGAAGCAGATCCTGGAGCGGTGT  222
            |.||.||.||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|.|.||||||||||||||||.||.
Sbjct  149  AAGAACTCAAGCAGCTGCTGGACTTGGAGCTGCAGAGCCAGGGCGAGTCCCGGGAGCAGATCCTGGAGCGCTGC  222

Query  223  CGGGCTGTGATTCGCTACAGTGTCAAGACTGGTCACCCTCGGTTCTTCAACCAGCTCTTCTCTGGGTTGGATCC  296
            |||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  223  CGGACTGTGATTCACTACAGTGTCAAGACTGGTCACCCCCGGTTCTTCAACCAGCTCTTCTCAGGGTTAGATCC  296

Query  297  CCATGCTCTGGCCGGGCGCATTATCACTGAGAGCCTCAACACCAGCCAGTACACATATGAAATCGCCCCCGTGT  370
            ||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  297  CCATGCTCTGGCTGGGCGCATCATCACGGAGAGCCTCAACACTAGCCAGTACACATATGAGATTGCCCCCGTGT  370

Query  371  TTGTGCTCATGGAAGAGGAGGTGCTGAGGAAACTGCGGGCCCTGGTGGGCTGGAGCTCTGGGGACGGAATCTTC  444
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||.||..|||||
Sbjct  371  TTGTGCTCATGGAAGAGGAGGTGCTGAAGAAACTCCGTGCCCTGGTGGGCTGGAACTCTGGGGATGGGGTCTTC  444

Query  445  TGCCCTGGTGGCTCCATCTCCAACATGTATGCTGTAAATCTGGCCCGCTATCAGCGCTACCCGGATTGCAAGCA  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||..|.||.||||||||||.||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  445  TGTCCTGGTGGCTCCATCTCCAACATGTACGCCATGAACCTGGCCCGCTTTCAGCGCTACCCAGACTGCAAGCA  518

Query  519  GAGGGGCCTCCGCACACTGCCGCCCCTGGCCCTATTCACATCGAAGGAGTGTCACTACTCCATCCAGAAGGGAG  592
            ||||||||||||..|.|||||||||.||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||...|||||||
Sbjct  519  GAGGGGCCTCCGGGCCCTGCCGCCCTTGGCTCTCTTCACTTCAAAGGAGTGTCACTACTCCATCACCAAGGGAG  592

Query  593  CTGCGTTTCTGGGACTTGGCACCGACAGTGTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAAAATGGTCCCCGAG  666
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||.||||.|||
Sbjct  593  CTGCTTTTCTGGGACTTGGCACCGACAGTGTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAGGATGATCCCTGAG  666

Query  667  GATCTGGAGAGGCAGATTGGTATGGCCGAGGCTGAGGGTGCTGTGCCGTTCCTGGTCAGTGCCACCTCTGGCAC  740
            ||.||||||||||||||...|.||||.|||||||||||..|||||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  GACCTGGAGAGGCAGATCATTCTGGCAGAGGCTGAGGGCTCTGTGCCATTTCTGGTCAGTGCCACCTCTGGTAC  740

Query  741  CACTGTGCTAGGGGCCTTTGACCCCCTGGAGGCAATTGCTGATGTGTGCCAGCGTCATGGGCTATGGCTGCATG  814
            |||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.|||.|.||||
Sbjct  741  CACCGTGCTAGGGGCCTTTGACCCCCTGGATGCAATTGCCGATGTTTGCCAGCGACACGGACTGTGGTTCCATG  814

Query  815  TGGATGCTGCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCACAGACACACAGGCATCTCCTGGATGGGATCCAGAGGGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGATGCTGCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCTCGGACACACAGGCATCTCCTGGATGGGATCCAGAGGGCT  888

Query  889  GACTCTGTGGCCTGGAATCCCCACAAGCTCCTCGCAGCAGGCCTGCAATGCTCTGCACTTCTTCTCCAGGATAC  962
            |||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||.|||.||
Sbjct  889  GACTCTGTGGCCTGGAACCCTCACAAGCTTCTCGCCGCAGGGCTGCAGTGCTCCGCTCTTCTTCTCCGGGACAC  962

Query  963  CTCGAACCTGCTCAAGCGCTGCCATGGGTCCCAGGCCAGCTACCTTTTCCAGCAGGACAAGTTCTACGATGTGG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTCGAACCTGCTCAAGCGCTGCCATGGATCCCAGGCCAGCTACCTCTTCCAGCAAGACAAGTTCTACGATGTGG  1036

Query 1037  CTCTGGACACGGGAGACAAGGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGTGTGGACTGTCTGAAGCTGTGGCTCATGTGGAAG  1110
            ||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCTGGACACCGGAGACAAAGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGCGTGGACTGTCTGAAGCTATGGCTCATGTGGAAG  1110

Query 1111  GCACAGGGCGATCAAGGGCTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGTCCTTGCCCGGTACCTGGTGGAGGAAAT  1184
            ||||||||.|..||.|||.|||||||||||||||||||||||||||..||..||||||||.||||||||||.||
Sbjct 1111  GCACAGGGTGGGCAGGGGTTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGCTCTCACCCGGTACTTGGTGGAGGAGAT  1184

Query 1185  GAAGAAGCGGGAAGGGTTTGAGCTAGTCATGGAGCCTGAGTTTGTCAATGTGTGTTTCTGGTTCGTACCCCCCA  1258
            .||.|||||||||||.||||||.|.||.||||                                          
Sbjct 1185  TAAAAAGCGGGAAGGATTTGAGTTGGTAATGG------------------------------------------  1216

Query 1259  GCCTGCGAGGGAAGCAGGAGAGTCCAGATTACCACGAAAGGCTGTCAAAGGTGGCCCCCGTGCTCAAGGAGCGC  1332
                                                            ||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1217  ------------------------------------------------AGGTGGCCCCTGTGCTCAAGGAGCGC  1242

Query 1333  ATGGTGAAGGAGGGCTCCATGATGATTGGCTACCAGCCCCACGGGACCCGGGGCAACTTCTTCCGTGTGGTTGT  1406
            |||||||||.||||..|||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||..||||.||
Sbjct 1243  ATGGTGAAGAAGGGGACCATGATGATTGGCTACCAGCCCCATGGGACCCGGGCCAACTTCTTCCGAATGGTGGT  1316

Query 1407  GGCCAACTCTGCACTGACCTGTGCTGATATGGACTTCCTCCTCAACGAGCTGGAGCGGCTAGGCCAGGACCTG  1479
            |||||||.|...||||.||...||.|||||.||.|||||.||...|||||||||||..||.||||||||||||
Sbjct 1317  GGCCAACCCCATACTGGCCCAGGCCGATATAGATTTCCTTCTGGGCGAGCTGGAGCTCCTGGGCCAGGACCTG  1389