Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12029
• Subject: XM_024452093.1
• Aligned Length: 1404
• Identities: 938
• Gaps: 465

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGGGAAGTTCCCAGGTCCCCCTTCAGTGAGGTCTTCCTGATGGATGCTGATATGGTCTGGCTGTGTCCCCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCCAAATCTCATCTTGAATTGTAGCTCCCACAATTCCTACAGGTCATGGGAGGGACTCAGTGGGAGCATCTCAT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CTTGTCTAAACGGGGAGAGTGGCCATCTGTCCGATACCCACATCAAACCTGATCGTTCCCAGCCTCACAGAGCT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GCTTTGTTCCAAGGTGACGCCTTCTGGGCCCCATCTGTCCTTCCTCACAGCACCCTCAGCACCTTAAGCCACCA  296

Query    1  -------------------------ATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCC  49
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCTCAGCCACAATTTGGCAGAAGGATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCC  370

Query   50  GCCTGCTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAG  123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCTGCTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAG  444

Query  124  GAGAGTGGTGCAAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGA  197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGAGTGGTGCAAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGA  518

Query  198  CGCCATCTTCAAGGCCTTTGCCATGATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCC  271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGCCATCTTCAAGGCCTTTGCCATGATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCC  592

Query  272  CTGCCACCAGCAAGCCCCCAGTGACGCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGCGGGTCCCTGATCGGCAAA  345
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGCCACCAGCAAGCCCCCAGTGACGCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGTGGGTCCCTGATCGGCAAA  666

Query  346  GGAGGCTCCAAGATCAAGGAGATCAGGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAA  419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGAGGCTCCAAGATCAAGGAGATCAGGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAA  740

Query  420  CTCCACGGAGCGAGCGGTGACCATCTCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGG  493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCCACGGAGCGAGCGGTGACCATCTCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGG  814

Query  494  TCATGCTGGAG---------------------------------------------------------------  504
            |||||||||||                                                               
Sbjct  815  TCATGCTGGAGTCCCCACCGAAAGGTGCCACCATTCCCTACCGCCCAAAGCCCGCCTCCACCCCTGTCATTTTT  888

Query  505  --------------------------------------------------------------------------  504
                                                                                      
Sbjct  889  GCAGGTGGTCAGGTAAGAGCCGATCCGCTCGCGGCCTCCACTGCCAACCTCAGCCTTTTACTGCAGCACCCGCC  962

Query  505  -------GCCTACACAATCCAGGGACAGTATGCCATCCCTCACCCGGATTTGACCAAGCTCCACCAGTTGGCCA  571
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTGCCCGCCTACACAATCCAGGGACAGTATGCCATCCCTCACCCGGATTTGACCAAGCTCCACCAGTTGGCCA  1036

Query  572  TGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTACACTCC  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTACACTCC  1110

Query  646  TCCGAAGAAGCTCAAAATCTGATGGGCCAGTCATCAGGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAGCT  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCCGAAGAAGCTCAAAATCTGATGGGCCAGTCATCAGGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAGCT  1184

Query  720  CACCATTCCCAATGATCTAATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCGACAGATGT  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CACCATTCCCAATGATCTAATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCGACAGATGT  1258

Query  794  CTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGGGGACCCCG  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGGGGACCCCG  1332

Query  868  GCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGGGCACGCTG  939
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGGGCACGCTG  1404