Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12029
- Subject:
- NM_001348241.1
- Aligned Length:
- 1146
- Identities:
- 938
- Gaps:
- 207
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGGGAAGGTGACGCCTTCTGGGCCCCATCTGTCCTTCCTCACAGCACCCTCAGCACCTTAAGCCACCACCC 74
Query 1 ----------------------ATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCCGCC 52
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAGCCACAATTTGGCAGAAGGATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCCGCC 148
Query 53 TGCTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAGGAG 126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGCTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAGGAG 222
Query 127 AGTGGTGCAAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGACGC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGTGGTGCAAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGACGC 296
Query 201 CATCTTCAAGGCCTTTGCCATGATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCCCTG 274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATCTTCAAGGCCTTTGCCATGATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCCCTG 370
Query 275 CCACCAGCAAGCCCCCAGTGACGCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGCGGGTCCCTGATCGGCAAAGGA 348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCACCAGCAAGCCCCCAGTGACGCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGTGGGTCCCTGATCGGCAAAGGA 444
Query 349 GGCTCCAAGATCAAGGAGATCAGGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAACTC 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCTCCAAGATCAAGGAGATCAGGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAACTC 518
Query 423 CACGGAGCGAGCGGTGACCATCTCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGGTCA 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CACGGAGCGAGCGGTGACCATCTCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGGTCA 592
Query 497 TGCTGGAG------------------------------------------------------------------ 504
||||||||
Sbjct 593 TGCTGGAGGATGTGCTTGTAGCAGGGACGTGCGAGAGGAGGGAGCTCTGCACTGAGGAAGGATGCATGGCCCGA 666
Query 505 ------------------------------------------GCCTACACAATCCAGGGACAGTATGCCATCCC 536
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGACCGGGCGTCTGTGCCGCTGTGTCCGGACCTCCGTCTGCTGCCTACACAATCCAGGGACAGTATGCCATCCC 740
Query 537 TCACCCGGAT---TTGACCAAGCTCCACCAGTTGGCCATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCA 607
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCACCCGGATCAGTTGACCAAGCTCCACCAGTTGGCCATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCA 814
Query 608 ACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTACACTCCTCCGAAGAAGCTCAAAATCTGATGGGCCAGTCATCA 681
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTACACTCCTCCGAAGAAGCTCAAAATCTGATGGGCCAGTCATCA 888
Query 682 GGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAGCTCACCATTCCCAATGATCTAATAGGCTGCATAATTGG 755
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAGCTCACCATTCCCAATGATCTAATAGGCTGCATAATTGG 962
Query 756 ACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCGACAGATGTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAACGCCACGGAAG 829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCGACAGATGTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAACGCCACGGAAG 1036
Query 830 GGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGGGGACCCCGGCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCC 903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGGGGACCCCGGCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCC 1110
Query 904 AGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGGGCACGCTG 939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGGGCACGCTG 1146